WDR5

WDR5
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2CNX、2CO0、2G99、2G9A、2GNQ、2H13、2H14、2H68、2H6K、2H6N、2H6Q、2H9L、2H9M、2H9N、2H9P、2O9K、3EG6、3EMH、3MXX、3N0D、 3N0E、3P4F、3PSL、3SMR、3UR4、3UVK、3UVL、3UVM、3UVN、3UVO、4A7J、4CY1、4CY2、4ERQ、4ERY、4ERZ、4ES0、4ESG、4EWR、4GM3、4GM8、4GM9、4GMB、 4IA9、4O45、 4QL1、4Y7R、5EAL、5EAP、5EAR、4QQE、5EAM
識別子
エイリアス	WDR5、BIG-3、CFAP89、SWD3、WDリピート含有タンパク質5、WDリピートドメイン5
外部ID	オミム：609012; MGI : 2155884;ホモロジーン: 59931;ジーンカード：WDR5; OMA :WDR5 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 9番染色体（ヒト）[1] バンド 9q34.2 始める 134,135,365 bp [1] 終わり 134,159,968 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体2（マウス）[2] バンド 2|2 A3 始める 27,405,169 bp [2] 終わり 27,426,547 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 腕の皮膚 左精巣 右精巣 精子 腓腹筋 小脳半球 小脳の右半球 下垂体前葉 二次卵母細胞 生殖腺 上位の表現 二次卵母細胞 一次卵母細胞 接合子 原始的な条線 髄質集合管 胚葉上層 顆粒球 腎小体 体節 心室帯 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ヒストンメチルトランスフェラーゼ活性（H3-K4特異的） ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性（H4-K8特異的） ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性（H4-K5特異的） メチル化ヒストン結合 タンパク質結合 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性（H4-K16特異的） ヒストンリジンN-メチルトランスフェラーゼ活性 ヒストン結合 細胞成分 Set1C/COMPASS複合体 細胞内解剖学的構造 核質 MLL1複合体 MLL3/4複合体 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ複合体 核 ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体 毛様体基底小体 生物学的プロセス 骨格系の発達 転写の制御、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート ヒストンH4-K5のアセチル化 ヒストンH3-K4のメチル化 ヒストンH3のアセチル化 ヒストンH4-K16のアセチル化 ニューロン投射の発達 ヒストンH4-K8のアセチル化 繊毛アセンブリ 翻訳後タンパク質修飾 巨核球分化の制御 クロマチン組織 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 11091 140858 アンサンブル ENSG00000196363 ENSMUSG00000026917 ユニプロット P61964 P61965 RefSeq (mRNA) NM_017588 NM_052821 NM_080848 RefSeq（タンパク質） NP_060058 NP_438172 NP_543124 場所（UCSC） 9章: 134.14 – 134.16 Mb 2章: 27.41 – 27.43 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

WDリピート含有タンパク質5は、ヒトではWDR5遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

この遺伝子はWDリピートタンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。WDリピートは、通常グリシン-ヒスチジン-アスパラギン酸（gly-his）とトリプトファン-アスパラギン酸（trp-asp）で囲まれた約40アミノ酸からなる最小限保存された領域（GH-WD）であり、ヘテロ三量体または多タンパク質複合体の形成を促進する可能性があります。このファミリーのメンバーは、細胞周期の進行、シグナル伝達、アポトーシス、遺伝子制御など、様々な細胞プロセスに関与しています。このタンパク質は7つのWDリピートを含みます。同じタンパク質をコードする選択的スプライシング転写バリアントが同定されています。^[6]

相互作用

WDR5は宿主細胞因子C1 ^{[7] [8]}およびMLLと相互作用することが示されている。^[7]また、長鎖非コードRNA HOTTIPおよびlncRNA NeSTとも相互作用する。^{[9] [10] WDR5は}MYCのクロマチンへのリクルートメント の重要な決定因子である^[11]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000196363 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026917 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Gori F, Divieti P, Demay MB (2001年12月). 「骨芽細胞分化を劇的に促進する新規WD-40リピートタンパク質のクローニングと特性解析」J Biol Chem . 276 (49): 46515–22 . doi : 10.1074/jbc.M105757200 . PMID  11551928.
6. "Entrez Gene: WDR5 WD リピートドメイン 5".
7. 横山明彦; 王中; ジョアンナ・ワイソッカ; ムリンモイ・サンヤル; デボラ・J・オーフィエロ; 北林一生; ウィンシップ・ハー; マイケル・L・クリアリー (2004年7月). 「白血病プロトオンコプロテインMLLはメニンとSET1様ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体を形成し、Hox遺伝子発現を制御する」Mol. Cell. Biol . 24 (13): 5639–49 . doi :10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004. ISSN  0270-7306. PMC 480881. PMID 15199122  . 
8. Wysocka, Joanna; Myers Michael P; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Herr Winship (2003年4月). 「ヒトSin3脱アセチル化酵素とトリソラックス関連Set1/Ash2ヒストンH3-K4メチルトランスフェラーゼは、細胞増殖因子HCF-1によって選択的に結合される」. Genes Dev . 17 (7): 896– 911. doi :10.1101/gad.252103. ISSN  0890-9369. PMC 196026. PMID  12670868 . 
9. Wells, Alexandria C.; Pobezinskaya, Elena L.; Pobezinsky, Leonid A. (2020年4月). 「CD8 T細胞生物学における非コードRNA」. Molecular Immunology . 120 : 67– 73. doi :10.1016/j.molimm.2020.01.023. ISSN  1872-9142. PMC 7093237. PMID  32085976 . 
10. Wang KC, Yang YW, Liu B, Sanyal A, Corces-Zimmerman R, Chen Y, et al. (2011). 「長鎖非コードRNAが活性クロマチンを維持し、ホメオティック遺伝子発現を調整する」Nature . 472 (7341): 120–4 . Bibcode :2011Natur.472..120W. doi :10.1038/nature09819. PMC 3670758. PMID  21423168 . 
11. Thomas, LR; Tansey, WP (2015). 「WDR5との相互作用はMYCによる標的遺伝子認識と腫瘍形成を促進する」. Molecular Cell . 58 (3): 1– 13. doi :10.1016/j.molcel.2015.02.028. PMC 4427524. PMID  25818646 . 

