トリム29

トリム29
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2CSV
識別子
エイリアス	TRIM29、ATDC、29を含む三者モチーフ
外部ID	オミム: 610658 ; MGI : 1919419 ;ホモロジーン: 8100 ;ジーンカード: TRIM29 ; OMA : TRIM29 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 11番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 11q23.3 始める 120,111,286 bp [ 1 ] 終わり 120,185,529 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 9番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 9|9 A5.1 始める 43,222,145 bp [ 2 ] 終わり 43,247,412 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 太ももの皮膚 歯茎 歯肉上皮 咽頭粘膜 腕の皮膚 腹部の皮膚 外陰部 人間のペニス 乳首 口腔 上位の表現 リップ 外耳の皮膚 食道 表皮 腹部の皮膚 背中の皮膚 毛包 結膜円蓋 角膜 中耳 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合転写因子活性 亜鉛イオン結合 p53結合 タンパク質結合 金属イオン結合 細胞間接着に関与するカドヘリン結合 同一のタンパク質結合 細胞成分 細胞内解剖学的構造 細胞質 リソソーム 生物学的プロセス タンパク質の核への局在の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写 細胞間接着 免疫システムのプロセス 自然免疫反応 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 23650 72169 アンサンブル ENSG00000137699 ENSMUSG00000032013 ユニプロット Q14134 Q8R2Q0 RefSeq (mRNA) NM_012101 NM_058193 NM_001330382 NM_023655 RefSeq（タンパク質） NP_001317311 NP_036233 NP_076144 場所（UCSC） 11章: 120.11 – 120.19 MB 9章: 43.22 – 43.25 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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三者モチーフ含有タンパク質29は、ヒトではTRIM29遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質はTRIMタンパク質ファミリーに属し、複数のジンクフィンガーモチーフとロイシンジッパーモチーフを有する。核酸結合に関与するホモ二量体またはヘテロ二量体を形成することが示唆されている。したがって、発癌および/または分化に関与する転写制御因子として作用する可能性がある。また、毛細血管拡張性運動失調症の表現型と関連することから、放射線感受性の抑制にも機能する可能性がある。^{[ 6 ]}

相互作用

TRIM29はTRIM23 ^{[ 5 ]}およびGCC1 ^{[ 7 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000137699 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032013 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. レイモンド A、メローニ G、ファントッツィ A、メルラ G、カイロ S、ルジ L、リガネッリ D、ザナリア E、メッサリ S、カイナルカ S、グッファンティ A、ミヌッチ S、ペリッチ PG、バラビオ A (2001 年 5 月)。「三者構成モチーフファミリーは細胞コンパートメントを識別する。 」エンボ J . 20 (9): 2140–51 .土井: 10.1093/emboj/20.9.2140。PMC 125245。PMID 11331580。  
6. 「Entrez遺伝子：TRIM29三者モチーフ含有29」。
7. ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .  

さらに読む

• Kapp LN, Painter RB, Yu LC, van Loon N, Richard CW, James MR, Cox DR, Murnane JP (1992). 「D群毛細血管拡張性運動失調症の候補遺伝子のクローニング」 . Am. J. Hum. Genet . 51 (1): 45– 54. PMC  1682873. PMID  1609804 .
• Hosoi Y, Kapp LN (1994). 「培養線維芽細胞株およびヒト組織における毛細血管拡張性運動失調症グループD候補遺伝子の発現」. Int. J. Radiat. Biol . 66 (6 Suppl): S71-6. doi : 10.1080/09553009414551891 . PMID  7530755 .
• Brzoska PM, Chen H, Zhu Y, Levin NA, Disatnik MH, Mochly-Rosen D, Murnane JP, Christman MF (1995). 「毛細血管拡張性運動失調症グループD相補遺伝子ATDCの産物は、プロテインキナーゼCの基質および阻害剤と相互作用する」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 (17): 7824–8 . Bibcode : 1995PNAS...92.7824B . doi : 10.1073/pnas.92.17.7824 . PMC  41238. PMID  7644499 .
• Murnane JP, Zhu Y, Young BR, Christman MF (1994). 「候補AT遺伝子ATDCの発現は、電離放射線に対して正常な反応を示すヒト細胞株では検出されない」. Int. J. Radiat. Biol . 66 (6 Suppl): S77-84. doi : 10.1080/09553009414551901 . PMID  7836856 .
• 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID  8125298 .
• Leonhardt EA, Kapp LN, Young BR, Murnane JP (1994). 「D群毛細血管拡張性運動失調症（ATDC）の候補遺伝子のヌクレオチド配列解析」. Genomics . 19 (1): 130–6 . doi : 10.1006/geno.1994.1022 . PMID  8188213 .
• Richard CW, Cox DR, Kapp L, Murnane J, Cornelis F, Julier C, Lathrop GM, James MR (1993). 「毛細血管拡張性運動失調症病巣を含むヒト染色体11q22-q23の放射線ハイブリッドマップ」. Genomics . 17 (1): 1– 5. doi : 10.1006/geno.1993.1275 . PMID  8406440 .
• Laderoute KR, Knapp AM, Green CJ, Sutherland RM, Kapp LN (1996). 「A431ヒト扁平上皮癌細胞におけるATDC（毛細血管拡張性運動失調症グループD相補性）遺伝子の発現」 . Int. J. Cancer . 66 (6): 772–8. doi : 10.1002 /(SICI)1097-0215(19960611)66:6<772::AID - IJC11>3.0.CO;2-5 . PMID  8647648. S2CID  29088136 .
• 鈴木雄三、中川佳智、丸山健、須山明生、菅野誠一 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID  9373149 .
• Tauchi H, Green C, Knapp M, Laderoute K, Kapp L (2000). 「毛細血管拡張性運動失調症D群細胞におけるATDCメッセージのスプライシング変化は、機能的タンパク質の欠失をもたらす」 . Mutagenesis . 15 (2): 105–8 . doi : 10.1093/mutage/15.2.105 . PMID  10719033 .
• Colland F、Jacq X、Trouplin V、Mougin C、Groizeleau C、Hamburger A、Meil A、Wojcik J、Legrain P、Gauthier JM (2004)。「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」。ゲノム解析14 (7): 1324–32 .土井: 10.1101/gr.2334104。PMC  442148。PMID  15231748。
• ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
• 細井 Y、カップ LN、ムルネ JP、松本 Y、榎本 A、小野 T、宮川 K (2006)。 「毛細血管拡張性失調症グループD相補遺伝子ATDCの発現による足場非依存性成長の抑制」。生化学。生物物理学。解像度共通。348 (2): 728–34 .土井: 10.1016/j.bbrc.2006.07.115。PMID  16890201。
• Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). 「確率に基づくアプローチによるハイスループットタンパク質リン酸化解析と部位局在化」Nat . Biotechnol . 24 (10): 1285–92 . doi : 10.1038/nbt1240 . PMID  16964243. S2CID  14294292 .