VPS72

VPS72
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 5FUG
識別子
エイリアス	VPS72、CFL1、Swc2、TCFL1、YL-1、YL1、液胞タンパク質選別72ホモログ
外部ID	オミム：600607; MGI : 1202305;ホモロジーン：110905;ジーンカード：VPS72; OMA :VPS72 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体1（ヒト）[1] バンド 1q21.3 始める 151,176,304 bp [1] 終わり 151,195,321 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 3番染色体（マウス）[2] バンド 3|3 F2.1 始める 95,018,333 bp [2] 終わり 95,030,362 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 二次卵母細胞 神経節隆起 心室帯 アキレス腱 腓腹筋 ランゲルハンス島 太ももの筋肉 平滑筋組織 子宮内膜間質細胞 前頭前皮質 上位の表現 心室帯 太ももの筋肉 内側神経節隆起 神経管 接合子 リップ 内頸動脈 外頸動脈 網膜の神経層 胚 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 タンパク質結合 ヒストン結合 細胞成分 核 核質 核の粒子 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス クロマチンリモデリング 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 体性幹細胞集団の維持 転写、DNAテンプレート ヒストン交換 クロマチン組織 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6944 21427 アンサンブル ENSG00000163159 ENSMUSG00000008958 ユニプロット Q15906 Q62481 RefSeq (mRNA) NM_005997 NM_001271087 NM_001271088 NM_009336 RefSeq（タンパク質） NP_001258016 NP_001258017 NP_005988 NP_033362 場所（UCSC） 1章: 151.18 – 151.2 Mb 3章: 95.02 – 95.03 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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液胞タンパク質選別関連タンパク質72ホモログは、ヒトではVPS72遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000163159 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000008958 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 堀川郁夫、田中 浩、湯浅 雄三、鈴木 正治、押村 正治 (1995年3月). 「DNA結合能を持つ核タンパク質をコードするヒト染色体1q21上の新規cDNAとそのマウスホモログの分子クローニング」.生化学および生物理学的研究通信. 208 (3): 999– 1007. doi :10.1006/bbrc.1995.1433. PMID  7702631.
6. 「Entrez Gene: VPS72液胞タンパク質選別72ホモログ（S. cerevisiae）」。

さらに読む

• 丸山 憲治、菅野 誠 (1994年1月). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一 (1997年10月). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• Cai Y, Jin J, Florens L, Swanson SK, Kusch T, Li B, Workman JL, Washburn MP, Conaway RC, Conaway JW (2005年4月). 「哺乳類のYL1タンパク質は、TRRAP/TIP60ヒストンアセチルトランスフェラーゼとSRCAP複合体の共有サブユニットである」. The Journal of Biological Chemistry . 280 (14): 13665–70 . doi : 10.1074/jbc.M500001200 . PMID  15647280.
• ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット・スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Denoeud F, Kapranov P, Ucla C, Frankish A, Castelo R, Drenkow J, Lagarde J, Alioto T, Manzano C, Chrast J, Dike S, Wyss C, Henrichsen CN, Holroyd N, Dickson MC, Taylor R, Hance Z, Foissac S, Myers RM, Rogers J, Hubbard T, Harrow J, Guigó R, Gingeras TR, Antonarakis SE, Reymond A (2007年6月). 「遠位5'転写開始部位の顕著な利用とENCODE領域における多数の追加エクソンの発見」. Genome Research . 17 (6): 746–59 . doi :10.1101/gr.5660607. PMC 1891335.  PMID 17567994  .