TNIP1
ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
TNIP1
識別子
エイリアスTNIP1、ABIN-1、NAF1、VAN、nip40-1、TNFAIP3 相互作用タンパク質 1
外部IDオミム：607714; MGI : 1926194;ホモロジーン: 31355;ジーンカード：TNIP1; OMA :TNIP1 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

10318

57783

アンサンブル

ENSG00000145901

ENSMUSG00000020400

ユニプロット

Q15025

Q9WUU8

RefSeq (mRNA)

NM_001199275
NM_001199276
NM_001271455
NM_001271456
NM_021327

RefSeq（タンパク質）

NP_001186204
NP_001186205
NP_001258384
NP_001258385
NP_067302

場所（UCSC）5章: 151.03 – 151.09 MB11章: 54.8 – 54.85 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

TNFAIP3相互作用タンパク質1（ ABIN-1とも呼ばれる）は、ヒトではTNIP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]

自己免疫疾患との関連

TNIP1遺伝子領域内の遺伝的変異は、いくつかの自己免疫疾患と関連していることが示されています。

TNIP1の機能不全または欠損は過剰炎症に寄与し、健康な細胞を、本来は無害なTLRリガンドへの曝露に対する炎症反応に対して感受性にする可能性があります。[15]

神経変性疾患との関連

最近のゲノムワイド関連研究（GWAS）では、TNIP1の遺伝子変異が晩発性散発性アルツハイマー病（LOAD）と関連していることが明らかになった。[16]

相互作用

TNIP1にはリン酸化およびユビキチン化される複数のアミノ酸部位が含まれており、[17] TNFAIP3、[18] MAP3K1、[19]およびMAPK1と相互作用することが示されている。[20]

