SARS-CoV-2変異株

一般的な詳細
症状
なし 頭痛[ 1 ] [ 2 ] 喉の痛み[ 1 ] 鼻水[ 1 ] [ 2 ] 発熱[ 1 ]
主な変異体
アルファ（B.1.1.7） ベータ版（B.1.351） ガンマ（P.1） デルタ（B.1.617.2） オミクロン（B.1.1.529） BA.1 (B.1.1.529.1) BA.2 (B.1.1.529.2) BA.3 (B.1.1.529.3) BA.4 (B.1.1.529.4) BA.5 (B.1.1.529.5) 注1.8.1
v t e

シリーズの一部
COVID-19 パンデミック
COVID-19（病気） SARS-CoV-2（ウイルス） 事例 死亡者（数
タイムライン 2019 2020 1月 回答 2月 回答 行進 回答 4月 回答 5月 回答 6月 回答 7月 回答 8月 回答 9月 回答 10月 回答 11月 回答 12月 回答 2021 1月 回答 2月 回答 行進 回答 4月 回答 5月 回答 6月 回答 7月 回答 8月 回答 9月 回答 10月 回答 11月 回答 12月 回答 2022 1月 回答 2月 回答 行進 回答 4月 回答 5月 回答 6月 回答 7月 回答 8月 回答 9月 回答 10月 回答 11月 12月 2023
場所 国と地域別 アフリカ 南極大陸 アジア ヨーロッパ 北米 オセアニア 南アメリカ 輸送手段 クルーズ船 海軍艦艇
国際的な反応 流行期 避難 フェイスマスク 国際援助 起源 ロックダウン 国別 誤報 政府によって 偽の治療法 人混みを避ける ソフトウェア 旅行 国連 世界保健機関 WTOの知的財産権免除 死亡者の過少カウント COVID-19アプリ ゼロCOVID 国の対応 アフリカ 中国 欧州連合 ドイツ ガーナ インド アイルランド オランダ ニュージーランド ナイジェリア フィリピン ロシア スウェーデン 英国 政府 私たち 連邦政府 ベトナム
医療対応 病気の検査 アルコール検知器 発達 医薬品開発 薬物の再利用 公衆衛生の緩和 ワクチン 歴史 研究 ヴィット 展開 承認 ワープスピード作戦 誤情報と躊躇 私たち ワクチンカード ワクチンパスポート 現在のワクチン コロナバック コバキシン コンビデシア ヤンセン メディゲン モデルナ ノババックス オックスフォード・アストラゼネカ ファイザー・ビオンテック シノファームBIBP スプートニクV
変種 懸念される変異株 アルファ ベータ ガンマ デルタ オミクロン その他のバリエーション イプシロン ゼータ エタ シータ イオタ カッパ ラムダ ムー クラスター5 系譜 B.1.617
経済への影響と景気後退 芸術と文化 航空 大麻 シネマ 映画 ディズニー ファッション 金融市場 食品業界 食料安全保障 ジャーナリズム 音楽 舞台芸術 小売り 配送 テレビ 私たち スポーツ放送 プログラム 観光 ビデオゲーム 国別 カナダ インド アイルランド マレーシア ニュージーランド ロシア 英国 私たち スポーツ別 サッカー 野球 バスケットボール 格闘技 クリケット ディスクゴルフ ゲール語のゲーム グリッドアイアンフットボール アイスホッケー モータースポーツ ラグビーリーグ
影響 Long COVID Neurological and psychological symptoms Post-exertional malaise Society African diaspora Animals Alzheimer's disease patients Crime Death rates by country Disability Domestic violence Emergency evacuations Education Female Environment Hospitals Language LGBTQ community Long-term care Media coverage Mental health Migration Military Notable deaths Other health issues Popular culture Protests Pregnancy Prisons Religion Catholic Church Hajj Science and technology Social media Strikes Suicides Telehealth Xenophobia and racism Politics Diplomacy Infected leaders Ireland Malaysia New Zealand Russia UK US
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デルタ変異株（B.1.617.2）は^{[ 3 ] [ 4 ]} 、 COVID-19を引き起こすウイルスであるSARS-CoV-2の変異株である。2020年10月5日にインドで初めて検出された。デルタ変異株は2021年5月31日に命名され、2021年11月22日までに179カ国以上に広がった。世界保健機関（WHO）は2021年6月、デルタ変異株が世界的に優勢な株になりつつあると指摘した。^{[ 5 ]}

これはSARS-CoV-2スパイクタンパク質をコードする遺伝子に変異があり^{[ 6 ]} 、T478K、 P681R 、およびL452Rの置換を引き起こし、^{[ 7 ] [ 8 ]}これらはウイルスの伝染性に影響を与えることが知られているだけでなく、以前に循環していたCOVID-19ウイルスの変異体に対する抗体によって中和されるかどうかにも影響を及ぼします。^{[ 9 ]}イングランド公衆衛生局（PHE）は2021年8月に、旅行に関連しないまたは不明な症例の家庭内接触におけるデルタ株の二次感染率がアルファ株の10.2％に対して10.8％であると報告しました。^{[ 10 ]}デルタ株に感染した386,835人の致死率は0.3％で、症例の46％と死亡者の6％はワクチン接種を受けておらず、50歳未満です。^{[ 11 ]}以前の回復による免疫^{[ 12 ] [ 13 ]}またはCOVID-19ワクチンは、変異株の感染による重症化や入院を予防するのに効果的である。^{[ 14 ]}

