XRN1（遺伝子）

XRN1
識別子
別名	XRN1、SEP1、5'-3'エキソリボヌクレアーゼ1、Xrn1
外部ID	OMIM : 607994 ; MGI : 891964 ; HomoloGene : 5894 ; GeneCards : XRN1 ; OMA : XRN1 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 3番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 3q23 開始 142,306,607 bp [ 1 ] 終了 142,448,062 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） 染色体 9番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 9|9 E3.3 開始 95,836,813 bp [ 2 ] 終了 95,939,856 bp [ 2 ]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している 膵臓上皮細胞 アキレス腱 胚上皮 臓側胸膜 壁側胸膜 脛骨 骨髄細胞 歯肉上皮 内皮細胞 眼瞼結膜 最もよく発現している 胚尾部 卵丘細胞 吻側遊走路 胸腺 生殖結節 接合子 松果体 二次卵母細胞 精管 顆粒球 その他の参照発現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 タンパク質結合 核酸結合 ヌクレアーゼ活性 エキソヌクレアーゼ活性 加水分解酵素活性 RNA結合 グアニン四重鎖RNA結合 グアニン四重鎖DNA結合 5'-3'エキソリボヌクレアーゼ活性 テロメラーゼRNA結合 5'-3'エキソヌクレアーゼ活性 細胞成分 膜 細胞膜 核 細胞質 細胞質 樹状突起 細胞体 シナプス P体 生物学的プロセス mRNAの安定性の調節 rRNAの分解プロセス 核mRNA監視 ヒストンmRNAの分解プロセス 翻訳の否定的な規制 テストステロンへの反応 シクロヘキシミドへの細胞反応 RNAホスホジエステル結合の加水分解、エキソヌクレアーゼ分解 ピューロマイシンに対する細胞応答 テロメラーゼを介したテロメア維持の負の制御 核転写されたmRNAの分解プロセス 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス Entrez 54464 24127 アンサンブル ENSG00000114127 ENSMUSG00000032410 ユニプロット Q8IZH2 P97789 RefSeq (mRNA) NM_001042604 NM_001282857 NM_001282859 NM_019001 NM_011916 NM_001311130 RefSeq（タンパク質） NP_001269786 NP_001269788 NP_061874 該当なし 場所（UCSC） 3番目の文字: 142.31～142.45 MB 9番目の文字: 95.84～95.94 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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5′-3′エキソリボヌクレアーゼ1（Xrn1）は、ヒトではXRN1遺伝子によってコードされるタンパク質である。Xrn1はRNAを5′から3′方向に加水分解する。^{[ 5 ] [ 6 ]}

機能

この遺伝子は5'-3'エキソヌクレアーゼファミリーのメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は、複製依存性ヒストンmRNA分解に関与している可能性があり、mRNAデキャッピングタンパク質4のエンハンサーと直接相互作用します。mRNA代謝に加えて、酵母中の同様のタンパク質は、転写、翻訳、相同組換え、減数分裂、テロメア維持、微小管組み立てなど、核および細胞質のさまざまな機能に関与していることが示唆されています。この遺伝子の変異は骨肉腫と関連しており、コードされているタンパク質が骨形成にも役割を果たしている可能性を示唆しています。選択的スプライシングにより、複数の転写産物バリアントが生じます

参照

• Xrn2

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000114127 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032410 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Mullen TE, Marzluff WF (2008年1月). 「ヒストンmRNAの分解には、オリゴウリジル化とそれに続く脱キャップ、そして5'から3'および3'から5'へのmRNAの同時分解が必要である。」「 .遺伝子と発達. 22 (1 ) : 50– 65. doi : 10.1101/gad.1622708 . PMC  2151014. PMID  18172165 .
6. 「Entrez遺伝子：5'-3'エキソリボヌクレアーゼ1」。

さらに読む

• Bashkirov VI, Scherthan H, Solinger JA, Buerstedde JM, Heyer WD (1997年2月). 「G4テトラプレックス基質を優先的に選択するマウス細胞質エキソリボヌクレアーゼ（mXRN1p）」 . The Journal of Cell Biology . 136 (4): 761–73 . doi : 10.1083/jcb.136.4.761 . PMC  2132493. PMID  9049243 .
• Ingelfinger D, Arndt-Jovin DJ, Lührmann R, Achsel T (2002年12月). 「ヒトLSm1-7タンパク質は、mRNA分解酵素Dcp1/2およびXrnlと、異なる細胞質フォーカスにおいて共局在する」 . RNA . 8 ( 12): 1489–501 . doi : 10.1017/S1355838202021726 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F270-9 . PMC  1370355. PMID  12515382 .
• Braun JE, Truffault V, Boland A, Huntzinger E, Chang CT, Haas G, Weichenrieder O, Coles M, Izaurralde E (2012年12月). 「DCP1とXRN1の直接的な相互作用がmRNAのデキャッピングと5'エキソヌクレアーゼによる分解を結びつける」Nature Structural & Molecular Biology . 19 (12): 1324–31 . doi : 10.1038/nsmb.2413 . PMID  23142987 . S2CID  1134057 .
• Li Y, Masaki T, Yamane D, McGivern DR, Lemon SM (2013年1月). 「C型肝炎ウイルス複製制御におけるmiR-122と5’エキソヌクレアーゼXrn1の競合的および非競合的活性」 .米国科学アカデミー紀要. 110 (5 ) : 1881–6 . doi : 10.1073/pnas.1213515110 . PMC  3562843. PMID  23248316 .
• Li Y, Yamane D, Lemon SM (2015年5月). 「C型肝炎ウイルスの複製を抑制する5’エキソリボヌクレアーゼXrn1およびXrn2の役割の解明」 . Journal of Virology . 89 (9): 4857–65 . doi : 10.1128/JVI.03692-14 . PMC  4403451. PMID 25673723  .
• Burgess HM, Mohr I (2015年3月). 「細胞内5'-3' mRNAエキソヌクレアーゼXrn1は二本鎖RNAの蓄積と抗ウイルス応答を制御する」. Cell Host & Microbe . 17 (3): 332– 44. doi : 10.1016/j.chom.2015.02.003 . PMC  4826345. PMID 25766294  .
• Ding M, Lin B, Li T, Liu Y, Li Y, Zhou X, Miao M, Gu J, Pan H, Yang F, Li T, Liu XY, Li R (2015年4月). 「前立腺腺癌細胞および神経内分泌様前立腺癌細胞におけるmiR-204とその標的XRN1の二重かつ相反する増殖制御機能」 . Oncotarget . 6 ( 10): 7686–700 . doi : 10.18632/oncotarget.3480 . PMC  4480709. PMID  25797256 .
• ブラスコ＝モレノ B、デ・カンポス＝マタ L、ベッチャー R、ガルシア＝マルティネス J、ユングフライシュ J、ネディアルコバ DD、チャットパディヤ S、ガス ME、オリバ B、ペレス＝オルティン JE、ライデル SA、チョーデル M、ディエス J (2019 年 3 月)。「エキソヌクレアーゼ Xrn1 は、膜タンパク質をコードする mRNA の転写と翻訳を活性化します。 」ネイチャーコミュニケーションズ。21 (10): 1298。Bibcode : 2019NatCo..10.1298B。土井: 10.1038/s41467-019-09199-6。PMC  6428865。PMID  30899024。

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