Protein-coding gene in the species Homo sapiens
トリム31 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス TRIM31 、C6orf13、HCG1、HCGI、RNF、31を含む3者モチーフ 外部ID オミム :609316; MGI : 2385051; ホモロジーン : 17137; ジーンカード :TRIM31; OMA :TRIM31 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 17番染色体(マウス) [2] バンド 17|17 B1 始める 37,209,010 bp [2] 終わり 37,221,106 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 横行結腸粘膜 直腸 十二指腸 付録 胆嚢 膀胱 睾丸 結腸上皮 右精巣 左精巣
上位の表現 腸絨毛 空腸 十二指腸 左結腸 回腸 小腸上皮 パネートセル 小腸のリーベルキューン陰窩 移動性腸管神経堤細胞 接合子
より多くの参照表現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
亜鉛イオン結合
タンパク質結合
金属イオン結合
トランスフェラーゼ活性
細胞成分
細胞質
細胞質
細胞内解剖学的構造
ミトコンドリア
生物学的プロセス
DNA結合転写因子活性の正の調節
タンパク質のユビキチン化
インターフェロンγを介したシグナル伝達経路
ウイルス転写の負の制御
自然免疫反応
宿主細胞へのウイルス侵入の負の制御
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ENSG00000223531 ENSG00000137397 ENSG00000233573 ENSG00000224168 ENSG00000225130 ENSG00000226402 ENSG00000224542 ENSG00000204616
ユニプロット RefSeq (mRNA) RefSeq(タンパク質) 場所(UCSC) 6章: 30.1 – 30.11 MB 17章: 37.21 – 37.22 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
三者モチーフ含有タンパク質31 は、 ヒトでは TRIM31 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、三者モチーフ(TRIM)ファミリーのメンバーである。TRIMモチーフは、3つの亜鉛結合ドメイン、RING、Bボックスタイプ1、Bボックスタイプ2、そしてコイルドコイル領域を含む。このタンパク質は細胞質と核の両方に局在するが、その機能は未だ解明されていない。 [6]
相互作用
TRIM31はTRIM23 と 相互作用する ことが示されている 。 [5]
参考文献
^ abc ENSG00000137397, ENSG00000233573, ENSG00000224168, ENSG00000225130, ENSG00000226402, ENSG00000224542, ENSG00000204616 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000223531, ENSG00000137397, ENSG00000233573, ENSG00000224168, ENSG00000225130, ENSG00000226402, ENSG00000224542, ENSG00000204616 – アンサンブル 、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000058063 – Ensembl 、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。
^ ab レイモンド A、メローニ G、ファントッツィ A、メルラ G、カイロ S、ルジ L、リガネッリ D、ザナリア E、メッサリ S、カイナルカ S、グファンティ A、ミヌッチ S、ペリッチ PG、バラビオ A (2001 年 5 月)。 「三者構成モチーフファミリーは細胞コンパートメントを識別する。」 エンボ J . 20 (9): 2140–51 . 土井 :10.1093/emboj/20.9.2140。 PMC 125245 。 PMID 11331580。
^ ab "Entrez Gene: TRIM31 三者モチーフ含有 31".
さらに読む
丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」. 遺伝子 . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
el Kahloun A, Chauvel B, Mauvieux V, et al. (1993). 「HLA-A遺伝子座周辺における7つの新規遺伝子の局在」 Hum. Mol. Genet . 2 (1): 55– 60. doi :10.1093/hmg/2.1.55. PMID 8490624.
鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). 「ヒト6番染色体のDNA配列と解析」. Nature . 425 (6960): 805–11 . Bibcode :2003Natur.425..805M. doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). 「RNAサーベイランスの過小評価された役割」. Genome Biol . 5 (2): R8. doi : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . PMC 395752. PMID 14759258 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」 Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y, et al. (2006). 「ヒト胃癌のトランスクリプトーム解析」. Mamm. Genome . 16 (12): 942–54 . doi :10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
椎名 剛志、太田 正之、清水 誠、他 (2006). 「霊長類における主要組織適合遺伝子複合体クラスI遺伝子の急速な進化は、ヒッチハイク多様性を介してヒトに新たな疾患アレルを生み出す」. 遺伝学 . 173 (3): 1555–70 . doi :10.1534/genetics.106.057034. PMC 1526686. PMID 16702430 .