2021年5月7日、PHEは、B.1.617.2系統の分類を、 B.1.1.7（アルファ変異株）と少なくとも同等の伝染性があるとの評価に基づき、調査中の変異株（VUI）から懸念される変異株（VOC）に変更しました。 ^{[ 15 ]}英国のSAGEは、5月のデータを使用して、伝染性が50％高いという「現実的な」可能性を推定しました。^{[ 16 ]} 2021年5月11日、WHOもこの系統をVOCに分類し、伝染性が高く、中和効果が低下しているという証拠が示されていると述べました。2021年6月15日、米国疾病予防管理センター（CDC）はデルタを懸念される変異株と宣言しました。^{[ 17 ]}

この変異株は、 2021年2月に始まったインドでの致命的なパンデミックの第二波の一部に関与していると考えられています。 ^{[ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]}その後、フィジー、英国^{[ 21 ] [ 22 ] [ 23 ]}、南アフリカ^{[ 24 ]}で第三波の原因となり、WHOは2021年7月にヨーロッパとアフリカの他の地域でも同様の影響を及ぼす可能性があると警告しました。^{[ 25 ] [ 24 ]} 7月下旬までに、アジアの一部、^{[ 26 ]}米国、^{[ 27 ]}オーストラリア、ニュージーランドでも1日あたりの感染者数が増加しました。^{[ 28 ]}

デルタ変異株は、SARS-CoV-2スパイクタンパク質をコードする遺伝子に変異を有しており^{[ 6 ]} 、 D614G、T478K、P681R、L452Rの置換を引き起こしている^{[ 29 ] [ 8 ]}。これは、 Nextstrain系統分類システムの下で21A、21I、および21J系統群として識別されている^{[ 30 ] 。}

このウイルスは、インドで最初に検出されたことから、「インド変異株」とも呼ばれています^{[ 31 ]}。しかし、デルタ変異株はB.1.617系統の3つの変異株のうちの1つに過ぎず、これらはすべてインドで最初に検出されました[32]。^2021年5月末、WHOは、懸念される変異株と関心のある変異株にギリシャ文字を使用するという新しい方針を導入した後、系統B.1.617.2にデルタというラベルを付けました^{[ 33 ] 。}

系統 B.1.617には、現在までに 3 つのサブ系統が分類されています。

B.1.617.1（カッパ変異体）は、2021年4月にイングランド公衆衛生局（Public Health England）によって調査中の変異体に指定されました。2021年4月後半には、さらに2つの変異体、B.1.617.2とB.1.617.3が調査中の変異体に指定されました。B.1.617.3はB.1.617.1に見られるL452RおよびE484Q変異を共有していますが、B.1.617.2にはE484Q変異がありません。B.1.617.2にはT478K変異がありますが、これはB.1.617.1およびB.1.617.3には見られません。^{[ 34 ] [ 35 ]}同時に、ECDCはB.1.617の3つの亜系統すべてをVOIとして維持するという概要を発表し、「現在の措置の修正を検討する前に、これらのB.1.617系統に関連するリスクをより深く理解する必要がある」と推定しました。^{[ 36 ]}

• 
  SARS-CoV-2デルタ変異体のアミノ酸変異をSARS-CoV-2のゲノム地図上にプロットし、スパイク遺伝子に焦点を当てた^{[ 37 ]}

Delta/B.1.617.2ゲノムには少なくとも13の変異があり、それがコードするタンパク質のアミノ酸配列に変化を引き起こします。^{[ 40 ]}

スパイクタンパク質の変異のリストは以下のとおりである。GVNによれば19R、(G142D)、Δ156-157、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、D950N ^{[ 41 ]}、またはGenscriptによればT19R、G142D、del 156–157、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R ^{[ 42 ]。} これらのうち、ウイルスのスパイクタンパク質コードにある4つが特に懸念される。

• D614G。614番目の位置の置換（アスパラギン酸からグリシンへ の置換）は、アルファ、ベータ、ガンマなどの他の伝達性の高い変異体と共有されています。^{[ 9 ]}
• T478K。^{[ 9 ] [ 29 ]} 478番目の位置での交換は、スレオニンからリジンへの置換である。^{[ 43 ]}
• L452R。452番目のロイシンからアルギニンへの置換は、スパイクタンパク質のACE2受容体に対する親和性を高め^{[ 44 ]}、免疫系の認識能力を低下させる。^{[ 8 ] [ 45 ]}
• P681R。681番目の位置の置換はプロリンからアルギニンへの置換であり、ウィリアム・A・ハゼルティンによれば、この置換は「S前駆体タンパク質を活性S1/S2構造に切断することを促進することによって」変異体の細胞レベルの感染性を高める可能性がある。^{[ 46 ]}

