ゼブ1

ゼブ1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2E19
識別子
エイリアス	ZEB1、ジンクフィンガー E-box バインディング ホメオボックス 1、AREB6、BZP、DELTAEF1、FECD6、NIL2A、PPCD3、TCF8、ZFHEP、ZFHX1A
外部ID	オミム：189909; MGI : 1344313;ホモロジーン: 31779;ジーンカード：ZEB1; OMA :ZEB1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 10番染色体（ヒト）[1] バンド 10p11.22 始める 31,318,495 bp [1] 終わり 31,529,814 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 18番染色体（マウス）[2] バンド 18 4.42 cM|18 A1 始める 5,591,860 bp [2] 終わり 5,775,467 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 アキレス腱 結腸上皮 脱落膜 視神経 臀筋 内皮細胞 腹直筋の骨格筋組織 上腕二頭筋 上腕二頭筋腱 上腕二頭筋の骨格筋組織 上位の表現 内頸動脈 黒質 運動ニューロン 外頸動脈 半月弁 頸動脈小体 上行大動脈 吻側回遊流 視交叉上核 生殖腺隆起 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 転写コリプレッサー活性 転写コアクチベーター活性 亜鉛イオン結合 転写因子結合 クロマチン結合 金属イオン結合 タンパク質結合 核酸結合 DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的 DNA結合転写因子活性 Eボックスバインディング DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 転写調節因子複合体 核 核質 細胞質 生物学的プロセス パターン仕様プロセス 胚骨格系の形態形成 平滑筋細胞の分化の調節 動物の臓器の発達 細胞分化 三半規管の形態形成 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 転写、DNAテンプレート 神経系の発達 トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路の調節 胸腺におけるT細胞分化の調節 中枢神経系の発達 軟骨の発達 間葉系細胞の増殖の調節 胚のカメラ型眼の形態形成 蝸牛の形態形成 免疫反応 胚の形態形成 アミノ酸刺激に対する細胞反応 細胞集団の増殖 上皮細胞分化の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 細胞集団増殖の負の調節 転写の負の制御、DNAテンプレート ニューロン分化の正の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 内皮細胞分化の負の制御 サイトカインを介したシグナル伝達経路 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6935 21417 アンサンブル ENSG00000148516 ENSMUSG00000024238 ユニプロット P37275 Q64318 RefSeq (mRNA) NM_001128128 NM_001174093 NM_001174094 NM_001174095 NM_001174096 NM_030751 NM_001323638 NM_001323641 NM_001323642 NM_001323643 NM_001323644 NM_001323645 NM_001323646 NM_001323647 NM_001323648 NM_001323649 NM_001323650 NM_001323651 NM_001323652 NM_001323653 NM_001323654 NM_001323655 NM_001323656 NM_001323657 NM_001323658 NM_001323659 NM_001323660 NM_001323661 NM_001323662 NM_001323663 NM_001323664 NM_001323665 NM_001323666 NM_001323671 NM_001323672 NM_001323673 NM_001323674 NM_001323675 ​​NM_001323676 NM_001323677 NM_001323678 NM_011546 NM_001360981 NM_001360982 RefSeq（タンパク質） NP_001121600 NP_001167564 NP_001167565 NP_001167566 NP_001167567 NP_001310567 NP_001310570 NP_001310571 NP_001310572 NP_001310573 NP_001310574 NP_001310575 NP_001310576 NP_001310577 NP_001310578 NP_001310579 NP_001310580 NP_001310581 NP_001310582 NP_001310583 NP_001310584 NP_001310585 NP_001310586 NP_001310587 NP_001310588 NP_001310589 NP_001310590 NP_001310591 NP_001310592 NP_001310593 NP_001310594 NP_001310595 NP_001310600 NP_001310601 NP_001310602 NP_001310603 NP_001310604 NP_001310605 NP_001310606 NP_001310607 NP_110378 NP_035676 NP_001347910 NP_001347911 場所（UCSC） 10章: 31.32 – 31.53 Mb 18章: 5.59 – 5.78 MB PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ジンクフィンガーEボックス結合ホメオボックス1は、ヒトではZEB1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

ZEB1（以前はTCF8として知られていた）は、IL2転写開始部位の5'末端から100ヌクレオチド離れた負の調節ドメインに結合してTリンパ球特異的IL2遺伝子の発現を抑制するジンクフィンガーおよびホメオドメイン 転写因子をコードしている。^{[7] [6]} ZEB1とその哺乳類パラログZEB2は、ホメオドメイン転写因子のZF（ジンクフィンガー）クラス内のZebファミリーに属している。ZEB1タンパク質は7つのジンクフィンガーと1つのホメオドメインを有する。^[8]ホメオドメインの構造を右に示している。

臨床的意義

この遺伝子の変異は、後部多形性角膜ジストロフィー3と関連している。ZEB1はEカドヘリンの発現を低下させ、乳癌やその他の癌において上皮間葉転換を誘導する^[9]。最近の研究では、肺癌の浸潤性と転移の発達に寄与する役割が示唆されている^[10] 。ZEB1の過剰発現は、いくつかの種類の癌における再発および予後不良の潜在的な危険因子として特定されている^{[11] 。}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000148516 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000024238 – Ensembl、2017年5月
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4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Williams TM, Montoya G, Wu Y, Eddy RL, Byers MG, Shows TB (1992年9月). 「ジンクフィンガータンパク質（Nil-2-a）をコードするTCF8遺伝子はヒト染色体10p11.2に存在する」. Genomics . 14 (1): 194–6 . doi :10.1016/S0888-7543(05)80307-6. PMID  1427828.
6. Williams TM, Moolten D, Burlein J, Romano J, Bhaerman R, Godillot A, Mellon M, Rauscher FJ, Kant JA (1991年12月). 「IL-2遺伝子発現を阻害するジンクフィンガータンパク質の同定」. Science . 254 (5039): 1791–4 . Bibcode :1991Sci...254.1791W. doi :10.1126/science.1840704. PMID:  1840704.
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10. Liu W, Huang YJ, Liu C, Yang YY, Liu H, Cui JG, Cheng Y, Gao F, Cai JM, Li BL (2014年4月). 「TBK1阻害は、GSK-3βの活性化とZEB1の抑制を介して、A549ヒト肺癌細胞の放射線誘発性上皮間葉転換を減弱させる」. Laboratory Investigation; A Journal of Technical Methods and Pathology . 94 (4): 362– 70. doi : 10.1038/labinvest.2013.153 . PMID  24468793.
11. Lu J, Fei F, Wu C, Mei J, Xu J, Lu P (2022年9月). 「ZEB1：腫瘍転移時の免疫逃避の触媒」. Biomed Pharmacother . 153 113490. doi : 10.1016/j.biopha.2022.113490 . PMID  36076506.

さらに読む

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外部リンク

• ファクターブックZEB1