| チオバチルス | |
|---|---|
| 科学的分類 | |
| ドメイン： | |
| 門: | |
| クラス： | |
| 注文： | |
| 家族： | チオバシラ科
|
| 属: | チオバチルス
|
| 種 | |
|
チオバチルス・チオパルス | |
チオバチルス（Thiobacillus）は、グラム陰性 ベータプロテオバクテリアの属である。チオバチルス・チオパルス（Thiobacillus thioparus）はこの属の基準種であり、基準株はスターキーT株であり、1930年代にロバート・スターキー（Robert Starkey）がアメリカ合衆国ラトガース大学の圃場で分離した1904年にマーティヌス・ベイエリンク（Martinus Beijerinck）によって定義されて以来、30を超える「種」が命名されてきたが[1] [2] （最初の株は1902年に海洋生物学者のアレクサンダー・ナサンソン（Alexander Nathansohn）によって観察された。現在ではハロチオバチルス・ネアポリタヌス（Halothiobacillus neapolitanus ） [3]と呼ばれるものと思われる）、ほとんどの種は有効に、または効果的に公表されることはなかった。残りは、アルファプロテオバクテリアのパラコッカス（Paracoccus）や（ Starkeya）に再分類された。ベータプロテオバクテリア属には、スルフリフェルラ、アンウッド、チオモナス属（ベータプロテオバクテリア）、ガンマプロテオバクテリア属にはハロチオバチルス、ガイパルケリア、アシディチオバチルス属にはテルミチオバチルスまたは硫黄酸化従属栄養菌と化学無機従属栄養菌が属する「種」として、非常に曖昧に定義されたチオバチルス・トラウトヴァイニイ（Thiobacillus trautweinii）が分類された。これらの種のほとんどは、シュードモナス属（Pseudomonas）であったと考えられる。 [4]この属に命名された多くの種は、サービスコレクションに収蔵されることがなく、失われている。 [4] [3]
すべての種は絶対独立栄養生物[1] [2] [3]（カルビン・ベンソン・バシャム回路[4]のトランスアルドラーゼ型を使用）であり、元素硫黄、チオ硫酸塩、またはポリチオン酸塩をエネルギー源として利用します。以前のThiobacillus aquaesulis は従属栄養生物として複合培地で弱く成長できますが、Annwoodia aquaesulisに再分類されました。基準種Thiobacillus thioparusの一部の株（E6 および Tk-m）は、ジメチルスルフィド、ジメチルジスルフィド、または二硫化炭素から硫黄を利用して独立栄養成長を支えます。これらの菌株は、これらの種の炭素を二酸化炭素に酸化して同化します。硫黄の酸化はケリー・トルーディンガー経路によって達成されます。
再分類
16SリボソームRNA配列解析の結果、 Thiobacillus属の多くのメンバーが再分類された。[5] [4] [6]
- チオバチルス・ベルストゥスからパラコッカスまで
- チオバチルス・アシドフィルスからアシディフィリウムへ
- Thiobacillus intermedius、 Thiobacillus perometabolis、 Thiobacillus thermosulfatus、およびThiobacillus cuprinusからThiomonas
- Thiobacillus thiooxidans、 Thiobacillus ferrooxidans、 Thiobacillus caldus、およびThiobacillus albertensisからAcidithiobacillus
- Thiobacillus aquaesulisからAnnwoodia aquaesulisへ。[4]
- チオバチルス・ナポリタヌスからハロチオバチルス
- Thiobacillus thyasirisからThiomicrospira thyasiraeへ[7]
- チオバチルス・ハイドロサーマリスとチオバチルス・ハロフィルスは、最初はハロチオバチルスに、後にガイパルケリアに進化した[6]
- チオバチルス・テピダリウスからテルミチオバチルスへ[5]
参考文献
- ^ ab ベイジェリンク MW (1904)。 「微生物による生産物削減の現象」。Arch Neel Sci Exact Nat (セクション 2)。9 : 131–157 .
- ^ ab ベイジェリンク MW (1904)。 「Ueber die Bakterien, welche sich im Dunkeln mit Kohlensäure als Kohlenstoffquelle ernähren können」。Centralbl Bakteriol Parasitenkd Infektionskr Hyg Abt II。11 : 592–599 .
- ^ abc Boden R (2017). 「硫黄代謝115年」FEMS微生物学レターズ364 ( 6) fnx043. doi : 10.1093/femsle/fnx043 . PMID 28333223.
- ^ abcde Boden R, Hutt LP, Rae AW (2017). 「Thiobacillus aquaesulis (Wood & Kelly, 1995) の Annwoodia aquaesulis gen. nov., comb. nov. への再分類、Thiobacillus (Beijerinck, 1904) の Hydrogenophilales から Nitrosomonadales への移動、Proteobacteria に Hydrogenophilalia 綱 nov. の提案、および Nitrosomonadales 目と Rhodocyclales 目に4つの新科」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 67 (5): 1191– 1205. doi : 10.1099/ijsem.0.001927 . hdl : 10026.1/8740 . PMID 28581923。
- ^ ab Kelly DP; Wood AP (2000). 「Thiobacillus属細菌の新たな属Acidithiobacillus gen. nov.、Halothiobacillus gen. nov.、およびThermithiobacillus gen. nov.への再分類」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 50 (2): 511– 516. doi : 10.1099/00207713-50-2-511 . PMID 10758854.
- ^ ab Boden R (2017). 「Halothiobacillus hydrothermalisおよびHalothiobacillus halophilusのThioalkalibacteraceae科の新属Guyparkeria属への再分類、およびHalothiobacillus属およびHalothiobacillaceae科の記載修正」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 67 (10): 3919– 3928. doi : 10.1099/ijsem.0.002222 . hdl : 10026.1/9982 . PMID 28884673.
- ^ Kelly DP; WoodAP (1993). 「Thiobacillus thyasiris の Thiomicrospira thyasirae への再分類、環境条件に応じて多形性を示す生物、新たな組み合わせ」Archives of Microbiology . 159 : 45– 47. doi :10.1007/BF00244262. S2CID 23406498.