E484Q変異はB.1.617.2ゲノムには存在しない。^{[ 46 ] [ 47 ]}

2021年8月現在、デルタ変異株はパンゴ系統指定システムにおいてAY.1からAY.28までの変異株に細分化されている。しかし、このような分類がウイルスの生物学的特性の変化と相関しているかどうかについては情報がない。^{[ 48 ]} 2021年8月現在、英国ではAY.4からAY.11、イスラエルではAY.12、米国ではAY.2、AY.3、AY.13、AY.14、AY.25、米国とメキシコではAY.20、カナダではAY.15、ケニアではAY.16、アイルランドと北アイルランドではAY.17、南アフリカではAY.19、イタリアとスイスではAY.21、ポルトガルではAY.22、インドネシアではAY.24、インドネシア、シンガポール、日本、韓国ではAY.23が主流と言われている。^{[ 49 ]}

K417Nを持つデルタは、もともと系統AY.1とAY.2に対応していましたが^{[ 50 ]} 、その後系統AY.3にも対応し^{[ 51 ]}、「デルタプラス」または「ネパール変異体」という愛称で呼ばれています。^{[ 52 ]} K417N変異を有しており^{[ 53 ]} 、これはベータ変異体にも存在します。^{[ 54 ]} 417番目の位置の置換はリジンからアスパラギンへの置換です。^{[ 55 ]}

2021年10月中旬の時点で、AY.3変異株の累積有病率は米国で約5％、世界全体では2％を占めていた。^{[ 56 ]} 10月中旬、AY.4.2 Delta亜系統は英国で拡大しており、監視と評価が行われていた。この亜系統はスパイクタンパク質にA222VとY145Hの変異を含んでいるが、^{[ 57 ]}特に懸念されるものではないと考えられている。AY.4.2は元のDelta変異株よりも10～15％伝染性が高い可能性があることが示唆されている。2021年10月中旬の時点で、AY.4.2は症例の約10％を占めており、約5日間の世代時間ごとに約1％（10％の10％）の追加増加率につながっている。この追加増加率は、有病率の増加に伴って大きくなるだろう。 AY.4.2がなく、他の変更もなければ、英国の症例数は約10％少なかったでしょう。^{[ 58 ]} AY.4.2は週ごとに約15％速く増加します。^{[ 59 ]}英国では、2021年10月下旬に「調査中の変異株」（「懸念される」ではない）に再分類されました。^{[ 60 ]}デンマークでは、AY.4.2の症例数の減少後、新たな急速な増加が検出され監視されましたが、まだ懸念の原因とは見なされていませんでした。^{[ 61 ] [ 62 ]}

全体的に、デルタ変異株の感染症状は他のSARS-CoV-2変異株の症状と類似している。一般的な症状としては、発熱、乾いた咳、脱力感、痰の絡む咳、頭痛、息切れ（呼吸困難）、筋肉痛などがある。ほとんどの人が最初の症状として、体の一部の感覚が部分的に失われる（知覚低下）か、嗅覚と味覚が失われると報告している。重症の場合、症状発症から約1週間後に呼吸困難と血中酸素濃度の低下（低酸素血症）が現れ、急性呼吸窮迫症候群、敗血症性ショック、代謝性アシドーシス、凝固機能障害、多臓器不全を急速に発症する人もいる。^{[ 63 ]}

デルタに対するワクチン予防の要約
（WHOの最新情報、2021年8月24日^{[ 64 ]}）

病気や感染症	重度：保護は維持される 症状あり：保護が低下する可能性がある
重症	:アストラゼネカ-ヴァクゼブリア(1)、モデルナ(1)、ファイザー-ビオンテック(2)
症状のある病気	へ: ファイザー-BioNTech(3) :コヴァキシン(1) : アストラゼネカ-ヴァクスゼブリア(2)
感染	: アストラゼネカ-ヴァクゼブリア(1)、ファイザー-バイオNテック(1)
記号はワクチン効果（VE）の低下の程度を示しています。VEの低下は防御力の低下を意味するものではありません。元々の高い防御率（例：95%）がある程度（例：10%）低下しても、防御力（例：85%）は維持されるためです。括弧内は、適応症を裏付ける研究数です。研究は対象集団、アウトカムの定義、研究デザインなどが異なるため、同じ製品のVE推定値が研究によって異なる場合があります。また、低下はVE推定値を示すものであり、推定値に関する不確実性を表すものではありません。不確実性は研究によって大きく異なる場合があります。VEの低下は、これらの制限を踏まえて解釈する必要があります。 : VE が 10% 未満減少、または比較対象なしで VE が 90% 以上 減少: VE が 10% から 20% 未満減少 : VEは20～30%減少

