トリム16

トリム16
識別子
エイリアス	TRIM16、EBBP、16個の三者モチーフを含む
外部ID	オミム：609505; MGI : 2137356;ホモロジーン: 4726;ジーンカード：TRIM16; OMA :TRIM16 - オルソログ
遺伝子の位置（マウス） キリスト 11番染色体（マウス）[1] バンド 11|11 B2 始める 62,711,057 bp [1] 終わり 62,741,634 bp [1]
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 亜鉛イオン結合 インターロイキン-1結合 タンパク質結合 金属イオン結合 NACHTドメイン結合 トランスフェラーゼ活性 細胞成分 細胞質 PML本体 細胞内解剖学的構造 細胞質 細胞膜 生物学的プロセス ヒストンH4のアセチル化 ケラチノサイト分化の正の調節 転写の正の制御、DNAテンプレート 有機リンに対する反応 レチノイン酸受容体シグナル伝達経路の正の調節 レチノイン酸への反応 ヒストンH3のアセチル化 成長ホルモンへの反応 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10626 94092 アンサンブル ENSG00000221926 ENSMUSG00000047821 ユニプロット O95361 Q99PP9 RefSeq (mRNA) NM_006470 NM_053169 RefSeq（タンパク質） NP_006461 NP_001335049 NP_001335050 NP_001335051 NP_001335053 NP_001335054 NP_001335055 NP_001335048 NP_444399 場所（UCSC） 該当なし 11章: 62.71 – 62.74 Mb PubMed検索 [2] [3]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

三者モチーフ含有タンパク質16は、ヒトではTRIM16遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[4] [5]}

この遺伝子は、エストロゲン受容体を安定発現する上皮細胞において、エストロゲンおよび抗エストロゲン制御遺伝子として同定されました。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、Bボックスジンクフィンガータンパク質ファミリーに特徴的な2つのBボックスドメインとコイルドコイル領域を含んでいます。

このファミリーのタンパク質は、細胞の成長、分化、病態形成など、様々な生物学的プロセスに関与することが報告されています。この遺伝子の発現はほとんどの組織で検出されましたが、その機能はまだ解明されていません。^[5]

参考文献

1. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000047821 – Ensembl、2017年5月
2. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
3. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. レイモンド A、メローニ G、ファントッツィ A、メルラ G、カイロ S、ルジ L、リガネッリ D、ザナリア E、メッサリ S、カイナルカ S、グファンティ A、ミヌッチ S、ペリッチ PG、バラビオ A (2001 年 5 月)。 「三者構成モチーフファミリーは細胞コンパートメントを特定する。」エンボ J . 20 (9): 2140–51 .土井:10.1093/emboj/20.9.2140。PMC 125245。PMID  11331580。 
5. "Entrez Gene: TRIM16 三者モチーフ含有 16".

さらに読む

• Liu HL, Golder-Novoselsky E, Seto MH, et al. (1999). 「新規エストロゲン応答性Bボックスタンパク質（EBBP）遺伝子は、エストロゲン受容体DNA結合ドメイン変異体を発現する細胞においてタモキシフェンによって制御される」Mol. Endocrinol . 12 (11): 1733–48 . doi : 10.1210/mend.12.11.0193 . PMID  9817599.
• Beer HD, Munding C, Dubois N, et al. (2002). 「エストロゲン応答性Bボックスタンパク質：ケラチノサイト分化の新規制御因子」J. Biol. Chem . 277 (23): 20740–9 . doi : 10.1074/jbc.M111233200 . hdl : 20.500.11850/91604 . PMID  11919186.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5 . Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID 15302935  .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928.  PMID 15489334  .
• Munding C, Keller M, Niklaus G, et al. (2006). 「エストロゲン応答性Bボックスタンパク質：インターロイキン-1β分泌の新規促進因子」. Cell Death Differ . 13 (11): 1938–49 . doi :10.1038/sj.cdd.4401896. PMID  16575408. S2CID  8953820.
• Cheung BB, Bell J, Raif A, et al. (2006). 「エストロゲン応答性Bボックスタンパク質はレチノイドシグナルの新たな調節因子である」. J. Biol. Chem . 281 (26): 18246–56 . doi : 10.1074/jbc.M600879200 . PMID  16636064.