ウィリアム・グリーンリーフ（アメリカの科学者）
アメリカの遺伝学者、生物物理学者（1979年生まれ）
ウィリアム・J・グリーンリーフ
生まれる
ウィリアム・ジェームズ・グリーンリーフ

（1979年12月24日）1979年12月24日（46歳）
ミネソタ州ロチェスター、米国
教育
知られているATACシーケンス
受賞歴NIH所長パイオニア賞、デイモン・ラニヨン・フェローシップ
科学者としてのキャリア
フィールドゲノミクス、エピゲノミクス、生物物理学
機関スタンフォード大学
論文転写とRNAフォールディングの高解像度単一分子測定 （2008）
博士課程の指導教員スティーブン・ブロック
その他の学術アドバイザーX. サニー・シー
Webサイトグリーンリーフラボ

ウィリアム・J・グリーンリーフ（1979年12月24日生まれ）は、アメリカの分子生物学者、生物物理学者、発明家であり、スタンフォード大学医学部の遺伝学教授です。彼の研究は、遺伝子制御とクロマチン構造を研究するためのハイスループットシーケンシングと光学顕微鏡法に焦点を当てています。グリーンリーフは、自身の研究室で開発された、広く使用されているエピゲノム解析法であるATAC-seqの共同発明者でもあります。[1] [2] [3] [4]

バイオグラフィー

グリーンリーフはミネソタ州ロチェスターで育った。[5]彼はメイヨー高校に通い、夏にはメイヨークリニックで研究助手として働き、超音波を介した遺伝子導入に関するプロジェクトで1998年のウェスティングハウスサイエンスタレントサーチで6位を獲得した。[5] [6] [7]彼は2002年にハーバード大学で物理学の学士号を優秀な成績で取得して卒業し、その後、ケンブリッジ大学トリニティカレッジでゲイツケンブリッジ奨学生として働き、2003年に同大学からコンピューターサイエンスの学位を取得した。 [8]その後、グリーンリーフはスタンフォード大学の応用物理学博士課程に入学し、スティーブンブロックの研究室に加わり、 NSF GRFPの資金提供を受けた。[6]

グリーンリーフは、単一分子生物物理学に関する博士号の研究成果をNature、Science、Cellに発表した論文の筆頭著者または共同筆頭著者であり、指導教官のブロックはこの業績を「完璧な三連単著」、あるいはPhysical Review Lettersでの共同筆頭著者としての論文を含めれば「完璧な四連単著」と呼んだ。[9]グリーンリーフは2008年1月にスタンフォード大学で応用物理学の博士号を取得した。 [8] 2008年から2011年まで、ハーバード大学のX.サニー・ジー研究室の博士研究員として、超並列シーケンシング・バイ・シンセシスの手法開発に取り組んだ。[8] 2011年、グリーンリーフはスタンフォード大学に戻り、遺伝学科の助教授となり、学際的なベックマン分子遺伝子医学センター内に自身の研究室を設立した。[8] [6]彼は2017年にスタンフォード大学から終身在職権を授与された。 [8]

研究

グリーンリーフ博士は博士課程在学中、遺伝子転写とタンパク質折り畳みに関与する力を測定するための単分子法の研究に取り組みました。ブロック研究室の同僚と共同で、DNAに沿ってRNAポリメラーゼが「移動する」様子をオングストローム分解能で測定できる光トラッピングシステムを開発しました。[10]このシステムを用いて、特定のヌクレオチド塩基の濃度が制限されている場合、RNAポリメラーゼはその塩基に対応する配列位置でより長い時間停止するという観察に基づき、 DNA配列決定法を開発しました。 [11]

スタンフォード大学のグリーンリーフ研究室は、遺伝子調節とクロマチン構造を研究するためのハイスループットシーケンシングと光学顕微鏡法に重点を置いてきました。[8] 2013年に、グリーンリーフ研究室はハワード・Y・チャン研究室と共同で、ゲノムワイドでクロマチンアクセシビリティをアッセイする方法であるATAC-seqを導入しました。 [1] [2] ATAC-seqは、 in vitro転位反応において、活性（オープン）クロマチンは、過剰活性トランスポザーゼによる転位に対して、不活性クロマチンに比べて非常に濃縮されているという原理に基づいています。[3] [4]さらに、ATAC-seqから、周囲のDNAと比較して転位が減少する局所的な「フットプリント」に基づいて、ヌクレオソームと結合した転写因子のゲノム位置を推測することができます。[3] [4] 2019年以来、グリーンリーフの研究室とセルジュ・P・パスカの研究室は共同でATAC-seqを用いてヒト脳オルガノイドのクロマチンダイナミクスを研究してきた。[12]