中和効果（完全ワクチン接種）[ 65 ]
宛先：安徽省-ZIFIVAX（2）、Covaxin（3） ：ヤンセン（3）、モデルナ（3）、コビシールド（2） 宛先：アストラゼネカ-Vaxzevria（4）、ファイザー-BioNTech（8）：モデルナ＆ファイザー-BioNTech（1）*宛先：コロナバック（2）
記号は、完全ワクチン接種による中和効果の減少度合いを示しています。括弧内は、適応症を裏付ける研究の数です。 : 中和により 2 分の 1 未満に減少 : 中和により 2 分の 1 ～ 5 分の 1 未満に減少: 中和により 5 分の 1 ～ 10 分の 1 未満に減少: 中和により 10 分の 1 以上に減少* Moderna と Pfizer-BioNTech は一緒に評価されました。

WHOはデルタ株に対する予防措置を特に発表していないが、野生型のCOVID-19の予防に推奨される非医薬品対策は依然として有効であると考えられる。これには、手洗い、マスクの着用、他人との距離の確保、口、鼻、目に触れないこと、換気の悪い特に人々が話しているような混雑した屋内空間を避けること、症状が出たら検査を受けること、病気になったら隔離することなどが含まれる。^{[ 66 ]} 公衆衛生当局は、検査によって感染者を発見し、接触者を追跡し、陽性反応が出た人や感染にさらされた人を隔離し続けるべきである。^{[ 67 ]} イベント主催者は、あらゆる大規模集会の潜在的リスクを評価し、こうしたリスクを軽減する計画を策定すべきである。^{[ 68 ]}非医薬品介入（疫学） も参照。

インド医学研究評議会（ICMR）は、COVID-19症例の回復期血清とBharat BiotechのBBV152（Covaxin）投与を受けた人は、効力は低いものの、VUI B.1.617を中和できることを発見した。^{[ 69 ]}

ゲノミクス・統合生物学研究所（IGIB）の所長アヌラグ・アグラワル氏は、B.1.617系統に対する既存のワクチンの有効性に関する研究では、ワクチン接種後は感染が軽度になることが示唆されていると述べた。^{[ 70 ]}

アメリカ合衆国大統領首席医学顧問のアンソニー・ファウチ氏も、この予備的な結果に自信を示しました。4月28日のインタビューで、彼は次のように述べました。

これは現在も日々データが蓄積されている分野です。しかし、最新のデータは、COVID-19感染者の回復期血清と、インドで使用されているワクチン「コバクシン」を接種した人々の血清を調べたものです。このワクチンは617の変異株を中和することが判明しました。^{[ 71 ]}

ハイデラバードの細胞分子生物学センター（CCMB）による別の研究では、コビシールド（オックスフォード・アストラゼネカ）ワクチン接種血清がB.1.617系統に対する防御効果を発揮することが判明した。 ^{[ 72 ]}

イングランド公衆衛生局（PHE）が実施した調査によると、ファイザー・ビオンテックまたはアストラゼネカ・オックスフォードのワクチンを接種した人は、接種を受けなかった人に比べて、1回目の接種後に変異株による症状のある疾患の発症例が33％少なかった。ファイザー・ビオンテックのワクチンの2回目の接種から2週間後では、デルタ変異株による症状のある疾患の発症例が、接種を受けなかった人に比べて88％少なかった。アストラゼネカ・オックスフォードのワクチンの2回目の接種から2週間後では、デルタ変異株による症状のある疾患の発症例が、接種を受けなかった人に比べて60％少なかった。^{[ 73 ] [ 74 ]}

フランシス・クリック研究所の研究者グループがランセット誌に発表した研究によると、ファイザー・ビオンテックのワクチンを完全に接種した人間は、元のCOVID-19株と比較して、デルタ変異株に対する中和抗体のレベルが5倍以上低い可能性が高いことが示されています。^{[ 75 ] [ 76 ]}

2021年6月、PHEは、2回の接種後、ファイザー・ビオンテックワクチンとアストラゼネカワクチンは、デルタ変異株による入院をそれぞれ96％と92％予防する効果があるという研究を実施したと発表した。^{[ 77 ] [ 78 ]}

7月3日、カナダのオンタリオ州にあるトロント大学とオタワ大学の研究者らは、モデルナ社のワクチンがデルタ変異株による死亡や入院に対して効果があるかもしれないことを示唆するプレプリント研究を発表しました。^{[ 79 ] [信頼できない医療情報源? ]}

2021年7月にスリ・ジャヤワルダナプラ大学が行った研究では、シノファームBIBPワクチンを2回接種した被験者の95%で抗体陽転が認められました。この割合は20～39歳層では98.9%と高く、60歳以上層では93.3%とやや低かった。ワクチン接種を受けた被験者の81.25%に中和抗体が存在した。^{[ 80 ] [ 81 ]}

2021年6月29日、ガマレヤ研究所所長デニス・ログノフ氏は、スプートニクVはデルタ変異株に対して約90％の効果があると述べた。^{[ 82 ]}

7月21日、PHEの研究者らは、ファイザーのワクチンは2回接種後、デルタによる症状のある疾患に対して93.7%の有効性を示したのに対し、アストラゼネカのワクチンは67%の有効性を示したという研究結果を発表しました。^{[ 83 ]}

