トランスポビロン

トランスポビロンは巨大DNAウイルスゲノム中に見られるプラスミドのような遺伝要素である[1] [2]

トランスポビロンは約7キロベースの線状DNA要素で、6~8個のタンパク質コード遺伝子を含んでいます。これらの遺伝子のうち2つは、ヴィロファージ遺伝子と相同性があります。トランスポビロンは、不活性化されたファミリーB DNAポリメラーゼドメインを含むスーパーファミリー1ヘリカーゼをコードしています。 [3]このユニークなポリメラーゼ-ヘリカーゼ融合タンパク質の相同体は、ポリントン様ウイルス(PLV)に広く分布しています。[4]ヘリカーゼドメインの系統解析に基づき、PLVの発見者は、トランスポビロンがPLVから進化し、形態形成モジュールタンパク質をコードする遺伝子を含むいくつかの遺伝子が失われたと結論付けました。[3]

参考文献

  1. ^ デヌエス、C;ラ・スコラ、B;ユーティン、N;フォーナス、G;ロバート、C;アザ、S;ジャルド、P;モンティユ、S;カンポカッソ、A;クーニン、EV;ラウール、D (2012)。 「巨大ウイルスの多様なモビロームとしてのプロビロファージとトランスポビロン」。Proc Natl Acad Sci USA109 (44): 18078–83ビブコード:2012PNAS..10918078D。土井10.1073/pnas.1208835109PMC  3497776PMID  23071316。
  2. ^ Yutin, N; Raoult, D; Koonin, EV (2013). 「ヴィロファージ、ポリントン、トランスポヴィロン:多様な利己的遺伝要素と異なる生殖戦略による複雑な進化ネットワーク」. Virol J. 10 ( 1): 158. doi : 10.1186/1743-422x-10-158 . PMC 3671162. PMID 23701946  . 
  3. ^ ab Krupovic M, Yutin N, Koonin EV (2016). 「スーパーファミリー1ヘリカーゼと不活性化DNAポリメラーゼの融合は、ポリントン、ポリントン様ウイルス、Tlr1トランスポゾン、およびトランスポビロンの共通の進化史を示すシグネチャーである」. Virus Evolution . 2 (1) vew019. doi :10.1093/ve/vew019. PMC 5499653. PMID 28694999  . 
  4. ^ Yutin, N; Shevchenko, S; Kapitonov, V; Krupovic, M; Koonin, EV (2015). 「メタゲノム解析により発見された多様なポリントン様ウイルスの新規グループ」BMC Biology . 13 : 95. doi : 10.1186/s12915-015-0207-4 . PMC 4642659 . PMID  26560305. 
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