| トランスフォーミング成長因子ベータ様ドメイン | |||||||||
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ヒトトランスフォーミング成長因子β2の構造。[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | TGF_ベータ | ||||||||
| ファム | PF00019 | ||||||||
| ファム一族 | CL0079 | ||||||||
| インタープロ | IPR001839 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00223 | ||||||||
| SCOP2 | 1tfg / スコープ / SUPFAM | ||||||||
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形質転換成長因子β(TGF-β)スーパーファミリーは、構造的に関連した細胞調節タンパク質の大きなグループであり、1983年に最初に記述された最初のメンバーであるTGF-β1にちなんで命名されました。 [2]これらはTGF-β受容体と相互作用します。
それ以来、多くのタンパク質が、無脊椎動物や脊椎動物を含む様々な種においてTGF-βスーパーファミリーのメンバーとして記述されており、4つの主要なサブファミリーに分類される23の異なる遺伝子型に分類されています。[3] [4] [5]
形質転換成長因子β(TGF-β)[6]は、多くの細胞種において増殖、分化、その他の機能を制御する多機能ペプチドです。TGF-β-1は、前駆体タンパク質のC末端からタンパク質分解によって切断された112個のアミノ酸残基からなるペプチドです。これらのタンパク質は、細胞表面のセリン/スレオニン特異的タンパク質キナーゼ受容体の保存ファミリーと相互作用し、SMADと呼ばれる保存タンパク質ファミリーを用いて細胞内シグナルを生成します。これらは、成長、発達、組織の恒常性維持、免疫系の制御といった基本的な生物学的プロセスの調節において基本的な役割を果たしています。[3]
構造
TGF-βスーパーファミリーに属するタンパク質は、ホモ二量体またはヘテロ二量体としてのみ活性を示し、2つの鎖は1つのジスルフィド結合によって連結されています。TGF-β-2のX線研究[7]から、他のすべてのシステインも鎖内ジスルフィド結合に関与していることが分かっています。以下の模式図に示すように、TGF-βとインヒビンβ鎖には4つのジスルフィド結合がありますが、このスーパーファミリーの他のメンバーには最初の結合がありません。
インターチェーン
|
+------------------------------------------|+
| ||
xxxxcxxxxxCcxxxxxxxxxxxxxxxxxxCxxCxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCCxxxxxxxxxxxxxxxxxxCxCx
| | | | | |
+------+ +--|----------------------------------------+ |
+------------------------------------------+
ここで、「C」はジスルフィド結合に関与する保存されたシステインを示します。
例
このドメインを含むタンパク質をコードするヒト遺伝子には以下のものがあります。
AMH ; ARTN ; BMP2 ; BMP3 ; BMP4 ; BMP5 ; BMP6 ; BMP7 ; BMP8A ; BMP8B ; BMP10 ; BMP15 ; GDF1 ; GDF2 ; GDF3 ; GDF5 ; GDF6 ; GDF7 ; GDF9 ; GDF10 ; GDF11 ; GDF15 ; GDNF ; INHA ; INHBA ; INHBB ; INHBC ; INHBE; LEFTY1 ; LEFTY2 ; MSTN ; NODAL ; NRTN ; PSPN ; TGFB1 ; TGFB2 ; TGFB3 ;
参考文献
- ^ Schlunegger MP, Grütter MG (1992年7月). 「ヒト 形質転換成長因子β2の2.2Å分解能における結晶構造から明らかになった特異な特徴」Nature 358 (6385): 430–4 . Bibcode :1992Natur.358..430S. doi :10.1038/358430a0. PMID 1641027. S2CID 4239431.
- ^ Assoian RK, Komoriya A, Meyers CA, Miller DM, Sporn MB (1983年6月). 「ヒト血小板におけるトランスフォーミング成長因子β.主要貯蔵部位の同定,精製,および特性評価」. J. Biol. Chem . 258 (11): 7155–60 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)32345-7 . PMID 6602130.
- ^ ab Herpin A, Lelong C, Favrel P (2004年5月). 「トランスフォーミング成長因子β関連タンパク質:後生動物における先祖伝来の広範なサイトカインスーパーファミリー」. Dev. Comp. Immunol . 28 (5): 461–85 . doi :10.1016/j.dci.2003.09.007. PMID 15062644.
- ^ Burt DW (1992年4月). 「トランスフォーミング成長因子βスーパーファミリーの進化的分類」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 184 (2): 590–5 . doi :10.1016/0006-291X(92)90630-4. PMID 1575734.
- ^ Burt DW, Law AS (1994). 「トランスフォーミング成長因子βスーパーファミリーの進化」(PDF) . Prog. Growth Factor Res . 5 (1): 99– 118. doi :10.1016/0955-2235(94)90020-5. hdl : 20.500.11820/50fc2d69-c411-4835-9cd9-36bf4144bae4 . PMID 8199356. S2CID 41326578.
- ^ Roberts AB, Sporn MB (1990).ペプチド成長因子とその受容体. ベルリン: Springer-Verlag. ISBN 3-540-51184-9。
- ^ Daopin S, Piez KA, Ogawa Y, Davies DR (1992年7月). 「トランスフォーミング成長因子β2の結晶構造:スーパーファミリーとしては異例のフォールド」. Science . 257 (5068): 369–73 . Bibcode :1992Sci...257..369D. doi :10.1126/science.1631557. PMID: 1631557.