8月2日、複数の専門家は、デルタ変異株は現在のワクチンで免疫を獲得した人々の間で伝染するため、集団免疫の達成は現時点では不可能かもしれないという懸念を表明した。^{[ 84 ]}

8月10日、ある研究で、16カ国におけるSARS-CoV-2デルタ変異株の変異頻度とワクチン接種率の完全相関が示されました（R2=0.878）。データは、COVID-19に対するワクチン接種の完全実施がウイルスの進化を遅らせる可能性を強く示唆しています。^{[ 85 ]}

試験管内実験では、バムラニビマブ単独ではデルタ株に効果がない可能性があることが示唆されている。^{[ 86 ]} 十分な濃度であれば、カシリビマブ、エテセビマブ、イムデビマブは依然として有効であるように見える。プレプリント研究では、ソトロビマブもデルタ株に効果がある可能性があることが示唆されている。^{[ 87 ]}シンガポールの医師は、以前の変異株よりも多くのデルタ株患者に酸素補給、レムデシビル、コルチコステロイド を使用している。^{[ 88 ]}

英国の科学者らは、デルタ変異株は、英国で最初に特定された（ケント変異株として）それまで優勢だったアルファ変異株よりも40％～60％伝染性が高いと述べている。 ^{[ 89 ]}アルファ変異株の伝染力がすでに2019年後半に武漢で発生した元のSARS-CoV-2株の150％であることを考えると、^{[ 89 ]}デルタ変異株の伝染力がアルファ変異株の150％であれば、デルタ変異株の伝染力は元の株の225％である可能性がある。^{[ 90 ]} BBCは、最初に検出されたSARS  - CoV-2ウイルスの基本再生産数、つまりすべての個人が感染の影響を受けやすい集団で1つの症例によって直接生成される症例の予想数は2.4～2.6であるのに対し、アルファの再生産数は4～5、デルタの再生産数は5～9であると報告した。^{[ 91 ] [ 92 ]}これらの基本再生産数は、MERS（0.29～0.80 ^{[ 93 ]}）、季節性インフルエンザ（1.2～1.4 ^{[ 94 ]}）、エボラ出血熱（1.4～1.8 ^{[ 95 ]}）、風邪（2～3 ^{[ 96 ]}）、SARS（2～4 ^{[ 97 ]}）、天然痘（3.5～6 ^{[ 98 ]}）、水痘（10～12 ^{[ 99 ]}）と比較することができます。デルタウイルスは感染力が高いため、ワクチン接種を受けた人でも、程度は低いものの、感染する可能性があります^{[ 100 ] 。 [ 74 ]}${\displaystyle R_{0}}$

広東省疾病予防管理センターがオンラインで発表した研究（査読なし）^{[ 101 ]}は、感染力の増加を部分的に説明できるかもしれない。デルタによる感染者の呼吸器系におけるウイルスのコピー数は、パンデミック初期に最初に特定された変異株による感染者よりも1,000倍多かった。また、デルタに感染した人がウイルスを検出できるようになるまでには、平均4日かかったのに対し、最初に特定された変異株では6日かかった。^{[ 102 ] [ 103 ]}

2021年6月と7月の米国、ドイツ、オランダの監視データによると、デルタ変異株はアルファ変異株に比べて2週間ごとに約4倍に増加していました。^{[ 104 ] [ 105 ] [ 106 ]}

インド、イギリス、^{[ 107 ]}ポルトガル、^{[ 108 ]}ロシア、^{[ 109 ]}メキシコ、オーストラリア、インドネシア、^{[ 110 ]}南アフリカ、ドイツ、^{[ 111 ]}ルクセンブルク、^{[ 112 ]}アメリカ、^{[ 113 ]}オランダ、^{[ 114 ]}デンマーク、^{[ 115 ]}フランス^{[ 116 ] 、そしておそらく他の多くの国々では、デルタ変異株が2021年7月までに優勢な株となっていた。}国によって、症例と変異株の報告の間には通常、数日から数週間のタイムラグがある。2021年7月20日時点で、この変異株は124か国に広がっており、^{[ 65 ]} WHOは、すでに優勢な株の1つではないにしても、優勢な株になりつつあると示唆していた。^{[ 117 ]}

オランダでは、2021年28週目以降、献血者の93.4%以上がSARS-CoV-2抗体検査で陽性反応を示し、ウイルスは依然として人口内で顕著に増殖している。オランダでは多くの人がワクチン接種を完了していないため、これらの抗体は野生ウイルスへの曝露またはワクチン接種によって生成されたものと考えられる。^{[ 118 ] [ 119 ]}英国でも、献血者と一般サーベイランスで同様の高い血清免疫レベルが認められる。^{[ 120 ] [ 121 ] [ 122 ]}

