Vxインサイト

VxInsightは、サンディア国立研究所と科学情報研究所が共同で開発した知識マイニングツールです。大規模データベース内のオブジェクトグループ間の関係性を3Dのランドスケープとして視覚化できます。

ヒリアーらが「先駆的研究」と呼ぶ研究^{[ 1 ]}において、VxInsightはC. elegansの様々な条件下での遺伝子発現（マイクロアレイ）データを解析するために用いられました。VxInsightを用いることで、キムらは遺伝子を一貫した機能を持つ「マウント」にクラスタリングすることができました。また、異なるクラスのトランスポゾン（Tc3やマリナートランスポゾンなど）が発生過程において異なる制御を受けているという発見など、新たな知見を得ることができました。 ^{[ 2 ]}

参考文献

1. C. elegansのゲノム解析：小さな線虫にこれほど多くの遺伝子が詰まっている - Hillier et al. 15 (12): 1651 - Genome Research
2. Kim, Stuart K.; Lund, Jim; Kiraly, Moni; Duke, Kyle; Jiang, Min; Stuart, Joshua M.; Eizinger, Andreas; Wylie, Brian N.; Davidson, George S. (2001-09-14). 「Caenorhabditis elegansの遺伝子発現マップ」. Science . 293 (5537): 2087– 2092. doi : 10.1126/science.1061603 . ISSN  0036-8075 . PMID  11557892 .

外部リンク

• VxInsight - サンディア国立研究所
• InfoVis Cyber​​infrastructure - VxInsight チュートリアル（多数のスクリーンショット付き）
• 科学技術管理のためのVxInsightを使用したドメイン可視化