サーモコッカス・バロフィラス
| サーモコッカス・バロフィラス | |
|---|---|
科学的分類 | |
| ドメイン： | 古細菌 |
| 王国： | メタノバクテリア |
| 門: | メタノバクテリオタ |
| クラス： | サーモコッカス |
| 注文： | サーモコッカス目 |
| 家族： | サーモコッカス科 |
| 属: | サーモコッカス |
| 種： | T.バロフィラス |
| 二名法名 | |
| サーモコッカス・バロフィラス マルテインソンら 1999 | |
サーモコッカス・バロフィラスは、深海熱水噴出孔から分離された好圧性および超好熱性の古細菌である。嫌気性で硫黄代謝性であり、基準株はMP Tである。 [ 1 ]
命名法
サーモコッカス・バロフィラス（Thermococcus barophilus）という学名は、ギリシャ語の「サーモ（熱）」、コッコス（球状の細胞）、バロス（重さ）、フィロス（愛する）」に由来しています。全体として、この名前は「熱と水柱の圧力に引き寄せられる球状の体を持つ生物」を意味します。[ 2 ]
生理
T. barophilusは、圧力が高ければさらに高温でも生育できる。大気圧下では45～90℃の温度で生育可能で、最適温度は85℃であるが、静水圧が15.0～17.5MPaであれば100℃という高温でも生育できる。[ 2 ]生育には通常硫黄が必要であるが、硫黄が存在しない場合でもゆっくりと生育する。膜脂質は、古細菌を主成分としている。[ 3 ]
ゲノム
T. barophilusのゲノムは2,010,078bpの環状構造をしており、配列が決定されている。また、環状プラスミドpTBMP1も有する。ゲノム配列から、本菌はカルボキシド栄養経路を有し、7つの異なるヒドロゲナーゼ複合体を有することが示されている。[ 4 ]
トランスクリプトーム
この生物のトランスクリプトーム解析も行われ、異なる圧力条件下でT. barophilusにおいて378個の遺伝子の発現が異なることが明らかになった 。エネルギー産生・変換、無機イオン輸送・代謝、炭水化物輸送・代謝に関連する遺伝子は発現が上昇している。一方、アミノ酸輸送・代謝、ヌクレオチド輸送・代謝、複製・修復・組換え、無機イオン輸送・代謝に関連する遺伝子は発現が低下している。[ 5 ]
参考文献
- ^ Marteinsson, VT; Birrien, J.-L.; Reysenbach, A.-L.; Vernet, M.; Marie, D.; Gambacorta, A.; Messner, P.; Sleytr, UB; Prieur, D. (1999). 「深海熱水噴出孔から高水圧下で単離された好圧性および超好熱性の新規古細菌、Thermococcus barophilus sp. nov.」 International Journal of Systematic Bacteriology . 49 (2): 351– 359. doi : 10.1099/00207713-49-2-351 . ISSN 0020-7713 . PMID 10319455 .
- ^ a b David R. Boone、Richard W. Castenholz編 (2012年1月13日). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . 第1巻（第2版）. Springer Science & Business Media. p. 344. ISBN 978-0387216096. 2016年9月23日閲覧。
- ^ Marteinsson, VT; Birrien, JL; Reysenbach, AL; Vernet, M.; Marie, D.; Gambacorta, A.; Messner, P.; Sleytr, UB; Prieur, D. (1999年4月). 「深海熱水噴出孔から高水圧下で単離された好圧性および超好熱性の新規古細菌、Thermococcus barophilus sp. nov.」 International Journal of Systematic Bacteriology . 49 Pt 2 (2): 351– 359. doi : 10.1099/00207713-49-2-351 . ISSN 0020-7713 . PMID 10319455 .
- ^ Vannier, Pauline; Marteinsson, Viggo Thor; Fridjonsson, Olafur Hedinn; Oger, Philippe; Jebbar, Mohamed (2011年3月). 「超好熱性、好圧性、従属栄養性、およびカルボキシド栄養性の古細菌Thermococcus barophilus MPの完全ゲノム配列」 . Journal of Bacteriology . 193 (6): 1481– 1482. doi : 10.1128 / JB.01490-10 . ISSN 1098-5530 . PMC 3067617. PMID 21217005 .
- ^ Vannier, Pauline; Michoud, Grégoire; Oger, Philippe; Marteinsson, Viggó Þór; Jebbar, Mohamed (2015年11月). 「異なる静水圧条件に対するThermococcus barophilusとThermococcus kodakarensisのゲノム発現」 . Research in Microbiology . 166 (9): 717– 725. doi : 10.1016/j.resmic.2015.07.006 . ISSN 1769-7123 . PMID 26239966 .
さらに読む
- Thiel, A.; Michoud, G.; Moalic, Y.; Flament, D.; Jebbar, M. (2014). 「超好熱性好圧性古細菌 Thermococcus barophilus の遺伝子操作」.応用環境微生物学. 80 (7): 2299– 2306. Bibcode : 2014ApEnM..80.2299T . doi : 10.1128/AEM.00084-14 . ISSN 0099-2240 . PMC 3993132. PMID 24487541 .
- Marteinsson, VT; Reysenbach, A. -L.; Birrien, J. -L.; Prieur, D. (1999). 「深海好圧性超好熱菌Thermococcus barophilusは大気圧下で培養するとストレスタンパク質を誘導される」. Extremophiles . 3 ( 4): 277– 282. doi : 10.1007/s007920050128 . ISSN 1431-0651 . PMID 10591019. S2CID 19414485 .
- ヴァニエ、ポーリン（2011年3月）. 「超好熱性、好圧性、従属栄養性、およびカルボキシド栄養性の古細菌Thermococcus barophilus MPの完全ゲノム配列」 . Journal of Bacteriology . 193 (6): 1481–2 . doi : 10.1128 /JB.01490-10 . PMC 3067617. PMID 21217005. 2014年11月4日閲覧.
- Satyanarayana, Tulasi; Littlechild, Jennifer; Kawarabayasi, Yutaka 編 (2013). 『環境・産業バイオテクノロジーにおける好熱性微生物：好熱菌のバイオテクノロジー』 ドルドレヒト：Springer Netherlands. doi : 10.1007/978-94-007-5899-5 . ISBN 978-94-007-5898-8. S2CID 82088128 .
外部リンク
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