プレプリントによると、変異株による感染の最初の陽性検査におけるウイルス量は、2020年に比較された感染者と比較して平均で約1000倍高かった。 ^{[ 123 ] [ 124 ]}デルタが急速に蔓延していた2021年5月から7月にかけて英国で10万人のボランティアを対象に行われた研究の予備データによると、無症状の症例も含め、COVID-19の検査で陽性となったワクチン接種済みの人のウイルス量は平均して低いことが示されている。米国、英国、シンガポールのデータによると、デルタに感染したワクチン接種済みの人のウイルス量は、ワクチン接種を受けていない感染者と同程度に高くなる可能性があるが、感染力を維持できる期間は短い可能性があることが示されている。^{[ 125 ]}

インド政府の統合疾病監視プログラム（IDSP）の監視データによると、入院患者と院外患者の両方において、第2波では30歳未満の患者が約32%を占め、第1波では31%であったのに対し、第2波では約32%に増加した。30～40歳の感染率は21%にとどまった。20～39歳の入院率は23.7%から25.5%に増加し、0～19歳は4.2%から5.8%に増加した。また、第2波では無症状の患者の割合が増加し、呼吸困難の訴えも増加した。^{[ 126 ]}

いくつかの初期の研究では、デルタ変異株は他の株よりも重篤な病気を引き起こすことが示唆されている。^{[ 127 ]} 2021年6月7日、シンガポール国立感染症センターの研究者らは、デルタ陽性の患者は野生型やアルファ型の患者よりも肺炎を発症したり酸素を必要とする可能性が高くなることを示唆する論文を発表した。^{[ 128 ]} 6月11日、イングランド公衆衛生局は、アルファ型と比較してデルタ型では「入院リスクが著しく高い」という報告書を発表した。^{[ 129 ]}デルタ変異株に感染した人ではリスクが約2倍高かった。^{[ 130 ]} 6月14日、スコットランド公衆衛生局の研究者らは、デルタ型による入院リスクはアルファ型の約2倍であることを発見した。^{[ 131 ]} 7月7日、トロント大学の疫学者によるプレプリント研究では、デルタ株はSARS-COV-2の懸念のない変異株と比較して、入院リスクが120％（2倍以上）、ICU入院リスクが287％、死亡リスクが137％高いことがわかった。^{[ 132 ]}しかし、7月9日、イングランド公衆衛生局は、イングランドでのデルタ変異株の症例致死率（CFR）は0.2％であるのに対し、アルファ変異株の症例致死率は1.9％であったと報告した。ただし、この報告書では、「症例致死率は、パンデミックの異なる時点でピークに達したため、変異株間で比較することはできず、病院の背景にある逼迫状況、ワクチンの可用性と率、症例プロファイル、治療の選択肢、報告の遅れの影響など、さまざまな要因が異なる」と警告している。^{[ 133 ]}イングランド公衆衛生局の広報担当者ジェームズ・マクリーディー氏は、「他の変異株と比較した致死率を評価するのは時期尚早だ」と明言した。^{[ 134 ]}

2021年10月5日に発表されたカナダの研究によると、デルタ変異株は他の変異株と比較して入院が108％増加し、ICU入院が235％増加し、死亡が133％急増したことが明らかになりました。デルタ変異株は以前の変異株と比較してより深刻で、死亡リスクが高まっていますが、そのオッズは予防接種によって大幅に減少します。^{[ 135 ] [ 136 ]}

デルタ症例を検出する可能性は、特に国のシークエンシング率によって大きく異なります（シークエンシング率が最も低い国では、COVID-19症例全体の0.05％未満しかシークエンシングされていませんが、最も高い国では約50％です）。^{[ 137 ] [ 138 ]}

^2021年6月22日までに、約78か国で4,500以上の変異体の配列が検出されました。^{[ 139 ] [ 140 ] [ 141 ]検出}された国で報告された配列数は次のとおりです ^。

