TOGスーパーファミリー

トランスポーター-オプシン-Gタンパク質共役受容体（TOG）スーパーファミリーは、通常7つまたは8つの膜貫通αヘリックスセグメント（TMS）を持つ膜貫通タンパク質のタンパク質スーパーファミリーです。これには、(1)イオン輸送微生物ロドプシン、(2)Gタンパク質共役受容体（GPCR）、(3)甘味糖トランスポーター、(4)ニコチンアミドリボヌクレオシド取り込みパーミアーゼ（PnuC; TC# 4.B.1）、(5) 4-トルエンスルホン酸取り込みパーミアーゼ（TSUP ; TC# 2.A.102）、(6) Ni2 ⁺ -Co2 ⁺トランスポーター（NiCoT ; TC# 2.A.52）、(7)有機溶質トランスポーター（OST）が含まれます（8）リン酸：Na ⁺共輸送体（PNaS） ; TC# 2.A.58）および（9）リソソームシステイントランスポーター（LCT） ; TC# 2.A.43）。^{[1] [2]}

ファミリー

現在TOGスーパーファミリー（TC番号が青色で表示）内で認められているファミリーには以下が含まれます。 ^[3]

• 1.A.14 -精巣強化遺伝子移入（TEGT）ファミリー
• 1.A.26 - Mg ²⁺トランスポーターE（MgtE）ファミリー
• 1.A.76 -マグネシウムトランスポーター1（MagT1）ファミリー
• 2.A.43 -リソソームシスチントランスポーター（LCT）ファミリー
• 2.A.52 - Ni ²⁺ -Co ²⁺トランスポーター（NiCoT）ファミリー
• 2.A.58 -リン酸:Na ⁺共輸送体（PNaS）ファミリー
• 2.A.82 -有機溶質輸送体（OST）ファミリー
• 2.A.102 - 4-トルエンスルホン酸取り込み酵素（TSUP）ファミリー
• 2.A.123 -甘味; PQループ; 唾液; MtN3（甘味）ファミリー
• 3.E.1 -イオン輸送微生物ロドプシン（MR）ファミリー
• 4.B.1 -ニコチンアミドリボヌクレオシド（NR）取り込み酵素（PnuC）ファミリー
• 9.A.14 - Gタンパク質共役受容体（GPCR）ファミリー

構造

以下のファミリーのメンバーで利用可能な3D構造には、次のようなものがあります

• スイートファミリー：4RNG
• MRファミリー: 5AX0 ​, 3T45​ - 高解像度構造
• PnuCファミリー: 4QTN
• GPCRファミリー: 3CAP

参照

• 溶質輸送体ファミリー
• トランスポーター分類データベース

参考文献

1. Maksim A. Shlykov、Wei Hao Zheng、Jonathan S. Chen、Milton H. Saier, Jr. (2012年3月). 「膜貫通タンパク質の4-トルエンスルホン酸取り込み透過酵素（TSUP）ファミリーのバイオインフォマティクスによる特性評価」Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1818 (3): 703– 717. doi :10.1016/j.bbamem.2011.12.005 . PMC  3917603. PMID  22192777
2. Yee DC1, Shlykov MA, Västermark A, Reddy VS, Arora S, Sun EI, Saier MH Jr. (2013年9月). 「トランスポーターオプシンGタンパク質共役受容体（TOG）スーパーファミリー」. The FEBS Journal . 280 (22): 5780– 5800. doi :10.1111/febs.12499. PMC 3832197. PMID 23981446  . 
3. Saier, Milton. 「トランスポーター-オプシン-Gタンパク質結合受容体（TOG）スーパーファミリー」tcdb.org . 2015年12月28日閲覧。

参考文献

• Yee DC1、Shlykov MA、Västermark A、Reddy VS、Arora S、Sun EI、Saier MH Jr.（2013年9月）「トランスポーターオプシンGタンパク質共役受容体（TOG）スーパーファミリー」 The FEBS Journal 280 (22): 5780–5800 . doi :10.1111/febs.12499 . PMC  3832197. PMID  23981446