爬虫類データベース

爬虫類データベースは、現生爬虫類（恐竜などの化石種を除く）の分類情報を収集する科学データベースです。このデータベースは、科などの上位の分類ではなく、種に焦点を当てており、現在確認されている約14,000種とその亜種[1]のすべてが収録されています。ただし、新たに記載された種がオンラインで利用可能になるまでには通常、最大数ヶ月のタイムラグがあります。このデータベースには、学名、一般名、シノニム、文献情報、分布情報、タイプ情報、語源、その他の分類学的関連情報が収録されています。

歴史

このデータベースは、創設者のピーター・ウエッツがドイツのハイデルベルクにある欧州分子生物学研究所(EMBL)の大学院生であった1995年にEMBL爬虫類データベース[ 2 ]として設立されました。トゥーレ・エッツォルドはEMBL DNA配列データベース用の最初のウェブインターフェースを開発し、それが爬虫類データベースのインターフェースとしても使用されました。2006年にデータベースはゲノム研究所(TIGR) に移され、TIGRがJ・クレイグ・ベンター研究所 (JCVI) に合併されるまで、TIGR爬虫類データベース[ 3 ]として短期間運用されました。TIGRはJ・クレイグ・ベンター研究所(JCVI)に合併され、ウエッツは2010年までJCVIの准教授を務めていました。2010年以来、データベースはピーター・ウエッツとチェコ人のプログラマーであるイリ・ホシェクの監督の下、チェコ共和国のサーバーで維持されています。[ 4 ]このデータベースは、2021年に20周年を迎えたAmphibiaWebとともに25周年を迎えました。[ 5 ]

コンテンツ

爬虫類の属の数。属の種数は、特定の種数に限られます。ほとんどの属は1種または数種しか存在しませんが、中には数百種存在する属もあります。爬虫類データベースのデータ（2015年5月時点）に基づきます。

2024年8月現在、爬虫類データベースには約12,200種（約2,200亜種を含む）が約1250属（図参照）掲載されており、60,000件以上の文献と約22,000枚の写真が掲載されています。データベースは開始以来着実に成長しており、過去10年間で年間平均100～200種の新種が記載されています。[ 6 ]最近、データベースにはほぼ完全な一次タイプ標本のリストも追加されました。[ 7 ]

他のデータベースとの関係

爬虫類データベースは、地球上のすべての生物種をカタログ化した150種以上の種データベースからなるメタデータベースであるカタログ・オブ・ライフ（CoL）を作成したSpecies 2000プロジェクトのメンバーです。 [ 8 ] CoLは、 Encyclopedia of Life （EoL）に分類情報を提供しています。爬虫類データベースは、世界海洋生物種登録簿（WoRMS）、市民科学プロジェクトiNaturalistとも連携しており、[ 9 ] IUCNレッドリストデータベースへのリンクも提供しています。NCBI分類データベースは、爬虫類データベースにリンクしています。

参照

参考文献

  1. ^ Uetz, Peter; Stylianou, Alexandrea (2018). 「爬虫類とその亜種の原典記載」 . Zootaxa . 4375 (2): 257– 264. doi : 10.11646/zootaxa.4375.2.5 . PMID  29689772 .
  2. ^ Uetz, P.; Etzold, T. (1996). 「EMBL/EBI爬虫類データベース」.爬虫類学評論. 27 (4): 174–175 .
  3. ^ウエッツ、P.; J. ゴル; J. ハラーマン (2007)。 「TIGR-爬虫類銀行死ね」。エラフェ。15 (3)：22～ 25。
  4. ^ Abraham, SA (2015年1月9日). 「VCU教授、爬虫類の系統図作成のための包括的なデータベースを管理」 . 『Across the Spectrum』 . バージニア・コモンウェルス大学.
  5. ^ Uetz, Peter; et al. (2021年6月16日). 「爬虫類・両生類データベースの25年」 . Herpetological Review . 52 : 246–255 – ResearchGate経由.
  6. ^ Uetz, P. (2010). 「爬虫類の原典記載」(PDF) . Zootaxa . 2334 (1): 59– 68. doi : 10.11646/zootaxa.2334.1.3 .
  7. ^ピーター・ウエッツ;チェリク、サミ。シア、グレン。イネイヒ、イワン。キャンベル、パトリック D.ドロニン、イーゴリ V.ロサド、ホセ。ウィン、アディソン。タイ、ケネス A.ロイ・マクディアーミッド。リー、ジャスティン L. (2019-11-12)。「主要な爬虫類タイプの標本の世界的なカタログ」。ズータキサ。4695 (5): 438–450 .土井: 10.11646/zootaxa.4695.5.2。hdl : 10141/622594。ISSN 1175-5334。PMID 31719333。S2CID 207962117。   
  8. ^ Catalogue of Life Source databases Archived 2020-09-17 at the Wayback Machine、2015年8月アクセス
  9. ^ "iNaturalist" . Inaturalist.org . 2022年6月9日閲覧。
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