標的解析シーケンシング

ターゲット解析シーケンシングターゲットアンプリコンシーケンシングとも呼ばれる)(TAS)は、アンプリコンと特定の遺伝子に焦点を当てた次世代DNAシーケンシング技術である。 [ 1 ]多様な生物をターゲットにできるため、集団遺伝学で有用である。TASアプローチは、バイオインフォマティクス技術を取り入れ、サンガーシーケンシングにかかる​​コストのほんの一部で大量のデータを生成する。TASは、 PCRを介して必要な遺伝子領域を増幅し、その後に次世代シーケンシングプラットフォームを使用できるため、DNA研究でも有用である。次世代シーケンシングは、50~400塩基対の短いリードを使用するため、複数の標本のより迅速なシーケンシングが可能になる。したがって、TASは、容易に拡張可能で、信頼性と速度の両方を提供する、より安価なシーケンシングアプローチを可能にする。[ 2 ]

参考文献

  1. ^ Bybee, Seth M.; Bracken-Grissom, Heather (2011年10月13日). 「標的アンプリコンシーケンシング(TAS):多座・多分類群系統へのスケーラブルな次世代アプローチ」 . Genome Biology and Evolution . 3. et al.: 1312– 1323. doi : 10.1093/gbe/evr106 . PMC  3236605. PMID 22002916  .
  2. ^ Masser, DR; Stanford, DR; Freeman, WM (2015年2月24日). 「次世代シーケンシングによる標的DNAメチル化解析」 . Journal of Visualized Experiments . 96 (96) 52488. doi : 10.3791/52488 . PMC 4354667. PMID 25741966 .