USF2

USF2
識別子
エイリアス	USF2、FIP、bHLHb12、上流転写因子2、c-fosの相互作用
外部ID	オミム: 600390 ; MGI : 99961 ;ホモロジーン: 2527 ;ジーンカード: USF2 ; OMA : USF2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 19番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 19q13.12 始める 35,268,962 bp [ 1 ] 終わり 35,279,821 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 7番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 7 B1|7 19.27 cM 始める 30,644,673 bp [ 2 ] 終わり 30,656,228 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 小脳の右半球 心臓の頂点 右前頭葉 C1セグメント 神経節隆起 左卵巣 下垂体前葉 右卵巣 甲状腺の右葉 心室帯 上位の表現 網膜の神経層 心室帯 顆粒球 上前頭回 リップ 太ももの筋肉 海馬歯状回顆粒細胞 一次視覚野 卵黄嚢 性器結節 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 配列特異的DNA結合 DNA結合 タンパク質二量体化活性 タンパク質ホモ二量体化活性 DNA結合転写因子活性 bHLH転写因子結合 タンパク質結合 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 細胞内膜小器官 核 核質 生物学的プロセス 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写のグルコースによる正の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 ウイルス転写後期 RNAポリメラーゼIIによる転写 転写、DNAテンプレート 転写の正の制御、DNAテンプレート グルコースによるRNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写の調節 脂質恒常性 授乳 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 7392 22282 アンサンブル ENSG00000105698 ENSMUSG00000058239 ユニプロット Q15853 Q64705 RefSeq (mRNA) NM_003367 NM_207291 NM_001321150 NM_011680 RefSeq（タンパク質） NP_001308079 NP_003358 NP_997174 NP_035810 場所（UCSC） 19章: 35.27 – 35.28 MB 7章: 30.64 – 30.66 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

上流刺激因子2は、ヒトではUSF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

関数

この遺伝子は、基本的なヘリックス・ループ・ヘリックス・ロイシンジッパーファミリーのメンバーをコードし、細胞転写因子として機能する。コードされるタンパク質は、ピリジンリッチイニシエーター（Inr）エレメントとEボックスモチーフを介して転写を活性化する。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが同定されている。^{[ 6 ]}

相互作用

^USF2はUSF1（ヒト遺伝子） [ ^{7 ] [ 8 ]} PPRC1 ^{[ 9 ]}およびBRCA1と相互作用することが示されている。^{[ 10 ]}

規制

USF2遺伝子はマイクロRNA miR-10aによって抑制される。^{[ 11 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000105698 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000058239 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Groenen PM, Garcia E, Debeer P, Devriendt K, Fryns JP, Van de Ven WJ (1996年12月). 「ヒトUSF2の構造、配列、および19番染色体における局在と、多嚢胞性腎異形成患者におけるその再配列」. Genomics . 38 (2): 141–8 . doi : 10.1006/geno.1996.0609 . PMID 8954795 . 
6. 「Entrez Gene：USF2上流転写因子2、c-fosの相互作用」。
7. Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」 .分子システム生物学. 3 (1) 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .  
8. Viollet B, Lefrançois-Martinez AM, Henrion A, Kahn A, Raymondjean M, Martinez A (1996年1月). 「上流刺激因子アイソフォームの免疫化学的特徴とトランザクティング特性」 . The Journal of Biological Chemistry . 271 (3): 1405–15 . doi : 10.1074/jbc.271.3.1405 . PMID 8576131 . 
9. Moore ML, Park EA, McMillin JB (2003年5月). 「上流刺激因子はPGC-1によるカルニチンパルミトイルトランスフェラーゼIβの発現誘導を抑制する」 . The Journal of Biological Chemistry . 278 (19): 17263–8 . doi : 10.1074/jbc.M210486200 . PMID 12611894 . 
10. Cable PL, Wilson CA, Calzone FJ, Rauscher FJ, Scully R, Livingston DM, Li L, Blackwell CB, Futreal PA, Afshari CA (2003年10月). 「BRCA1タンパク質複合体の新規コンセンサスDNA結合配列」 . Molecular Carcinogenesis . 38 (2): 85– 96. doi : 10.1002/mc.10148 . PMID 14502648. S2CID 24956554 .  
11. アジーレ X、ヒメネス＝ベラスコ A、サン ホセ＝エネリス E、ガラテ L、バンドレス E、コルデュ L、アパリシオ O、サエス B、ナバロ G、ビラス＝ソルノザ A、ペレス＝ロジェ I、ガルシア＝フォンシージャス J、トーレス A、ハイニガー A、カラサンス MJ、フォルテス P、ロマン＝ゴメスJ、プロスパー F (2008 年 12 月)。「慢性骨髄性白血病 CD34+ 細胞における hsa-miR-10a の下方制御により、USF2 媒介細胞増殖が増加します。 」分子癌研究。6 (12): 1830–40 .土井: 10.1158/1541-7786.MCR-08-0167。PMID 19074828。 

