ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| UBQLN2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | UBQLN2、ALS15、CHAP1、DSK2、N4BP4、PLIC2、HRIHFB2157、ユビキリン2 |
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| 外部ID | オミム:300264; MGI : 1860283;ホモロジーン: 81830;ジーンカード:UBQLN2; OMA :UBQLN2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | X染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | X|X F3 | 始める | 152,281,223 bp [2] |
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| 終わり | 152,284,566 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 小脳虫部
- 橋
- 中心後回
- 内皮細胞
- ブロードマン野23
- 網膜色素上皮
- 嗅内皮質
- 上前庭神経核
- 精嚢
- 中側頭回
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| | 上位の表現 | - ハベヌラ
- 腹側被蓋野
- 弓状核
- 中央隆起
- 鉤状部
- 精嚢
- 視床下部室傍核
- 前扁桃体領域
- 腹内側核
- 視床下部背内側核
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- ポリユビキチン修飾依存性タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- オートファゴソーム
- 細胞膜
- 細胞質小胞
- 核
- 膜
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- オートファジー
- オートファゴソームの組み立ての制御
- Gタンパク質共役受容体の内在化の負の制御
- マクロオートファジーの調節
- ユビキチン依存性ERAD経路
- クラスリン依存性エンドサイトーシスの負の制御
- ER関連ユビキチン依存性タンパク質分解プロセスの正の制御
- オートファゴソームの組み立て
- ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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ユビキリン-2は、ヒトではUBQLN2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子は、酵母、ラット、カエルの関連タンパク質と高い相同性を示すユビキチン様タンパク質(ユビキリン)をコードしています。ユビキリンは、 N末端ユビキチン様ドメインとC末端ユビキチン関連ドメインを有しています。ユビキリンはプロテアソームとユビキチンリガーゼの両方と物理的に会合し、ユビキチン化機構をプロテアソームに機能的に連結することで、生体内タンパク質分解を促進すると考えられています。このユビキリンは、 Hsp70類似タンパク質であるHspa13 (Stch)のATPaseドメインにも結合することが示されています。[6]
他のタンパク質との類似性
ヒトUBQLN2は、 UBQLN1やUBQLN4などの関連ユビキリンと高い類似性を共有している。[7]
臨床的意義
家族性筋萎縮性側索硬化症(fALS)のごく一部では、UBQLN2遺伝子の変異により、機能不全のユビキリン2酵素が形成されます。この機能不全の酵素は、下位運動ニューロンおよび上位皮質脊髄路運動ニューロンにユビキチン化タンパク質の蓄積を引き起こします。これは、ユビキリン2が通常これらのユビキチン化タンパク質を分解するのですが、ALS変異が存在すると分解できないためです。[8] UBQLN2変異を持たず、TDP-43やC9ORF72などの他の遺伝子に変異を持つ患者にも、同様の蓄積が見られます。[要出典]
相互作用
UBQLN2はHERPUD1 [9]およびUBE3A [10]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000188021 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000050148 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Kaye FJ, Modi S, Ivanovska I, Koonin EV, Thress K, Kubo A, Kornbluth S, Rose MD (2000年3月). 「ユビキチン様タンパク質ファミリーがHsp70様StchのATPaseドメインに結合する」. FEBS Lett . 467 ( 2–3 ): 348–55 . Bibcode :2000FEBSL.467..348K. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01135-2 . PMID 10675567.
- ^ ab 「エントレツ遺伝子: UBQLN2 ユビキリン 2」。
- ^ Marín I (2014年3月). 「ユビキリン遺伝子ファミリー:進化パターンと機能的洞察」. BMC Evol Biol . 14 (1): 63. Bibcode :2014BMCEE..14...63M. doi : 10.1186/1471-2148-14-63 . PMC 4230246. PMID 24674348 .
