VAC14

VAC14
識別子
エイリアス	VAC14、ArPIKfyve、TAX1BP2、TRX、Vac14、PIKFYVE複合体の構成要素、PIKFYVE複合体のVAC14構成要素
外部ID	オミム: 604632 ; MGI : 2157980 ;ホモロジーン: 6528 ;ジーンカード：VAC14 ; OMA : VAC14 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 16番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 16q22.1-q22.2 始める 70,687,439 bp [ 1 ] 終わり 70,801,160 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 8番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 8 E1|8 57.59 cM 始める 111,345,217 bp [ 2 ] 終わり 1億1144万7030bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 子宮内膜間質細胞 生殖腺 太ももの筋肉 横行結腸粘膜 前頭前皮質 心臓の頂点 肝臓の右葉 前帯状皮質 右前頭葉 甲状腺の右葉 上位の表現 接合子 胚の尾 卵黄嚢 性器結節 二次卵母細胞 胚葉上層 右腎臓 太ももの筋肉 内頸動脈 外頸動脈 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 シグナル伝達受容体の活性 細胞成分 細胞小器官膜 ゴルジ膜 エンドソーム 初期エンドソーム膜 エンドソーム膜 PAS複合体 小胞体 後期エンドソーム膜 膜 細胞内膜小器官 液胞膜の外因性成分 生物学的プロセス ウイルスプロセス シグナル伝達 ホスファチジルイノシトール生合成プロセス 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 55697 234729 アンサンブル ENSG00000103043 ENSMUSG00000010936 ユニプロット Q08AM6 Q80WQ2 RefSeq (mRNA) NM_018052 NM_001351157 NM_146216 RefSeq（タンパク質） NP_060522 NP_001338086 NP_666328 場所（UCSC） 16章: 70.69 – 70.8 Mb 8章: 111.35 – 111.45 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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タンパク質VAC14ホモログはArPIKfyve（PIKfyve関連調節因子）としても知られ、ヒトではVAC14遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

関数

エンドソーム膜中のホスファチジルイノシトール3,5-ビスリン酸（PtdIns(3,5)P2）の含有量は、細胞内輸送小胞の生成または吸収を生じる分裂および融合イベントによって動的に変化する。ArPIKfyveタンパク質は、PtdIns(3,5)P2の濃度を厳密に制御する三分子複合体の足場となる。この複合体の他の構成要素は、PtdIns(3,5)P2合成酵素PIKFYVEと、ヒト遺伝子FIG4 によってコードされるSac1ドメインを含むPtdIns(3,5)P2 5-ホスファターゼSac3である。VAC14はPIKFYVEの活性化因子として機能する。^{[ 5 ] [ 8 ]} VAC14ノックアウトマウスを用いた研究では、VAC14はPIKfyveのPtdIns(3,5)P2産生活性を高めるだけでなく、PIKfyve酵素活性に関連する別の希少ホスホイノシチドであるホスファチジルイノシトール5-リン酸の定常レベルも制御することが示されています。VAC14は、ホスファチジルイノシトール3-リン酸をリン酸化するために働く脂質キナーゼPIKfyve、およびリン酸基を除去する拮抗ホスファターゼFIG4と複合して作用する足場タンパク質であることが分かっています。^{[ 9 ]}

PIKfyveおよびSac3との三量体複合体の形成に加えて、ArPIKfyveは他の多くの相互作用に関与している。ArPIKfyveはPtdIns(3,5)P2特異的ホスファターゼSac3と安定な複合体を形成し、それによってSac3をプロテアソームによる急速な分解から保護する。^{[ 10 ]} ArPIKfyveはカルボキシル末端を介してホモオリゴマーを形成する。しかし、ArPIKfyveホモオリゴマー、ArPIKfyve-Sac3ヘテロダイマー、またはPIKfyve-ArPIKfyve-Sac3ヘテロトリマーのモノマー数は不明である。^{[ 11 ]}ヒトVac14/ArPIKfyveは神経型一酸化窒素合成酵素のPDZ（シナプス後密度）ドメインとも相互作用するが^{[ 12 ]}、この相互作用の機能的意義はまだ不明である。 ArPIKfyveはインスリン制御GLUT4の細胞表面への移行を促進する。^{[ 13 ]}

