タゲチトキシン タゲチトキシンの提案構造
識別子 ケムスパイダー InChI=1S/C11H17N2O11PS/c1-3(14)22-5-4(12)6(24-25(19,20)21)10(9(16)17)2-26-11(18,8(13)15) 7(5)23-10/h4-7,18H,2,12H2,1H3,(H2,13,15)(H,16,17)(H2,19,20,21)/t4-,5-,6-,7-,10+,11-/m1/s1
キー: UVAAUIDYGIWLMB-XJKNRETDSA-N
InChI=1/C11H17N2O11PS/c1-3(14)22-5-4(12)6(24-25(19,20)21)10(9(16)17)2-26-11(18,8(13)15)7 (5)23-10/h4-7,18H,2,12H2,1H3,(H2,13,15)(H,16,17)(H2,19,20,21)/t4-,5-,6-,7-,10+,11-/m1/s1
キー: UVAAUIDYGIWLMB-XJKNRETDBI
O=C(N)[C@]1(O)SC[C@@]2(O[C@@H]1[C@H](OC(=O)C)[C@@H](N)[C@H]2OP(=O)(O)O)C(=O)O
プロパティ C 11 H 17 N 2 O 11 P S モル質量 416.29 g·mol −1 特に記載がない限り、データは
標準状態 (25 °C [77 °F]、100 kPa)における材料のものです。
タゲチトキシン (TGT )は、Pseudomonas syringae pv. tagetis によって産生される細菌性植物毒素 である。[ 1 ] [ 2 ]
化学構造 TGT が最初に単離されたとき、その特徴は部分的にしか解明されていませんでした。[ 2 ] 最初に提案された TGT の化学構造は 8 員環でしたが[ 3 ] 、その後まもなく、 NMR と質量分析 に基づいて二環式構造(右に示す)に修正されました。[ 4 ] しかし、この構造は疑問視されています。[ 5 ] 絶対配置は 未決定のままであり、有機合成 による構造確認の試みが進行中です。[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] 2015 年に、Porter らは、広範な 2D NMR データに基づいて TGT の代替構造を提案しました。[ 13 ]
作用機序 TGT は若い植物の葉の葉緑体の発達を妨げ、それによってクロロシス を引き起こす。[ 14 ] この毒素の自然な標的は葉緑体 RNA ポリメラーゼである。葉緑体 RNA ポリメラーゼは、普遍的なマルチサブユニット RNA ポリメラーゼ (RNAP) ファミリーに属し、細菌酵素と最も密接に関連している。試験管内で 、TGT は、大腸菌 と高度好熱菌 由来の細菌 RNAP 、および真核生物のRNA ポリメラーゼ III を阻害する。[ 15 ] 対照的に、真核生物の RNA ポリメラーゼ I と II およびシングルサブユニットのウイルス RNA ポリメラーゼは、この化合物に対して比較的鈍感である。TGT は細菌酵素の活性部位に結合し [ 16 ] 、転写の開始および伸長段階、ならびに新生 RNA の加ピロリン酸分解を阻害する。[ 16 ] しかし、阻害の詳細なメカニズムは、依然として白熱した議論の対象となっている。[ 17 ] [ 18 ]
TGTはRNAP-NTP-TGTの三元複合体を形成し、阻害性マグネシウムイオンに結合することによってリン酸ジエステル結合の 合成を阻害するか、または柔軟な活性部位 ドメインを不活性な構造に捕捉することによってリン酸ジエステル結合の合成を阻害すると示唆されている。[ 16 ] 3番目の理論は、TGTが主にRNAP-TGT の 二元複合体を形成し、転写副産物ピロリン酸を模倣することによってDNAに沿ったRNAPの転座を阻害することを示唆している。 [ 20 ]
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