TGIF2

TGIF2
識別子
エイリアス	TGIF2、TGFB誘導因子ホメオボックス2
外部ID	オミム：607294; MGI : 1915299;ホモロジーン: 32514;ジーンカード：TGIF2; OMA :TGIF2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 20番染色体（ヒト）[1] バンド 20q11.23 始める 36,573,488 bp [1] 終わり 36,593,950 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体2（マウス）[2] バンド 2|2 H1 始める 156,681,927 bp [2] 終わり 156,697,490 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 心室帯 胚 神経節隆起 腓骨神経 生殖腺 口腔粘膜細胞 顆粒球 右卵管 睾丸 単球 上位の表現 心室帯 接合子 指の指骨 胚葉上層 胚の尾 性器結節 胚 親指 下顎突出 上顎突出 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合転写因子活性 DNA結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 核 核質 生物学的プロセス 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 カメラ型眼における網膜の発達 胚葉形成の調節 ニューロン分化の正の調節 結節シグナル伝達経路 転写、DNAテンプレート 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 60436 228839 アンサンブル ENSG00000118707 ENSMUSG00000062175 ユニプロット Q9GZN2 Q8C0Y1 RefSeq (mRNA) NM_021809 NM_001199513 NM_001199514 NM_001199515 NM_001291124 NM_173396 RefSeq（タンパク質） NP_001186442 NP_001186443 NP_001186444 NP_068581 NP_001278053 NP_775572 場所（UCSC） 20章: 36.57 – 36.59 MB 2番目の文字: 156.68 – 156.7 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ホメオボックスタンパク質TGIF2は、ヒトではTGIF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、DNA結合ホメオボックスタンパク質であり、転写抑制因子でもある。コードされるタンパク質は、TGFβ応答性遺伝子にヒストン脱アセチル化酵素をリクルートすることで転写を抑制すると考えられる。この遺伝子は一部の卵巣癌において増幅・過剰発現しており、この遺伝子の変異は全前脳胞症を引き起こす可能性がある。^[6]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000118707 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000062175 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Imoto I, Pimkhaokham A, Watanabe T, Saito-Ohara F, Soeda E, Inazawa J (2000年10月). 「卵巣癌細胞株におけるTALEスーパークラスの新規ホメオボックス遺伝子TGIF2の増幅および過剰発現」. Biochem Biophys Res Commun . 276 (1): 264–70 . doi :10.1006/bbrc.2000.3449. PMID  11006116.
6. 「Entrez Gene: TGIF2 TGFB誘導因子ホメオボックス2」。

さらに読む

• Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, et al. (1996). 「改良されたショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」Anal. Biochem . 236 (1): 107–13 . doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). 「大規模連結cDNAシークエンシング」Genome Res . 7 (4): 353–8 . doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC  139146 . PMID  9110174.
• Melhuish TA, Gallo CM, Wotton D (2001). 「TGIF2はヒストン脱アセチル化酵素1と相互作用し、転写を抑制する」J. Biol. Chem . 276 (34): 32109–14 . doi : 10.1074/jbc.M103377200 . PMID  11427533.
• Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). 「ヒト20番染色体のDNA配列と比較解析」. Nature . 414 (6866): 865–71 . Bibcode :2001Natur.414..865D. doi : 10.1038/414865a . PMID  11780052.
• 渡辺 剛志、井本 郁、片平 剛志、他 (2003). 「卵巣癌における20番染色体長腕部増幅の推定標的として特異的に制御される遺伝子」. Jpn. J. Cancer Res . 93 (10): 1114–22 . doi :10.1111/j.1349-7006.2002.tb01213.x. PMC  5926887. PMID 12417041  .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）の現状、品質、そして拡大」Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928.  PMID 15489334  .
• 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129.  PMID 16344560  .