さらに読む

• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, et al. (2003). 「ヒトSin3脱アセチル化酵素とトリソラックス関連Set1/Ash2ヒストンH3-K4メチルトランスフェラーゼは、細胞増殖因子HCF-1によって選択的に結合される」. Genes Dev . 17 (7): 896– 911. doi :10.1101/gad.252103. PMC 196026.  PMID 12670868  .
• Gori F, Demay MB (2004). 「新規WD-40リピートタンパク質BIG-3は成長中の成長板で発現し、in vitroで軟骨細胞分化を促進する」.内分泌学. 145 (3): 1050–4 . doi : 10.1210/en.2003-1314 . PMID  14657013.
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• 横山 明、王 哲也、ワイソッカ ジュン、他 (2004). 「白血病プロトオンコプロテインMLLはメニンとSET1様ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体を形成し、Hox遺伝子発現を制御する」Mol. Cell. Biol . 24 (13): 5639–49 . doi :10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC  480881. PMID  15199122 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID 15489334  .
• Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). 「核小体プロテオームダイナミクス」. Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Wysocka J, Swigut T, Milne TA, et al. (2005). 「WDR5はヒストンH3のK4メチル化と会合し、H3のK4メチル化と脊椎動物の発生に必須である」. Cell . 121 (6): 859–72 . doi : 10.1016/j.cell.2005.03.036 . PMID  15960974. S2CID  17521631.
• Dou Y, Milne TA, Tackett AJ, et al. (2005). 「H3 K4メチルトランスフェラーゼMLL1とH4 K16アセチルトランスフェラーゼMOFの物理的結合と協調機能」. Cell . 121 (6): 873–85 . doi : 10.1016/j.cell.2005.04.031 . PMID  15960975. S2CID  14717470.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Gori F, Friedman L, Demay MB (2006). 「新規WDリピートタンパク質Wdr5は、生体内で骨芽細胞および軟骨細胞の分化を制御する」. Journal of Musculoskeletal & Neuronal Interactions . 5 (4): 338–9 . PMID  16340128.
• Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). 「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性疾患におけるタンパク質間相互作用ネットワーク」. Cell . 125 (4): 801–14 . doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Ruthenburg AJ, Wang W, Graybosch DM, et al. (2006). 「MLL1複合体のWDR5モジュールによるヒストンH3の認識と提示」Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (8): 704–12 . doi :10.1038/nsmb1119. PMC 4698793.  PMID 16829959  .
• Couture JF, Collazo E, Trievel RC (2006). 「WD40タンパク質WDR5によるヒストンH3の分子認識」Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (8): 698– 703. doi :10.1038/nsmb1116. PMID  16829960. S2CID  26165068.
• Dou Y, Milne TA, Ruthenburg AJ, et al. (2006). 「MLL1 H3K4メチルトランスフェラーゼ活性のコア成分による制御」Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (8): 713–9 . doi :10.1038/nsmb1128. PMID  16878130. S2CID  12849159.
• Schuetz A, Allali-Hassani A, Martín F, et al. (2006). 「WDR5によるヒストンH3の分子認識と提示の構造的基盤」EMBO J. 25 ( 18): 4245–52 . doi :10.1038/sj.emboj.7601316. PMC  1570438. PMID  16946699 .
• Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948.  PMID 17353931  .
• Bryan AF, Wang J, Howard GC, et al. (2020). 「WDR5はタンパク質合成遺伝子発現の保存された制御因子である」. Nucleic Acids Research . 48 (6): 2924– 2941. doi : 10.1093/nar/gkaa051 . PMC  7102967. PMID  31996893 .