ミミズウオ科はかつてはミクロデスミダエ科に分類されていたミクロデスミナエ亜科 に属し、現在は中間の階級なくハゼ科ハゼ目にも分類されている。[ 1 ] [ 2 ]
浅い熱帯海域(海水と汽水の両方)に生息し、河口の泥の中に潜っていることが多い。小型魚で、最大種でも体長約12cmにしかならない。[ 3 ]