ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| トリブ1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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5CEM、5CEK、5IGO、5IGQ |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TRIB1、C8FW、GIG-2、GIG2、SKIP1、TRB-1、TRB1、トリブルズ擬似キナーゼ1 |
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| 外部ID | オミム:609461; MGI : 2443397;ホモロジーン: 75216;ジーンカード:TRIB1; OMA :TRIB1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 15番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 15|15 D1 | 始める | 59,520,199 bp [2] |
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| 終わり | 59,528,948 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 膀胱粘膜
- S状結腸粘膜
- 臓側胸膜
- 胆嚢
- 副鼻腔粘膜
- 精巣上体尾部
- 耳下腺
- 腹直筋の骨格筋組織
- 腎臓尿細管
- 甲状腺
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| | 上位の表現 | - 顆粒球
- 網膜色素上皮
- 耳下腺
- 涙腺
- 胚の尾
- 性器結節
- ランゲルハンス島
- 左結腸
- レンズ
- リップ
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質キナーゼ活性
- ユビキチンタンパク質転移酵素調節活性
- タンパク質キナーゼ阻害活性
- 転写因子結合
- タンパク質結合
- マイトジェン活性化プロテインキナーゼキナーゼ結合
- ATP結合
- ユビキチンタンパク質リガーゼ結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 平滑筋細胞の増殖の負の調節
- タンパク質キナーゼ活性の負の調節
- マクロファージ分化の正の制御
- 平滑筋細胞の移動の負の調節
- DNA結合転写因子活性の負の制御
- 好中球分化の負の制御
- リポ多糖類を介したシグナル伝達経路の負の制御
- タンパク質リン酸化
- JNKカスケード
- リポ多糖類に対する反応
- 好酸球分化の正の制御
- MAPキナーゼ活性の調節
- プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解プロセスの正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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トリブルズホモログ1は、ヒトではTRIB1遺伝子によってコードされているタンパク質キナーゼである。[5] [6] [7]このタンパク質擬似キナーゼ(擬似酵素)の相同遺伝子は、動物界のほぼ全域に見られる。[8]これは、MAPK経路のMAPKKレベルのシグナル伝達タンパク質に結合することで生物学的機能を発揮し、それによって細胞の増殖、アポトーシス、分化を媒介するこの経路の機能において調節的役割を担う。トリブルズ1はtrib1遺伝子によってコードされており、ヒトでは8番染色体の最長腕(q)の24.13番目の位置にある。最近の結晶構造から、トリブルズ1は、「壊れた」Cヘリックス領域、C/EBPalphaなどのユビキチン化された基質の結合部位、および重要な調節性Cテール領域を含む珍しい3D構造をしていることがわかった。[9] TRIB2やTRIB3と同様に、TRIB1は最近、潜在的なアロステリック薬物標的として考えられている。[10]
関数
トリブルス-1は、タンパク質キナーゼスーパーファミリーのCAMKセリン/スレオニンタンパク質キナーゼファミリーに属するトリブルスサブファミリーの3つのメンバーの1つです。トリブルスサブファミリーは擬似キナーゼの一種であり、その構造には推定キナーゼ領域を発現していますが、触媒活性はありません。トリブルスサブファミリーは機能的なATP結合ポケットを欠いているため、基質をリン酸化できません。代わりに、トリブルスタンパク質は足場タンパク質として機能し、基質と結合して機能部位を決定したり、機能部位から離れた場所に配置したりします[8]。
Tribbles-1の発現は非常に可変性が高く、時間と細胞の種類に応じて常に変化しており[11]、細胞内に多くの制御が存在することを示唆しています。タンパク質の一次構造にはPEST領域が含まれており、これは細胞内で分解されやすいタンパク質であることを示しています。Tribbles-1は基質に結合して自身の発現を制御する役割を果たしており、MAPK経路上でその機能を生成するだけでなく、結合中に分解から保護する働きもします。これにより、 Tribbles-1の機能において正のフィードバックループが形成されます。Tribbles-1の機能は、その量の増加を直接的に助けるからです。正のフィードバックループは、外部刺激の緩和が必要な状況において生物学全体でよく見られるため、Tribbles-1が示す正のフィードバックループは、Tribbles-1が細胞応答において機能的な役割を果たしていることを示唆しています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000173334 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032501 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Wilkin F, Suarez-Huerta N, Robaye B, Peetermans J, Libert F, Dumont JE, Maenhaut C (1997年9月). 「イヌ甲状腺細胞における分裂促進経路によってmRNAが制御されるリン酸化タンパク質の特性解析」. European Journal of Biochemistry . 248 (3): 660–8 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00660.x . PMID 9342215.