規制

TNIP1はBCL3によって制御される転写モジュールの一部であることが示された。BCL3遺伝子はAPOE誘導後にAβ42と強く関連し、LOAD患者の脳内でアップレギュレーションされていることが明らかになった。[16]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000145901 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020400 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Fukushi M, Dixon J, Kimura T, Tsurutani N, Dixon MJ, Yamamoto N (1999年1月). 「細胞表面CD4発現を増加させる新規細胞タンパク質Naf1（Nef関連因子1）の同定とクローニング」. FEBS Letters . 442 (1): 83– 88. doi : 10.1016/S0014-5793(98)01631-7 . PMID  9923610. S2CID  86298611.
  6. ^ Gupta K, Ott D, Hope TJ, Siliciano RF, Boeke JD (2000年12月). 「ヒト免疫不全ウイルス1型マトリックスと相互作用するヒト核シャトルタンパク質はビリオンにパッケージングされる」. Journal of Virology . 74 (24): 11811– 11824. doi :10.1128/JVI.74.24.11811-11824.2000. PMC 112464. PMID  11090181 . 
  7. ^ 「Entrez Gene: TNIP1 TNFAIP3 相互作用タンパク質 1」。
  8. ^ Allanore Y, Saad M, Dieudé P, Avouac J, Distler JH, Amouyel P, et al. (2011年7月). 「ゲノムワイドスキャンにより、全身性硬化症の新たなリスク遺伝子座としてTNIP1、PSORS1C1、RHOBが同定された」. PLOS Genetics . 7 (7) e1002091. doi : 10.1371/journal.pgen.1002091 . PMC 3131285. PMID  21750679 . 
  9. ^ Nair RP, Duffin KC, Helms C, Ding J, Stuart PE, Goldgar D, et al. (2009年2月). 「ゲノムワイドスキャンにより乾癬とIL-23およびNF-κB経路の関連性が明らかに」Nature Genetics . 41 (2): 199– 204. doi :10.1038/ng.311. PMC 2745122 . PMID  19169254. 
  10. ^ Bowes J, Orozco G, Flynn E, Ho P, Brier R, Marzo-Ortega H, et al. (2011年9月). 「乾癬性関節炎の感受性遺伝子座としてのTNIP1およびIL23Aの確認」Annals of the Rheumatic Diseases . 70 (9): 1641– 1644. doi :10.1136/ard.2011.150102. PMC 3147229. PMID 21623003  . 
  11. ^ Gateva V, Sandling JK, Hom G, Taylor KE, Chung SA, Sun X, 他 (2009年11月). 「大規模複製研究により、全身性エリテマトーデスのリスク遺伝子座としてTNIP1、PRDM1、JAZF1、UHRF1BP1、IL10が同定された」Nature Genetics . 41 (11): 1228– 1233. doi :10.1038/ng.468. PMC 2925843. PMID 19838195  . 
  12. ^ Han JW, Zheng HF, Cui Y, Sun LD, Ye DQ, Hu Z, 他 (2009年11月). 「中国漢民族集団におけるゲノムワイド関連研究により、全身性エリテマトーデスの新たな感受性遺伝子座が9つ同定された」Nature Genetics . 41 (11): 1234– 1237. doi :10.1038/ng.472. PMID  19838193. S2CID  205356205.
  13. ^ Oka S, Higuchi T, Furukawa H, Nakamura M, Komori A, Abiru S, et al. (2018年6月). 「日本人におけるTNIP1遺伝子の一塩基多型と1型自己免疫性肝炎の関連性」. Journal of Human Genetics . 63 (6): 739– 744. doi :10.1038/s10038-018-0440-0. PMID  29559739. S2CID  4477603.
  14. ^ Brady MP, Korte EA, Caster DJ, Powell DW (2020年10月). 「TNIP1/ABIN1とループス腎炎：レビュー」. Lupus Science & Medicine . 7 (1) e000437. doi :10.1136/lupus-2020-000437. PMC 7597513. PMID 33122334  . 
  15. ^ Shamilov R, Aneskievich BJ (2018-10-03). 「自己免疫疾患におけるTNIP1：Toll様受容体シグナル伝達の制御」. Journal of Immunology Research . 2018 3491269. doi : 10.1155/2018/3491269 . PMC 6192141. PMID  30402506 . 
  16. ^ ab Wightman DP, Jansen IE, Savage JE, Shadrin AA, Bahrami S, Holland D, et al. (2021年9月). 「1,126,563人を対象としたゲノムワイド関連研究でアルツハイマー病の新たなリスク遺伝子座が特定される」. Nature Genetics . 53 (9): 1276– 1282. doi :10.1038/s41588-021-00921-z. hdl : 1871.1/61f01aa9-6dc7-4213-be2a-d3fe622db488 . ISSN  1061-4036. PMC 10243600 . PMID  34493870。S2CID 237442349  。 
  17. ^ “TNIP1 (ヒト)”. www.phosphosite.org . 2020年10月31日閲覧。
  18. ^ Heyninck K, De Valck D, Vanden Berghe W, Van Criekinge W, Contreras R, Fiers W, et al. (1999年6月). 「ジンクフィンガータンパク質A20は、RIPまたはTRAF2を介したトランス活性化シグナルを阻害することで、TNF誘導性NF-κB依存性遺伝子発現を阻害し、新規NF-κB阻害タンパク質ABINに直接結合する」. The Journal of Cell Biology . 145 (7): 1471– 1482. doi :10.1083/jcb.145.7.1471. PMC 2133159. PMID 10385526  . 
  19. ^ Charlaftis N, Suddason T, Wu X, Anwar S, Karin M, Gallagher E (2014年11月). 「MEKK1 PHDはTAB1をユビキチン化し、サイトカインに反応してMAPKを活性化する」. The EMBO Journal . 33 (21): 2581– 2596. doi :10.15252/embj.201488351. PMC 4282369. PMID 25260751  . 
  20. ^ Zhang S, Fukushi M, Hashimoto S, Gao C, Huang L, Fukuyo Y, et al. (2002年9月). 「新規ERK2結合タンパク質Naf1はEGF/ERK2の核内シグナル伝達を減弱させる」.生化学および生物物理学的研究通信. 297 (1): 17– 23. doi :10.1016/S0006-291X(02)02086-7. PMID  12220502.

