| トリストロマウイルス科 | |
|---|---|
ウイルスの分類 
| |
| （ランク外）: | ウイルス |
| レルム: | アドナビリア |
| 王国： | ジリグビラエ |
| 門: | タレアビリコタ |
| クラス： | トキビリケテス |
| 注文： | プリマウイルス科 |
| 家族： | トリストロマウイルス科 |
トリストロマウイルス科はウイルスの科である。 [1] サーモプロテウス属およびピロバキュラム属の古細菌が自然宿主となる。 [2]トリストロマウイルス科はプリマウイルス目に属する唯一の科である。この科には2属3種が含まれる。 [3]
分類学
この科には以下の属と種が割り当てられている：[3]
- アルファトリストローマウイルス
- アルファトリストローマウイルス・ポッツオリエンセ
- アルファトリストローマウイルス・プテオリエンセ
- ベータトリストローマウイルス
- ベータトリストローマウイルス・クラフラエンセ
構造
トリストロマウイルス科（Tristromaviridae）のウイルスはエンベロープを持ち、桿体状の構造をしています。直径は約38 nm、長さは410 nmです。ゲノムは線状で、長さは約15.9 kbです。TTV1ウイルス粒子には、TP1～4という4つのウイルスコードタンパク質が含まれています。[2] [4]これらのタンパク質は、リポトリックスウイルス科を含む他の科のウイルスの構造タンパク質と配列の類似性を示しません。ヌクレオカプシドタンパク質TP1は、適応型CRISPR-Cas免疫の保存された構成要素であるCas4エンドヌクレアーゼから進化したとみられ、ウイルスカプシドタンパク質の機能への酵素の適応が初めて報告された事例です。[5]
ピロバキュラム糸状ウイルス2（PFV2）は、タイプ種を代表するPFV1に近縁のウイルスであり、クライオ電子顕微鏡（クライオEM）によってウイルス粒子の高解像度構造が決定されました。[6]構造解析により、ヌクレオカプシドは2つの主要なカプシドタンパク質（MCP1とMCP2）から構成されていることが明らかになりました。MCP1とMCP2はヘテロ二量体を形成し、線状dsDNAゲノムを包み込んでA型へと変換します。ゲノムとMCPとの相互作用により、ゲノムはウイルス粒子のスーパーヘリックスへと凝縮されます。[6]ヘリカル状のヌクレオカプシドは脂質エンベロープに囲まれ、他のウイルスタンパク質を含んでおり、VP3が最も豊富です。[7]
トリストロマウイルスのMCPのフォールドとウイルス粒子の構成は、リガメンウイルス目を構成するルディウイルス科[8]およびリポスリックスウイルス科[9][10]のウイルスと類似している。これらの構造的類似性から、リガメンウイルス目とトリストロマウイルス科は「トキウイルス綱」（トキはグルジア語で「糸」を意味し、ウイルス綱の公式接尾辞である）に統合することが提案された。[6]
ライフサイクル
ウイルスの複製は細胞質内で行われる。宿主細胞への侵入は、宿主細胞への吸着によって行われる。転写はDNAテンプレート転写によって行われる。サーモプロテウス属およびピロバキュラム属の古細菌が自然宿主となる。ウイルス粒子は溶解によって放出される。伝播経路は受動拡散である。[2]
参考文献
- ^ Prangishvili, D; Rensen, E; Mochizuki, T; Krupovic, M; ICTVレポート、コンソーシアム（2019年2月）. 「ICTVウイルス分類プロファイル：トリストロマウイルス科」. The Journal of General Virology . 100 (2): 135– 136. doi : 10.1099/jgv.0.001190 . PMID 30540248.
- ^ abc "Tristromaviridae". ViralZone . スイス・バイオインフォマティクス研究所. 2021年5月14日閲覧。
- ^ ab 「ウイルス分類：2020年版」。国際ウイルス分類委員会（ICTV）。2021年3月。 2021年5月14日閲覧。
- ^ Neumann, Horst; Schwass, Volker; Eckerskorn, Christoph; Zillig, Wolfram (1989). 「Thermoproteus tenax virus TTV1の3つの構造タンパク質をコードする遺伝子の同定と特性評価」MGG Molecular & General Genetics . 217 (1): 105– 110. doi :10.1007/BF00330948. PMID 2505050. S2CID 13335423.
- ^ Krupovic M, Cvirkaite-Krupovic V, Prangishvili D, Koonin EV (2015). 「CRISPR関連Cas4ヌクレアーゼからの古細菌ウイルスヌクレオカプシドタンパク質の進化」. Biol Direct . 10 (1): 65. doi : 10.1186/s13062-015-0093-2 . PMC 4625639. PMID 26514828 .
- ^ abc Wang, F; Baquero, DP; Su, Z; Osinski, T; Prangishvili, D; Egelman, EH; Krupovic, M (2020年1月). 「糸状ウイルスの構造は、古細菌ウイルス圏における家族関係を明らかにする」. Virus Evolution . 6 (1) veaa023. doi :10.1093/ve/veaa023. PMC 7189273. PMID 32368353 .
- ^ Rensen, EI; Mochizuki, T; Quemin, E; Schouten, S; Krupovic, M; Prangishvili, D (2016). 「DNAウイルスの中でユニークな構造を持つ超好熱性古細菌ウイルス」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 113 (9): 2478–83 . Bibcode :2016PNAS..113.2478R. doi : 10.1073/pnas.1518929113 . PMC 4780613. PMID 26884161 .
- ^ DiMaio, F; Yu, X; Rensen, E; Krupovic, M; Prangishvili, D; Egelman, EH (2015). 「ウイルス学．超好熱菌に感染するウイルスはA型DNAをカプシド化する」．Science . 348 ( 6237): 914–7 . doi :10.1126/science.aaa4181. PMC 5512286. PMID 25999507 .
- ^ Kasson, P; DiMaio, F; Yu, X; Lucas-Staat, S; Krupovic, M; Schouten, S; Prangishvili, D; Egelman, EH (2017). 「糸状超好熱ウイルスにおける新規膜エンベロープモデル」. eLife . 6 . doi : 10.7554/eLife.26268 . PMC 5517147 . PMID 28639939.
- ^ Liu, Y; Osinski, T; Wang, F; Krupovic, M; Schouten, S; Kasson, P; Prangishvili, D; Egelman, EH (2018). 「超好熱性好酸性菌に感染する膜エンベロープを持つ糸状ウイルスの構造保全」Nature Communications . 9 (1): 3360. Bibcode :2018NatCo...9.3360L. doi :10.1038/s41467-018-05684-6. PMC 6105669. PMID 30135568 .
外部リンク