国別の症例数

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国/地域	確認された症例（PANGOLIN）[ 142 ] 12月19日現在	11月23日現在、 確認された症例（GISAID）[ 139 ]	2022年1月19日時点の 症例数（他の情報源）	最初の検出	最終検出
イギリス	985,491	826,465	1,625,557 [ 143 ]	2021年2月22日
アメリカ合衆国	1,099,811	947,472	99.4%の症例[ 144 ]	2021年2月23日
カナダ	78,412	62,008	196,866 [ 145 ]	2021年3月15日
ドイツ	150,416	117,513		2021年3月1日
デンマーク	138,336	89,706		2021年3月8日
日本	86,383	70,973	86,037 [ 146 ] [ 147 ]	2021年3月28日
フランス	75,224	70,822		2021年2月21日
七面鳥	54,134	50,578	5 [ 148 ]	2021年4月28日
フィジー	495	507	47,639 [ 149 ] [ 150 ] [ 151 ]	2021年4月19日
インド	45,638	45,055		2020年10月5日
スイス	48,304	38,003		2021年3月29日
スウェーデン	46,018	37,773		2021年3月26日
ベルギー	37,334	31,611		2021年3月25日
イタリア	33,642	29,282		2021年4月2日
スペイン	30,618	28,257		2021年4月22日
オランダ	33,128	27,870		2021年4月6日
オーストラリア	23,696	22,715	25,750 [ 152 ]	2021年3月16日
アイルランド	22,425	21,061		2021年2月26日
ブラジル	27,733	17,987	1051 [ 153 ] [ 154 ]	2021年5月20日[ 155 ] [ 156 ] [ 157 ] [ 158 ] [ 159 ]
メキシコ	20,230	17,710		2021年4月5日
スロベニア	16,334	13,439		2021年4月20日
イスラエル	15,787	12,259	41 [ 160 ] [ 161 ] [ 162 ]	2021年4月16日
ノルウェー	15,716	12,130	1 [ 163 ]	2021年4月15日
ポルトガル	12,984	11,983		2021年4月5日
南アフリカ	2,582	10,619	4 [ 164 ]	2021年4月30日
ポーランド	16,484	10,320	16 [ 165 ]	2021年4月26日
リトアニア	899	9,070	1 [ 166 ]	2021年6月17日
フィンランド	1,570	8,733	2,876 [ 167 ] [ 168 ] [ 169 ] [ 170 ]	2021年3月18日
チェコ共和国	11,225	8,487		2021年4月24日
シンガポール	2,727	7,510		2021年2月26日
スロバキア	353	7,146		2021年6月15日
フィリピン	870	3,220	8,612 [ 171 ] [ 172 ]	2021年5月11日
韓国	706	6,497		2021年3月26日
クロアチア	479	6,165		2021年6月11日
チリ	64	5,858		2021年6月13日
ルクセンブルク	1,153	5,515		2021年4月15日
インドネシア	1,623	4,980		2021年4月3日
ルーマニア	294	4,655		2021年4月26日
ブルガリア	231	4,614		2021年4月5日
ロシア	1,468	4,295	16 [ 173 ]	2021年4月21日
タイ	236	4,293	2 [ 174 ]	2021年4月24日
アイスランド	-	3,767		2021年8月30日
マレーシア	146	3,624		2021年4月10日
オーストリア	1,578	3,622		2021年4月17日
ニュージーランド	92	2,844	107 [ 175 ] [ 176 ]	2021年3月9日
エストニア	-	2,740		2021年7月21日
ギリシャ	17	2,642		2021年3月23日
ペルー	6	2,580		2021年6月10日
バーレーン	117	2,013		2021年4月5日
ナイジェリア	36	1,795	1 [ 177 ]	2021年8月7日
ケニア	256	1,700	5 [ 177 ] [ 178 ]	2021年7月17日
アルバ	90	1,592		2021年4月16日
ベトナム	54	1,414	12 [ 179 ] [ 180 ]	2021年4月18日
プエルトリコ	1,355	1,360		2021年9月9日
カタール	121	1,343		2021年4月19日
バングラデシュ	283	1,273	9 [ 181 ] [ 182 ]	2021年4月28日
セント・マーチン	1,225	1,231		2021年3月19日
エクアドル	955	1,023		2021年7月20日
スリランカ	117	984	1 [ 183 ]	2021年4月30日
コロンビア	-	974		2021年7月3日
ボツワナ	196	912	2 [ 184 ]	2021年4月28日
ジブラルタル	835	848		2021年9月5日
コソボ	829	834		2021年5月2日
再会	54	754		2021年5月4日
カンボジア	171	733		2021年4月5日
パプアニューギニア	710	717		2021年8月10日
コスタリカ	35	689		2021年7月7日
パキスタン	49	676		2021年5月16日
中国	520	536		2021年4月24日
モルディブ	6	525		2021年7月31日
ガーナ	101	522		2021年4月20日
キュラソー	-	467		2021年4月23日
ボネール島	-	458		2021年7月13日
ボスニア・ヘルツェゴビナ	31	430		2021年7月26日
エチオピア	-	424		2021年8月16日
セイシェル	-	407		2021年9月30日
アルゼンチン	4	385	2 [ 185 ]	2021年4月24日
マルティニーク	8	365		2021年8月10日
グアドループ	-	362		2021年3月10日
