ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| TFCP2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TFCP2、LBP1C、LSF、LSF1D、SEF、TFCP2C、転写因子CP2 |
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| 外部ID | オミム:189889; MGI : 98509;ホモロジーン: 4134;ジーンカード:TFCP2; OMA :TFCP2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 15番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 15 F1|15 56.33 cM | 始める | 100,395,893 bp [2] |
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| 終わり | 100,449,889 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 副鼻腔粘膜
- 浅側頭動脈
- 心室帯
- 単球
- 神経節隆起
- 顆粒球
- 直腸
- 腓腹筋
- 生殖腺
- ランゲルハンス島
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| | 上位の表現 | - 網膜の神経層
- 松果体
- 性器結節
- 胚の尾
- 心室帯
- 嗅周皮質
- 腎小体
- 嗅内皮質
- 右腎臓
- 神経管
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | 
 | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合転写因子活性
- DNA結合
- タンパク質C末端結合
- タンパク質結合
- 配列特異的DNA結合
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- シス調節領域配列特異的DNA結合
- 転写因子結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 転写の制御、DNAテンプレート
- 転写、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- RNAポリメラーゼIIによるmRNA転写
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_005653 NM_001173452 NM_001173453 |
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NM_001289603 NM_033476 NM_001355497 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001166923 NP_001166924 NP_005644 |
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NP_001276532 NP_258437 NP_001342426 |
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| 場所(UCSC) | 12章: 51.09 – 51.17 Mb | 15章: 100.4 – 100.45 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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αグロビン転写因子CP2は、ヒトではTFCP2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
TFCP2は後期SV40因子(LSF )とも呼ばれ、よく知られた癌遺伝子AEG-1によって誘導されます。[7] LSFは肝細胞癌においても癌遺伝子として作用します。[8] LSFはマトリックスメタロプロテアーゼ9(MMP9 )の転写をアップレギュレーションすることで血管新生を促進します。[9]
肝細胞癌(HCC)における主要な癌遺伝子としての機能に加え、化学療法抵抗性、上皮間葉転換(EMT)、アレルギー反応、炎症、アルツハイマー病において多面的な役割を果たしている。[8] [10]小分子FQI1(因子キノリノン阻害剤1)は、LSFがHCC DNAと結合するのを防ぎ、HCC細胞死をもたらす。[8] [10] [11]
相互作用
TFCP2はAPBB1 [12]およびRNF2 [13]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000135457 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000009733 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Swendeman SL, Spielholz C, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Sheffery M (1994年4月). 「α-グロビン転写因子CP2のゲノム構造、染色体局在、プロモーター、および発達段階における発現の特徴づけ」. The Journal of Biological Chemistry . 269 (15): 11663–71 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)78176-9 . PMID 8157699.
- ^ 「Entrez Gene: TFCP2転写因子CP2」。
- ^ Yoo BK, Gredler R, Vozhilla N, Su ZZ, Chen D, Forcier T, Shah K, Saxena U, Hansen U, Fisher PB, Sarkar D (2009年8月). 「5-フルオロウラシル耐性を付与する遺伝子の同定」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 106 (31): 12938–43 . Bibcode :2009PNAS..10612938Y. doi : 10.1073/pnas.0901451106 . PMC 2722317. PMID 19622726 .
- ^ abc Yoo BK, Emdad L, Gredler R, Fuller C, Dumur CI, Jones KH, Jackson-Cook C, Su ZZ, Chen D, Saxena UH, Hansen U, Fisher PB, Sarkar D (2010年5月). 「転写因子後期SV40因子(LSF)は肝細胞癌におけるがん遺伝子として機能する」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 (18): 8357–62 . Bibcode :2010PNAS..107.8357Y. doi : 10.1073/pnas.1000374107 . PMC 2889542. PMID 20404171 .
- ^ Santhekadur PK, Gredler R, Chen D, Siddiq A, Shen XN, Das SK, Emdad L, Fisher PB, Sarkar D (2012年1月). 「後期SV40因子(LSF)はマトリックスメタロプロテアーゼ-9(MMP-9)の転写をアップレギュレーションすることで血管新生を促進する」. The Journal of Biological Chemistry . 287 (5): 3425–32 . doi : 10.1074/jbc.M111.298976 . PMC 3270996. PMID 22167195 .
