VSX2

VSX2
識別子
エイリアス	VSX2、CHX10、HOX10、MCOP2、MCOPCB3、RET1、視覚系ホメオボックス2
外部ID	オミム: 142993; MGI : 88401;ホモロジーン: 7266;ジーンカード：VSX2; OMA :VSX2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 14番染色体（ヒト）[1] バンド 14q24.3 始める 74,239,449 bp [1] 終わり 74,262,738 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 12番染色体（マウス）[2] バンド 12 D1|12 39.28 cM 始める 84,616,536 bp [2] 終わり 84,642,231 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 睾丸 生殖腺 リンパ節 C1セグメント 脳の核 黒質 皮下脂肪組織 視床下部 下垂体前葉 上位の表現 網膜の神経層 レンズ 毛様体 角膜実質 内核層 虹彩 脊髄の腰椎亜節 水晶体上皮 原腸胚 中脳の中心灰白質 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 配列特異的DNA結合 DNA結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 核 生物学的プロセス 多細胞生物の発達 転写の制御、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート 刺激に対する反応 視覚知覚 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 338917 12677 アンサンブル ENSG00000119614 ENSMUSG00000021239 ユニプロット P58304 Q61412 RefSeq (mRNA) NM_182894 NM_001301427 NM_007701 RefSeq（タンパク質） NP_878314 NP_001288356 NP_031727 場所（UCSC） 14章: 74.24 – 74.26 Mb 12章: 84.62 – 84.64 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

視覚系ホメオボックス2は、ヒトではVSX2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000119614 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000021239 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. McAlpine PJ, Shows TB (1990年7月). 「ヒトホメオボックス遺伝子の命名法」. Genomics . 7 (3): 460. doi :10.1016/0888-7543(90)90186-X. PMID  1973146.
6. 「Entrez Gene: CHX10 ceh-10 ホメオドメイン含有ホモログ (C. elegans)」.

さらに読む

• サンガーセンター、ワシントン大学ゲノムシーケンシングセンター（1998年11月）「完全なヒトゲノム配列の解明に向けて」ゲノム研究8 ( 11): 1097–1108 . doi : 10.1101/gr.8.11.1097 . PMID  9847074.
• Ferda Percin E, Ploder LA, Yu JJ, Arici K, Horsford DJ, Rutherford A, et al. (2000年8月). 「網膜ホメオボックス遺伝子CHX10の変異に関連するヒト小眼球症」Nature Genetics . 25 (4): 397– 401. doi :10.1038/78071. PMID  10932181. S2CID  9508022.
• Mikkola I, Bruun JA, Holm T, Johansen T (2001年2月). 「DNA非依存的に異なるホメオドメインタンパク質をリクルートすることによる、ペアドメイン結合部位からのPax6を介したトランス活性化のスーパー活性化」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (6): 4109– 4118. doi : 10.1074/jbc.M008882200 . PMID  11069920.
• Bar-Yosef U, Abuelaish I, Harel T, Hendler N, Ofir R, Birk OS (2004年9月). 「CHX10遺伝子変異はアラブ系およびユダヤ系において非症候性小眼球症／無眼球症を引き起こす」. Human Genetics . 115 (4): 302– 309. doi :10.1007/s00439-004-1154-2. PMID  15257456. S2CID  28981190.
• Dorval KM, Bobechko BP, Ahmad KF, Bremner R (2005年3月). 「ペア様ホメオドメインタンパク質CHX10およびVSX1の転写活性」. The Journal of Biological Chemistry . 280 (11): 10100– 10108. doi : 10.1074/jbc.M412676200 . PMID  15647262.
• Kuiper H, Spötter A, Williams JL, Distl O, Drögemüller C (2005). 「ウシ染色体10q34におけるCHX10、ALDH6A1、およびABCD4の物理マッピング」.細胞遺伝学およびゲノム研究. 109 (4): 533. doi : 10.1159/000084217 . PMID  15909363.
• Dorval KM, Bobechko BP, Fujieda H, Chen S, Zack DJ, Bremner R (2006年1月). 「CHX10は光受容体遺伝子のサブセットを標的とする」. The Journal of Biological Chemistry . 281 (2): 744– 751. doi : 10.1074/jbc.M509470200 . PMID  16236706.
• ファイヤズ・ウル・ハク M、ザイディ SH、アル・ムレイヒ MS、ペルテコバ I、ツイ LC、ティービ AS (2007 年 8 月)。 「カタールの非症候性小眼球症/無眼球症患者におけるCHX10遺伝子の変異」。臨床遺伝学。72 (2): 164–166 .土井:10.1111/j.1399-0004.2007.00846.x。PMID  17661825。S2CID 6218901  。