VPS26A

VPS26A
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2FAU
識別子
エイリアス	VPS26A、HB58、Hbeta58、PEP8A、VPS26、VPS26レトロマー複合体成分A、VPS26、レトロマー複合体成分A
外部ID	オミム: 605506 ; MGI : 1353654 ;ホモロジーン: 68420 ;ジーンカード: VPS26A ; OMA : VPS26A - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 10番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 10q22.1 始める 69,123,512 bp [ 1 ] 終わり 69,174,412 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 10番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 10|10 B4 始める 62,291,014 bp [ 2 ] 終わり 62,322,584 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 壁側胸膜 耳下腺 臓側胸膜 胚上皮 太ももの皮膚 ヒップの皮膚 内皮細胞 S状結腸粘膜 口腔 精巣上体尾部 上位の表現 精母細胞 精子細胞 接合子 一次卵母細胞 精細管 積雲細胞 卵黄嚢 二次卵母細胞 骨髄間質 脱落膜 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 細胞成分 細胞質 管状エンドソーム レトロマー複合体 小胞 エンドソーム 初期エンドソーム 膜 リソソーム エンドソーム膜 レトロマー、貨物選択複合体 細胞質 生物学的プロセス タンパク質輸送 逆行輸送、エンドソームからゴルジ体へ マクロオートファジーの調節 細胞内タンパク質輸送 Wntシグナル伝達経路 シグナル伝達 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 9559 30930 アンサンブル ENSG00000122958 ENSMUSG00000020078 ユニプロット O75436 P40336 RefSeq (mRNA) NM_001035260 NM_004896 NM_001318944 NM_001318945 NM_001318946 NM_001113355 NM_133672 NM_001358543 RefSeq（タンパク質） NP_001030337 NP_001305873 NP_001305874 NP_001305875 NP_004887 NP_001106826 NP_598433 NP_001345472 場所（UCSC） 10章: 69.12 – 69.17 Mb 10章: 62.29 – 62.32 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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液胞タンパク質選別関連タンパク質26Aは、ヒトではVPS26A遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

この遺伝子は、液胞タンパク質選別（VPS）遺伝子群に属する。コードされているタンパク質は、レトロマー複合体と呼ばれる大規模な多量体複合体の構成要素であり、エンドソームからトランスゴルジ体ネットワークへのタンパク質の逆行輸送に関与する。この複合体を構成する酵母とヒトのタンパク質間の構造的類似性は、機能の類似性を示唆している。酵母細胞と哺乳類細胞における発現研究は、このタンパク質がレトロマー複合体の中核として機能するVPS35と直接相互作用することを示している。選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする複数の転写産物バリアントが生じる。^{[ 7 ]}

構造

Vps26とアレスチンの構造比較

Vps26は38kDaのサブユニットで、極性コアを持つ2つのローブ構造をしており、輸送アダプターのアレスチンファミリーに似ています。 ^{[ 8 ] [ 9 ]}このフォールドは、フィブロネクチンIII型ドメイントポロジーを持つ2つの関連したβサンドイッチサブドメインで構成されています。2つのドメインは柔軟なリンカーで結合されており、珍しい極性コアによって密接に関連しています。アレスチンは、エンドサイトーシス中にGタンパク質共役受容体（GPCR）をクラスリンに結び付けることで知られる調節タンパク質です。それらは、細胞シグナル伝達と膜輸送において多くの重要な役割を果たしています。^{[ 10 ]} Vps26とアレスチンはどちらも、互いに広範なインターフェースを形成する構造的に関連した2つのβシートドメインで構成され、極性および静電的接触を使用して、リガンド結合のためのドメイン間相互作用を作り出します。しかし、Vps26とアレスチンの両方の間には大きな構造上の違いがあります。 Vps26タンパク質は、クラスリンやAP2と結合する配列を持たない延長したC末端を有しており、そのため、アレスチンで観察されているようなクラスリンやAP2との安定的な分子内接触を形成することができない。さらに、Vps26はGPCRやリン脂質との相互作用において、アレスチンと同様の配列を有していない。^{[ 11 ]}

Vps26Bパラログ

Vps26AとVps26Bの構造的差異

酵母にはVps26種が1つしか存在しないが、哺乳類には2つのVps26パラログ（Vps26AとVps26B）が存在する。^{[ 12 ]}

X 線結晶構造解析により、Vps26A と Vps26B の両方の構造が同様の二葉性 β サンドイッチ構造を共有し、70% の配列相同性を持つことが明らかになりました。^{[ 8 ]}しかし、これら 2 つのパラログは、 N 末端ドメイン内の表面パッチ、N 末端ドメインとC 末端ドメインが出会う頂点領域、および無秩序な C 末端テールで明確に異なります。 Vps26B はこの無秩序なテール内にいくつかの推定上のセリンリン酸化残基を含んでおり、これが Vps26A と Vps26B の違いを調整する潜在的なメカニズムを表している可能性があります。 Bugarcic らによる最近の研究では、Vps26B の C 末端領域のこの無秩序なテールが、Vps26B を含むレトロマーが CI- M6PRと会合できない原因の 1 つであり、最終的には CI-M6PR が分解され、カテプシン D分泌が増加することを指摘しました。^{[ 13 ]}

参考文献

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さらに読む

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