- ^ ab サンテカドゥル PK、ラジャセカラン D、シディク A、グレドラー R、チェン D、シャウス SC、ハンセン U、フィッシャー PB、サーカール D (2012)。 「転写因子 LSF: 肝細胞癌の新規癌遺伝子」(PDF)。J 癌研究所です。2 ( 3) : 269–285。PMC 3365805 。PMID 22679558。
- ^ Grant TJ, Bishop JA, Christadore LM, Barot G, Chin HG, Woodson S, Kavouris J, Siddiq A, Gredler R, Shen XN, Sherman J, Meehan T, Fitzgerald K, Pradhan S, Briggs LA, Andrews WH, Sarkar D, Schaus SE, Hansen U (2012年3月). 「転写因子LSFに対する抗増殖性小分子阻害剤は、肝細胞癌におけるLSFへの癌遺伝子依存を明らかにする」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 109 (12): 4503–8 . Bibcode :2012PNAS..109.4503G. doi : 10.1073/pnas.1121601109 . PMC 3311344 . PMID 22396589。
- ^ Zambrano N, Minopoli G, de Candia P, Russo T (1998年8月). 「Fe65アダプタータンパク質はPID1ドメインを介して転写因子CP2/LSF/LBP1と相互作用する」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (32): 20128–33 . doi : 10.1074/jbc.273.32.20128 . PMID 9685356.
- ^ Tuckfield A, Clouston DR, Wilanowski TM, Zhao LL, Cunningham JM, Jane SM (2002年3月). 「RINGポリコームタンパク質と、グレインヘッド様ファミリーの発達転写因子との複合体における特定の標的遺伝子への結合」. Molecular and Cellular Biology . 22 (6): 1936– 46. doi :10.1128/MCB.22.6.1936-1946.2002. PMC 135618. PMID 11865070 .
さらに読む
- Lim LC, Swendeman SL, Sheffery M (1992年2月). 「α-グロビン転写因子CP2の分子クローニング」. Molecular and Cellular Biology . 12 (2): 828–35 . doi :10.1128/mcb.12.2.828. PMC 364316. PMID 1732747 .
- Jane SM, Nienhuis AW, Cunningham JM (1995年1月). 「ヒトおよびニワトリにおけるヘモグロビンスイッチは、普遍的な転写因子CP2と発生特異的なタンパク質とのヘテロ多量体複合体によって媒介される」. The EMBO Journal . 14 (1): 97– 105. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb06979.x. PMC 398056. PMID 7828600 .
- Shirra MK, Zhu Q, Huang HC, Pallas D, Hansen U (1994年8月). 「ヒトLSF遺伝子の1つのエクソンには、新規DNA結合および二量体形成モチーフに関与する保存領域が含まれている」. Molecular and Cellular Biology . 14 (8): 5076–87 . doi :10.1128/mcb.14.8.5076. PMC 359026. PMID 8035790 .
- Yoon JB, Li G, Roeder RG (1994年3月). 「in vitroでヒト免疫不全ウイルス1型の転写を調節する関連細胞転写因子ファミリーの特性解析」. Molecular and Cellular Biology . 14 (3): 1776–85 . doi :10.1128/mcb.14.3.1776. PMC 358535. PMID 8114710 .
- Margolis DM, Somasundaran M, Green MR (1994年2月). 「ヒト転写因子YY1はヒト免疫不全ウイルス1型の転写とウイルス粒子産生を抑制する」. Journal of Virology . 68 (2): 905–10 . doi :10.1128/JVI.68.2.905-910.1994. PMC 236527. PMID 8289393 .
- Cunningham JM, Vanin EF, Tran N, Valentine M, Jane SM (1995年11月). 「ヒト転写因子CP2(TFCP2)はヒトγ-グロビンステージセレクタータンパク質の構成要素であり、染色体12q13にマッピングされ、NF-E2遺伝子から250 kb以内に位置する」. Genomics . 30 (2): 398–9 . PMID 8586452.
- Romerio F, Gabriel MN, Margolis DM (1997年12月). 「ヒト因子YY1とLSFの新たな連携によるヒト免疫不全ウイルス1型の抑制」. Journal of Virology . 71 (12): 9375–82 . doi :10.1128/JVI.71.12.9375-9382.1997. PMC 230241. PMID 9371597 .
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- He G, Margolis DM (2002年5月). 「ヒト免疫不全ウイルス1型(HIV-1)の組み込みプロモーターにおけるクロマチン脱アセチル化およびヒストン脱アセチル化酵素の占有に対する、HIV-1リプレッサーYY1とHIV-1アクチベーターTatによる逆制御」. Molecular and Cellular Biology . 22 (9): 2965–73 . doi :10.1128/MCB.22.9.2965-2973.2002. PMC 133763. PMID 11940654 .
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