- ^ Deng HX、Chen W、Hong ST、Boycott KM、Gorrie GH、Siddique N、Yang Y、Fecto F、Shi Y、Zhai H、Jiang H、Hirano M、Rampersaud E、Jansen GH、Donkervoort S、Bigio EH、Brooks BR、Ajroud K、Sufit RL、Haines JL、Mugnaini E、Pericak-Vance MA、Siddique T (2011年8月)。 「UBQLN2の変異は、優性X連鎖性の若年者および成人発症のALSおよびALS/認知症を引き起こす」。自然。477 (7363): 211–215。書誌コード:2011Natur.477..211D。土井:10.1038/nature10353. PMC 3169705。PMID 21857683。
- アマンダ・シャファー(2011年8月29日)「ルー・ゲーリック病の原因と思われる人物が発見される」ニューヨーク・タイムズ
- ^ Kim TY, Kim E, Yoon SK, Yoon JB (2008年5月). 「HerpはユビキリンをリクルートすることでER関連タンパク質の分解を促進する」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 369 (2): 741–6 . Bibcode :2008BBRC..369..741K. doi :10.1016/j.bbrc.2008.02.086. PMID 18307982.
- ^ Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio RE, Kedersha NL, Gill G, Howley PM (2000年8月). 「hPLICタンパク質はユビキチン化機構とプロテアソームを繋ぐ役割を果たす可能性がある」. Mol. Cell . 6 (2): 409–19 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)00040-X . PMID 10983987.
さらに読む
- 植木 暢、小田 剛、近藤 正之、他 (1999). 「核標的タンパク質をコードする遺伝子の選択システム」Nat. Biotechnol . 16 (13): 1338–42 . doi :10.1038/4315. PMID 9853615. S2CID 20001769.
- Kaye FJ, Shows TB (2000). 「GeneBridge放射線ハイブリッドによるヒト染色体xp11.23→p11.1へのubiquilin2(UBQLN2)の割り当て」Cytogenet. Cell Genet . 89 ( 1–2 ): 116–7 . doi :10.1159/000015588. PMID 10894951. S2CID 43380537.
- Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, et al. (2000). 「hPLICタンパク質はユビキチン化機構とプロテアソームを繋ぐ役割を果たす可能性がある」Mol. Cell . 6 (2): 409–19 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)00040-X . PMID 10983987.
- Murillas R, Simms KS, Hatakeyama S, et al. (2002). 「Nedd4ユビキチンリガーゼと機能的に相互作用する、発生段階において発現するタンパク質の同定」. J. Biol. Chem . 277 (4): 2897–907 . doi : 10.1074/jbc.M110047200 . PMID 11717310.
- Walters KJ, Kleijnen MF, Goh AM, et al. (2002). 「ユビキチンファミリータンパク質とプロテアソームサブユニットS5aの相互作用に関する構造的研究」.生化学. 41 (6): 1767–77 . doi :10.1021/bi011892y. PMID 11827521.
- 佐伯 勇、曽根 剛、東江 明、横澤 秀 (2002). 「26Sプロテアソームのユビキチン様タンパク質結合サブユニットの同定」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 296 (4): 813–9 . Bibcode :2002BBRC..296..813S. doi :10.1016/S0006-291X(02)02002-8. PMID 12200120.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Kleijnen MF, Alarcon RM, Howley PM (2004). 「hPLIC-2のユビキチン関連ドメインはプロテアソームと相互作用する」Mol. Biol. Cell . 14 (9): 3868–75 . doi :10.1091/mbc.E02-11-0766. PMC 196580 . PMID 12972570.
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32 . doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
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- Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). 「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性疾患におけるタンパク質間相互作用ネットワーク」. Cell . 125 (4): 801–14 . doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569.
- Ford DL, Monteiro MJ (2006). 「ユビキリンの二量体形成はタンパク質の中央領域に依存する:プレセニリンとの結合には二量体ではなく単量体が関与していることを示す証拠」Biochem. J. 399 ( 3): 397– 404. doi :10.1042/BJ20060441. PMC 1615901. PMID 16813565 .
- Kang Y, Zhang N, Koepp DM, Walters KJ (2007). 「ユビキチン受容体タンパク質hHR23aとhPLIC2の相互作用」J. Mol. Biol . 365 (4): 1093– 101. doi :10.1016/j.jmb.2006.10.056. PMC 1994665. PMID 17098253 .