グリーンリーフ研究室の他の研究は、生体高分子相互作用の単一分子測定に重点を置いています。研究室は、イルミナDNAシーケンサーの分解と再利用 [13]で注目を集め、抗FLAG抗体によるFLAGエピトープ結合[14]、アルゴノートタンパク質による標的RNA結合[15]、CRISPR関連タンパク質による標的DNA結合[16 ]の大規模解析を可能にしました。 2024年、グリーンリーフ研究室は、転写因子結合ミクロ状態を定量的に予測し、それらのミクロ状態と遺伝子発現を関連付けるための熱力学および速度論モデルの開発について論文をNature誌に発表しました[17]。

バイオテクノロジーのスタートアップ

グリーンリーフはバイオテクノロジーのスタートアップ 企業でいくつかの役職を歴任しています。2013年、グリーンリーフはチャンと2人のスタンフォード大学の元学生と共に、スタンフォード大学のバイオテクノロジーのスピンアウト企業であるエピノミクスを共同設立しました。エピノミクスはライトスピードとファウンダーズファンドからベンチャーキャピタルを調達し、 2018年に10x Genomicsに買収されました。 [18] 2019年、グリーンリーフは自身の研究室で開発されたプロテオミクス技術を商品化するスピンアウト企業であるプロティリオン・バイオサイエンスを共同設立しました。プロティリオンは2022年12月にARCHベンチャーパートナーズとイルミナベンチャーズが主導するシリーズAの資金調達を発表しました。 [19] 2025年現在、グリーンリーフはガーダントヘルスとウルティマゲノミクスの科学顧問を務めています。[17] [20]

賞と表彰

グリーンリーフは、2006年にARCS奨学生、2009年にデイモン・ラニヨン・フェロー、2011年にリタ・アレン奨学生、 2014年にバクスター財団ファカルティ・フェロー、2017年にE・ブライト・ウィルソン賞を受賞しました。[8] [6]彼は2017年から2023年までチャン・ザッカーバーグ・イニシアチブ・フェローであり、2023年からはアーク研究所イノベーション調査員を務めています。[8] [6] [21]

グリーンリーフは、2023年度NI​​H所長 パイオニア賞の受賞者8名のうちの1名であった。この賞は毎年、「生物医学、社会科学、行動研究における主要な課題に対して先駆的なアプローチを開発した」「優れた創造性の記録」を持つ約10名の米国の科学者に授与される。[8] [6] [22]