さらに読む

  • 中島 D、岡崎 N、山川 H、菊野 R、大原 O、長瀬 T (2002 年 6 月)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA 研究。9 (3): 99–106。CiteSeerX  10.1.1.500.923。土井：10.1093/dnares/9.3.99。PMID  12168954。
  • 長瀬 剛志、宮島 暢、田中 明、佐塚 剛志、関 暢、佐藤 誠、他 (1995). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. III. ヒト細胞株KG-1由来のcDNAクローン解析により推定された40個の新規遺伝子（KIAA0081-KIAA0120）のコード配列」. DNA Research . 2 (1): 37– 43. doi : 10.1093/dnares/2.1.37 . PMID  7788527.
  • Loftus SK, Dixon J, Koprivnikar K, Dixon MJ, Wasmuth JJ (1996年1月). 「Treacher Collins候補遺伝子領域の転写マップ」. Genome Research . 6 (1): 26– 34. doi : 10.1101/gr.6.1.26 . PMID  8681136.
  • Jäkel S, Görlich D (1998年8月). 「インポーチンβ、トランスポーター、RanBP5、およびRanBP7は哺乳類細胞におけるリボソームタンパク質の核内輸送を媒介する」. The EMBO Journal . 17 (15): 4491– 4502. doi :10.1093/emboj/17.15.4491. PMC  1170780. PMID  9687515 .
  • Heyninck K, De Valck D, Vanden Berghe W, Van Criekinge W, Contreras R, Fiers W, et al. (1999年6月). 「ジンクフィンガータンパク質A20は、RIPまたはTRAF2を介したトランス活性化シグナルを阻害することで、TNF誘導性NF-κB依存性遺伝子発現を阻害し、新規NF-κB阻害タンパク質ABINに直接結合する」. The Journal of Cell Biology . 145 (7): 1471– 1482. doi :10.1083/jcb.145.7.1471. PMC  2133159. PMID  10385526 .
  • Zhang S, Fukushi M, Hashimoto S, Gao C, Huang L, Fukuyo Y, et al. (2002年9月). 「新規ERK2結合タンパク質Naf1はEGF/ERK2核シグナル伝達を減弱させる」.生化学および生物物理学的研究通信. 297 (1): 17– 23. doi :10.1016/S0006-291X(02)02086-7. PMID  12220502.
  • Leonard D, Ajuh P, Lamond AI, Legerski RJ (2003年9月). 「hLodestar/HuF2はCDC5Lと相互作用し、pre-mRNAスプライシングに関与する」.生化学および生物理学的研究通信. 308 (4): 793– 801. CiteSeerX  10.1.1.539.8359 . doi :10.1016/S0006-291X(03)01486-4. PMID  12927788.
  • Gallagher J, Howlin J, McCarthy C, Murphy EP, Bresnihan B, FitzGerald O, et al. (2003年9月). 「オリゴヌクレオチドマイクロアレイを用いたヒト滑膜細胞におけるTNF-α誘導発現遺伝子群におけるNaf1/ABIN-1の同定」. FEBS Letters . 551 ( 1–3 ): 8–12 . doi :10.1016/S0014-5793(03)00823-8. PMID  12965196. S2CID  2796577.
  • Favre M, Butticaz C, Stevenson B, Jongeneel CV, Telenti A (2003年10月). 「HIV-1ライフサイクルに関与するヒト遺伝子における高頻度の選択的スプライシング：TSG101、betaTrCP、PPIA、INI1、NAF1、PMLを用いたモデル」Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes . 34 (2): 127– 133. doi : 10.1097/00126334-200310010-00002 . PMID  14526201.
  • Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, et al. (2004年2月). 「ヒトTNF-α/NF-κBシグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」. Nature Cell Biology . 6 (2): 97– 105. doi :10.1038/ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
  • Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, et al. (2004年7月). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」. Genome Research . 14 (7): 1324– 1332. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148.  PMID 15231748  .
  • 鈴木雄三、山下亮、城田正之、榊原雄三、千葉淳、水島-菅野淳、他 (2004年9月). 「ヒト遺伝子とマウス遺伝子の配列比較により、プロモーター領域に相同ブロック構造が認められる」. Genome Research . 14 (9): 1711– 1718. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316.  PMID 15342556  .
  • Hoareau-Aveilla C, Bonoli M, Caizergues-Ferrer M, Henry Y (2006年5月). 「hNaf1はヒトボックスH/ACA snoRNP、scaRNP、およびテロメラーゼの蓄積に必須である」. RNA . 12 (5): 832– 840. doi :10.1261/rna.2344106. PMC 1440901.  PMID 16601202  .
「https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=TNIP1&oldid=1314985938」から取得