- ^ Hegedus Z, Czibula A, Kiss-Toth E (2006年7月). 「トリブル:細胞機能の新たな調節因子;進化的側面」.細胞および分子生命科学. 63 (14): 1632–41 . doi :10.1007/s00018-006-6007-9. PMC 11136108. PMID 16715410. S2CID 24556931 .
- ^ 「Entrez Gene: TRIB1 トリブルズホモログ 1 (ショウジョウバエ)」.
- ^ ab Eyers PA, Keeshan K, Kannan N (2017年4月). 「21世紀のトリブル:生物学と疾患におけるトリブル擬似キナーゼの進化する役割」. Trends in Cell Biology . 27 (4): 284– 298. doi :10.1016/j.tcb.2016.11.002. PMC 5382568. PMID 27908682 .
- ^ マーフィー JM、ナカタニ Y、ジェイミソン SA、ダイ W、ルーセット IS、メイス PD (2015 年 11 月)。 「TRIB1シュードキナーゼによるCCAATエンハンサー結合タンパク質動員の分子機構」。構造。23 (11): 2111–21 . doi : 10.1016/j.str.2015.08.017。PMID 26455797。
- ^ Foulkes DM, Byrne DP, Bailey FP, Eyers PA (2015年10月). 「トリブル擬似キナーゼ:化学生物学と創薬における新たな標的?」.生化学会誌. 43 (5): 1095– 103. doi :10.1042/BST20150109. PMID 26517930.
- ^ Sung HY, Francis SE, Crossman DC, Kiss-Toth E (2006年4月). 「哺乳類トリブルの発現調節とシグナル伝達調節機能は細胞種特異的である」. Immunology Letters . 104 ( 1–2 ): 171–7 . doi :10.1016/j.imlet.2005.11.010. PMID 16364454.
さらに読む
- Tang K, Finley RL, Nie D, Honn KV (2000年3月). 「酵母ツーハイブリッドスクリーニングによる12-リポキシゲナーゼと細胞タンパク質との相互作用の同定」.生化学. 39 (12): 3185–91 . doi :10.1021/bi992664v. PMID 10727209.
- Wu M, Xu LG, Zhai Z, Shu HB (2003年7月). 「SINKはp65と相互作用するNF-κB依存性転写の負の調節因子である」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (29): 27072–9 . doi : 10.1074/jbc.M209814200 . PMID 12736262.
- Kiss-Toth E, Bagstaff SM, Sung HY, Jozsa V, Dempsey C, Caunt JC, et al. (2004年10月). 「ヒトトリブル:ミトゲン活性化プロテインキナーゼカスケードを制御するタンパク質ファミリー」. The Journal of Biological Chemistry . 279 (41): 42703–8 . doi : 10.1074/jbc.M407732200 . hdl : 2262/33449 . PMID 15299019.
- Xu C, Zhang J, Huang X, Sun J, Xu Y, Tang Y, 他 (2006年6月). 「ヒトペプチジルプロリルイソメラーゼ様タンパク質1の溶液構造とSKIPとの相互作用に関する知見」. The Journal of Biological Chemistry . 281 (23): 15900–8 . doi : 10.1074/jbc.M511155200 . PMID 16595688.
- Sung HY, Guan H, Czibula A, King AR, Eder K, Heath E, 他 (2007年6月). 「ヒトtribbles-1はMAPKシグナル伝達経路を介して平滑筋細胞の増殖と走化性を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 282 (25): 18379–87 . Bibcode :2007JBiCh.28218379S. doi : 10.1074/jbc.M610792200 . PMC 2366084. PMID 17452330 .
外部リンク