参考文献

  1. ^ ab Buenrostro JD, Giresi PG, Zaba LC, Chang HY, Greenleaf WJ (2013年10月6日). 「オープンクロマチン、DNA結合タンパク質、ヌクレオソーム位置の高速かつ高感度なエピゲノムプロファイリングのためのネイティブクロマチンの転位」Nature Methods 10 : 1213–1218 . 2025年10月26日閲覧。
  2. ^ ab 米国特許US10619207B2、「個人エピゲノミクスのためのネイティブクロマチンへの転置」、2020年4月14日発行、リーランド・スタンフォード・ジュニア大学理事会に譲渡 
  3. ^ abc 「ATAC-Seq（トランスポザーゼアクセス可能なクロマチンのシーケンシングによるアッセイ）」イルミナ. 2025年10月26日閲覧。
  4. ^ abc 「ATAC-Seqの理解と使用に関する完全ガイド」Active Motif . 2025年10月26日閲覧。
  5. ^ ab 「Science Talent Search 1998」. Society for Science . 2025年10月26日閲覧。
  6. ^ abcdef 「履歴書 - ウィリアム・ジェームズ・グリーンリーフ」 。 2025年10月26日閲覧。
  7. ^ Greenleaf WJ, Bolander ME, Sarkar G, Goldring MB, Greenleaf JF (1998年5月). 「人工キャビテーション核は音響誘導細胞トランスフェクションを大幅に促進する」 . Ultrasound in Medicine & Biology . 24 (4): 587– 595. doi :10.1016/S0301-5629(98)00003-9 . 2025年10月26日閲覧。
  8. ^ abcdefghi 「ウィリアム・グリーンリーフ」。スタンフォード・メディシンCAPプロファイル。2025年10月26日閲覧。
  9. ^ Anna Azvolinsky (2015年5月31日). 「ウィリアム・グリーンリーフ：生物理学のために生まれた」. The Scientist . 2025年10月26日閲覧。
  10. ^ Abbondanzieri EA, Greenleaf WJ, Shaevitz JW, Landick R, Block SM (2005年11月13日). 「RNAポリメラーゼによる塩基対ステッピングの直接観察」. Nature . 438 : 460–465 . 2025年10月26日閲覧。
  11. ^ Greenleaf WJ, Block SM (2006年8月11日). 「RNAポリメラーゼを用いた単一分子モーションベースDNAシーケンシング」. Science . 313 (5788): 801. doi :10.1126/science.11​​30105. 2025年10月26日閲覧。
  12. ^ Trevino AE、Sinnott-Armstrong N、Andersen J、Yoon SJ、Huber N、Pritchard JK、Chang HY、Greenleaf WJ、Pařca SP (2020 年 1 月 24 日)。 「ヒト前脳発達モデルにおけるクロマチンアクセシビリティダイナミクス」。科学。367 (6476)。土井：10.1126/science.aay1645。PMC 7313757 。2025 年10 月 26 日に取得。 
  13. ^ Jeffrey M. Perkel (2018年7月24日). 「古いDNAシーケンサーに新しい技を教えるハッカーたち」Nature . 2025年10月26日閲覧。
  14. ^ Layton CJ, McMahon PL, Greenleaf WJ (2019年3月7日). 「ハイスループットDNAシーケンシングチップを用いた大規模定量タンパク質アッセイ」. Molecular Cell . doi :10.1016/j.molcel.2019.02.019. PMC 7001660. 2025年10月26日閲覧。 
  15. ^ Becker WJ, Ober-Reynolds B, Jouraleva K, Jolly SM, Zamore PD, Greenleaf WJ (2019年8月22日). 「ハイスループット解析によりAGO2による標的RNAへの結合と切断の法則が明らかに」. Molecular Cell . 75 (4): 741– 755. doi :10.1016/j.molcel.2019.06.012. PMC 6823844. 2025年10月26日閲覧. 
  16. ^ Boyle EA, Andreasson JL, Chircus LM, Sternberg SH, Wu MJ, Guegler CK, Doudna JA, Greenleaf WJ. 「ハイスループット生化学プロファイリングによるdCas9のオフターゲット結合および解離の配列決定因子の解明」. PNAS . 114 (21): 5461– 5466. doi :10.1073/pnas.1700557114 . 2025年10月26日閲覧。
  17. ^ ab ダウティ BR、ヒンクス MM、シャエペ JM、マリノフ GK、トゥルム AR、リオスマルティネス C、パークス BE、タン Y、マークランド E、デュボカニン D、ビントゥ L、グリーンリーフ WJ (2024 年 11 月 20 日)。「単一分子の状態は転写因子の結合と遺伝子発現を結びつける」。自然(636): 745–754。土井:10.1038/s41586-024-08219-w。
  18. ^ 「10x GenomicsがEpinomicsを買収」PR Newswire . 2025年10月26日閲覧。
  19. ^ 「Protillion Biosciences、ARCH Venture PartnersとIllumina Venturesの主導で1,800万ドルの資金調達を実施」2022年12月19日。 2025年10月26日閲覧。
  20. ^ 「Guardant Health、Shield多発がん検出検査が10種類の腫瘍タイプで優れた性能を発揮したことを示すデータを発表」Yahoo Finance 2025年4月29日。
  21. ^ 「Arc Innovation Investigator & Ignite Awards」. Arc Institute . 2025年10月26日閲覧。
  22. ^ 「NIH Director's Pioneer Award」.国立衛生研究所. 2025年10月26日閲覧。
  • Google Scholarに索引付けされたウィリアム・グリーンリーフの出版物
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