マウスモデル

VAC14ノックアウトマウスは出生時または出生直後に死亡し、重度の神経変性を呈する。これらのマウスの線維芽細胞では、PtdIns(3,5)P2およびPtdIns(5)Pのレベルが約50%低下する。^{[ 14 ]}マウスのVAC14点突然変異（ロイシン156がアルギニンに置換）は、寿命の短縮（最大3週間）、体格の悪化、脳室の肥大、PtdIns(3,5)P2レベルの50%低下、色素沈着の減少、震え、運動機能障害と関連している。^{[ 15 ]}

臨床的意義

2016年には、この遺伝子の変異によって引き起こされる新たな疾患が発見され、小児発症型線条体黒質変性症（OMIM 617054）と命名されました^{[ 16 ]} 。PIKfyve-VAC14-FIG4複合体は、初期エンドソームから後期エンドソーム/リソソームへの成熟に重要な役割を果たすと考えられています。これらの細胞小器官は、体内でドナー膜細胞から標的膜へ貨物を輸送する小胞輸送において重要な役割を果たしています^{[ 17 ] 。}

参考文献

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2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000010936 – Ensembl、2017年5月
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5. 「Entrez遺伝子：Vac14ホモログ（S. cerevisiae）」。
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10. Ikonomov OC, Sbrissa D, Fligger J, Delvecchio K, Shisheva A (2010年8月). 「ArPIKfyveはSac3タンパク質の存在量とターンオーバーを制御する：シャルコー・マリー・トゥース病4J症候群を引き起こすSac3I41T変異によるこのメカニズムの破壊」 . The Journal of Biological Chemistry . 285 (35): 26760– 26764. doi : 10.1074/jbc.C110.154658 . PMC 2930674. PMID 20630877 .  
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14. Zhang Y, Zolov SN, Chow CY, Slutsky SG, Richardson SC, Piper RC, 他 (2007年10月). 「シグナル伝達脂質ホスファチジルイノシトール3,5-ビスリン酸の調節因子であるVac14の欠損は、マウスにおいて神経変性を引き起こす」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 104 (44): 17518– 17523. Bibcode : 2007PNAS..10417518Z . doi : 10.1073 / pnas.0702275104 . PMC 2077288. PMID 17956977 .  
15. Jin N, Chow CY, Liu L, Zolov SN, Bronson R, Davisson M, et al. (2008年12月). 「VAC14は酵母およびマウスにおけるPI3PとPI(3,5)P(2)の急性相互変換に必須なタンパク質複合体の核を形成する」 . The EMBO Journal . 27 (24): 3221– 3234. doi : 10.1038 / emboj.2008.248 . PMC 2600653. PMID 19037259 .  
16. レンク GM、シマノスカ K、デブスカ＝ヴィエルハーバー G、リザニッチ M、ヴァルチャク A、ベキエシンスカ＝フィガトウスカ M、他。 （2016年7月）。「小児発症神経疾患における VAC14 の両対立遺伝子変異」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。99 (1): 188–194。土井: 10.1016/j.ajhg.2016.05.008。PMC 5005439。PMID 27292112。  
17. Qiu S, Lavallée-Adam M, Côté M (2021年11月). 「BioIDを用いたVac14-Fig4複合体の近接インタラクトームマップ」 . Journal of Proteome Research . 20 (11): 4959– 4973. doi : 10.1021/acs.jproteome.1c00408 . PMID 34554760. S2CID 237615479 .  

さらに読む

• ミレスカンダリ A、リード RL、カシャンチ F、ディットマー J、リー WB、ブレイディ JN (1996 年 4 月)。「ヒトＴ細胞リンパ球向性ウイルスＩ型Ｔａｘ１結合タンパク質をコードするｃＤＮＡクローン、ＴＲＸの単離」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子の構造と発現。1306 (1): 9–13 .土井: 10.1016/0167-4781(96)00012-7。PMID  8611628。