WDリピートドメインホスホイノシチド相互作用タンパク質2は、ヒトではWIPI2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ]
機能
WD40リピートタンパク質は、多くの重要な生物学的機能の重要な構成要素です。同時かつ可逆的なタンパク質間相互作用のためのβプロペラプラットフォームを提供することで、多タンパク質複合体の組み立てを制御します。WIPI2などのWD40リピートタンパク質のWIPIサブファミリーのメンバーは、7枚羽根のプロペラ構造を持ち、リン脂質との相互作用のための保存されたモチーフを含んでいます。[ 5 ] [ 6 ]
WIPI2は、Atg21ではなくAtg18の哺乳類ホモログであり、近縁タンパク質であるWIPI1も同様です。WIPI2 mRNAは、一般的に使用されるいくつかの実験用細胞株(HEK293A、HeLa、A431)およびいくつかの癌細胞株で容易に検出されますが、WIPI1の発現は癌細胞に限定されています(ただし、多くのヒト組織でも検出されます)。
Atgタンパク質はオートファジーを制御します。オートファジーは細胞の健康維持、栄養欠乏期の生存に必要なリソソーム分解経路であり、がん、神経変性、そして多様な病原体に対する免疫応答にも関与しています。 [ 7 ] WIPI2は、DFCP-1、ULK-1、Atg16とともに、形成中のオートファゴソームに早期にリクルートされ、Atg8(LC3)の脂質化を正に制御します。これはWIPI1には当てはまりません。WIPI2はリソソーム制御において重要な役割を果たすことが示されています。
参照
参考文献
* Polson HE, de Lartigue J, Rigden DJ, Reedijk M, Urbé S, Clague MJ, Tooze SA (2010). 「哺乳類Atg18 (WIPI2) はオメガソームアンカー型ファゴフォアに局在し、LC3の脂質化を正に制御する」 .オートファジー. 6 (4): 506–22 . doi : 10.4161/auto.6.4.11863 . PMID 20505359 .
さらに詳しい情報
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). 「2006年のLIFEdbデータベース」. Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8. doi : 10.1093/nar/ gkj139 . PMC 1347501. PMID 16381901
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeomeから生物学へ:機能ゲノミクスパイプライン」 . Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930. PMID 15489336 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)の現状、品質、および拡大」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA, et al. (2003). 「ヒト7番染色体のDNA配列」 . Nature . 424 (6945): 157–64 . Bibcode : 2003Natur.424..157H . doi : 10.1038/nature01782 . PMID 12853948 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウスの完全長cDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). 「大規模cDNAシークエンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」 . EMBO Rep . 1 (3): 287–92 . doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ作成に向けて:ヒトcDNAをコードする新規完全タンパク質500種の配列決定と解析」. Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」 . Genome Res . 10 (11): 1788–95 . doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .
- Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, et al. (2000). 「比較プロテオミクスによるCaenorhabditis elegansにおいて進化的に保存されている新規ヒト遺伝子の同定」 . Genome Res . 10 (5): 703–13 . doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876. PMID 10810093 .
- <メタデータを入力するには、欠落している最初の著者を追加してください。> (1999). 「完全なヒトゲノム配列に向けて」 . Genome Res . 8 (11): 1097–108 . doi : 10.1101/gr.8.11.1097 . PMID 9847074 .