さらに読む

• Corre S, Galibert MD (2006年1月). 「遺伝子発現の重要な制御要素としてのUSF」(PDF) . Médecine/Sciences . 22 (1): 62–7 . doi : 10.1051/medsci/200622162 . PMID  16386222 .
• Sirito M, Walker S, Lin Q, Kozlowski MT, Klein WH, Sawadogo M (1993). 「USFファミリーのヘリックス-ループ-ヘリックスタンパク質は、ホモダイマーおよびヘテロダイマーとしてDNAに結合する」 .遺伝子発現. 2 (3): 231–40 . PMC  6057381. PMID  1450663 .
• Blanar MA, Rutter WJ (1992年5月). 「相互作用クローニング：c-Fosと相互作用するヘリックス-ループ-ヘリックスジッパータンパク質の同定」. Science . 256 (5059): 1014–8 . Bibcode : 1992Sci...256.1014B . doi : 10.1126/science.1589769 . PMID  1589769 .
• Viollet B, Lefrançois-Martinez AM, Henrion A, Kahn A, Raymondjean M, Martinez A (1996年1月). 「上流刺激因子アイソフォームの免疫化学的特徴とトランザクティング特性」 . The Journal of Biological Chemistry . 271 (3): 1405–15 . doi : 10.1074/jbc.271.3.1405 . PMID  8576131 .
• Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996年4月). 「改良されたショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」.分析生化学. 236 (1): 107–13 . doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID  8619474 .
• Ghosh AK, Datta PK, Jacob ST (1997年2月). 「in vivoでのリボソームRNA遺伝子転写におけるヘリックス-ループ-ヘリックス-ジッパータンパク質USFの二重の役割」 . Oncogene . 14 (5): 589–94 . doi : 10.1038/sj.onc.1200866 . PMID  9053857 .
• Kurschner C, Morgan JI (1997年2月). 「USF2/FIPはb-Zip転写因子c-MafのbHLHドメインを介して会合し、c-MafのDNA結合活性を阻害する」. Biochemical and Biophysical Research Communications . 231 (2): 333–9 . Bibcode : 1997BBRC..231..333K . doi : 10.1006/bbrc.1997.6097 . PMID  9070273 .
• Breen GA, Jordan EM (1997年4月). 「ミトコンドリアF0F1-ATP合成酵素複合体のαサブユニットをコードする核遺伝子の制御．上流刺激因子2による活性化」 . The Journal of Biological Chemistry . 272 (16): 10538–42 . doi : 10.1074/jbc.272.16.10538 . PMID  9099698 .
• Nechushtan H, Zhang Z, Razin E (1997年4月). 「マウス肥満細胞における小眼球症（mi）：刺激を介した発現の翻訳レベルにおける制御」 . Blood . 89 (8): 2999– 3008. doi : 10.1182/blood.V89.8.2999 . PMID  9108421 .
• Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997年4月). 「大規模連結cDNAシーケンシング」 .ゲノム研究. 7 (4): 353–8 . doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC  139146. PMID  9110174 .
• ブリーン・ジョージア、ジョーダン・EM（1999年8月）。 「USF2 による F(1)F(0) ATP シンターゼ アルファ サブユニット開始要素の転写活性化は、p300 によって媒介されます。」Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 一般科目。1428 ( 2–3 ): 169– 76.土井: 10.1016/s0304-4165(99)00061-6。PMID  10434034。
• Kumari D, Usdin K (2001年2月). 「転写因子USF1、USF2、およびα-Pal/Nrf-1とFMR1プロモーターとの相互作用。脆弱X染色体性精神遅滞症候群への影響」 . The Journal of Biological Chemistry . 276 (6): 4357–64 . doi : 10.1074/jbc.M009629200 . PMID  11058604 .
• Kolonics A、Apáti A、Nahajevszky S、Gáti R、Brózik A、Magocsi M (2002)。 「STAT-5、ERK1/2、およびc-Fosの無秩序な活性化は、骨髄異形成症候群から急性白血病への表現型の変化に寄与している可能性があります。」血液疾患。31 (2): 125–38 .土井: 10.1163/15685590152492936。PMID  11583024。
• Bengtsson SH, Madeyski-Bengtson K, Nilsson J, Bjursell G (2002年7月). 「THP-1単球におけるヒトカルボキシルエステルリパーゼ遺伝子の転写制御：活性化に必要なEボックスは上流の刺激因子1および2に結合する」 . The Biochemical Journal . 365 (Pt 2): 481–8 . doi : 10.1042/BJ20020223 . PMC  1222691. PMID  11945176 .
• Villavicencio EH, Yoon JW, Frank DJ, Füchtbauer EM, Walterhouse DO, Iannaccone PM (2002年4月). 「TWISTとUSFによるヒトGLI1のEボックス協調制御」Genesis . 32 (4): 247–58 . doi : 10.1002/gene.10078 . PMID  11948912 . S2CID  12132097 .
• Moore ML, Park EA, McMillin JB (2003年5月). 「上流刺激因子はPGC-1によるカルニチンパルミトイルトランスフェラーゼIβの発現誘導を抑制する」 . The Journal of Biological Chemistry . 278 (19): 17263–8 . doi : 10.1074/jbc.M210486200 . PMID  12611894 .
• Pickwell GV, Shih H, Quattrochi LC (2003年4月). 「ヒトCYP1A2 5'-フランキング遺伝子内に位置するEボックスと上流刺激因子タンパク質との相互作用は、基礎転写遺伝子活性化に寄与する」.生化学薬理学. 65 (7): 1087–96 . doi : 10.1016/S0006-2952(03)00037-6 . PMID  12663044 .
• Zhu J, Giannola DM, Zhang Y, Rivera AJ, Emerson SG (2003年10月). 「NF-YはUSF1/2と協調してHOXB4の造血発現を誘導する」 . Blood . 102 (7): 2420–7 . doi : 10.1182/blood-2003-01-0251 . PMID  12791656 .

外部リンク

• ファクターブックUSF2