ヨルダン	5	360		2021年4月21日
ウガンダ	134	340	1 [ 186 ]	2021年3月26日
ザンビア	82	326		2021年5月29日
ガンビア	42	316		2021年7月12日
モザンビーク	-	314		2021年7月16日
グアテマラ	4	302		2021年7月29日
ルワンダ	91	283		2021年7月9日
カメルーン	-	282		2021年9月28日
ジョージア（国）	19	272		2021年5月15日
フランス領ギアナ	53	264		2021年7月22日
アメリカ領ヴァージン諸島	-	247		2021年8月18日
ネパール	100	238	9 [ 187 ]	2021年4月28日
コンゴ民主共和国	19	228	5 [ 177 ]	2021年5月3日
マラウイ	5	213		2021年4月30日
クウェート	108	191		2021年6月5日
モンテネグロ	-	178		2021年8月8日
ウクライナ	13	170		2021年6月24日
カザフスタン	-	167		2021年8月19日
オマーン	8	159		2021年5月17日
アンゴラ	6	159		2021年1月14日
香港	153	145		2021年4月22日
スリナム	-	150		2021年8月3日
モロッコ	3	138	2 [ 188 ]	2021年5月3日
持ち帰り	-	130		2021年7月31日
トリニダード・トバゴ	-	114		2021年8月3日
ナミビア	-	110		2021年6月
パラグアイ	4	100		2021年7月8日
ベリーズ	-	98		2021年6月30日
エジプト	-	98		2021年7月15日
ジンバブエ	-	96		2021年7月26日
リヒテンシュタイン	-	95		2021年7月15日
セネガル	13	93		2021年5月6日
コンゴ共和国	-	87		2021年7月15日
ヴェストラ・イェータランド	-	86		2021年7月19日
エスワティニ	-	81		2021年7月26日
レバノン	-	80		2021年7月3日
ラトビア	22	73		2021年5月27日
モナコ	34	70		2021年5月15日
モーリシャス	15	67		2021年5月8日
マルタ	42	63		2021年6月23日
ギニアビサウ	-	62		2021年11月3日
ブルンジ	3	57		2021年5月31日
アンティグア・バーブーダ	-	57		2021年8月6日
リベリア	-	56		2021年7月10日
アルメニア	-	50		2021年8月5日
ウズベキスタン	30	47	（未報告数）[ 189 ]	2021年6月25日
ベナン	-	47		2021年7月23日
北マケドニア	6	38		2021年7月11日
バハマ	-	38		2021年8月8日
ケイマン諸島	-	37		2021年7月30日
ミャンマー	12	33		2021年6月1日
セルビア	5	33		2021年7月6日
東ティモール	-	33	12 [ 190 ]	2021年8月8日
南スーダン	-	29		2021年6月7日
アラブ首長国連邦	-	28		2021年6月23日
ブルネイ	-	28		2021年8月17日
ガボン	-	27		2021年8月2日
マヨット	-	27		2021年10月21日
アルジェリア	17	25	6 [ 191 ]	2021年7月28日
アンドラ	-	25		2021年7月17日
バルバドス	3	23		2021年5月24日
シエラレオネ	-	22		2021年9月8日
イラン	11	21	3 [ 192 ]	2021年5月11日
ブルキナファソ	-	21		2021年4月21日
クリミア	-	21		2021年7月1日
アフガニスタン	-	20		2021年5月24日
北マリアナ諸島	2	19		2021年7月7日
中央アフリカ共和国	-	17		2021年8月14日
台湾	10	15		2021年6月14日
グアム	-	14		2021年4月26日
ドミニカ共和国	-	14		2021年5月3日
ハンガリー	-	-	14 [ 193 ]	2021年7月22日
赤道ギニア	-	14		2021年8月30日
イラク	2	13		2021年4月27日
モルドバ	11	11		2021年7月6日
アルバニア	11	11		2021年7月13日
コモロ	11	11		2021年10月26日
ジャマイカ	10	10		2021年7月23日
アンギラ	8	8		2021年4月20日
セントルシア	7	7		2021年7月26日
モントセラト	7	7		2021年8月1日
サン・バルテルミー島	7	7		2021年8月17日
イギリス領ヴァージン諸島	5	5		2021年7月27日
キプロス	1	1	4 [ 194 ]	2021年5月19日
タークス・カイコス諸島	4	4		2021年7月12日
アゼルバイジャン	2	2		2021年7月14日
ホンジュラス	2	2		2021年7月31日
エルサルバドル	2	2		2021年8月2日
セントビンセント・グレナディーン諸島	2	2		2021年8月8日
マリ	2	2		2021年8月11日
サウジアラビア	2	2		2021年9月9日
ハイチ	1	1	（未報告数）[ 189 ]	2021年7月27日
パナマ	1	1	1 [ 195 ]	2021年4月29日
チュニジア	1	1		2021年5月21日
セーデルマンランド	1	1		2021年7月7日
ベネズエラ	1	1		2021年7月7日
モンゴル	1	1		2021年9月23日
キルギスタン	1	1	（未報告数）[ 189 ]	2021年5月16日[ 189 ]
世界（178カ国）	合計: 3,119,592 (B.1.617.2 のみ)	合計: 2,768,050 (B.1.617.2+AY.1+AY.2+AY.3)	合計: 1,862,122

インド国外での変異株の最初の症例は2021年2月下旬に検出され、英国では2月22日、米国では2月23日、シンガポールでは2月26日に確認された。^{[ 196 ] [ 40 ] [ 139 ]}

イングランド公衆衛生局の英国科学者らは、2021年5月7日にB.1.617.2変異株を「懸念される変異株」（VOC-21APR-02）に再指定した。^{[ 197 ]}これは、同年5月にこの変異株が元のウイルスよりも急速に拡散するという証拠を警告した後のことである。^{[ 21 ]}もう1つの理由は、B.1.617.2のクラスターを48個特定し、そのうちのいくつかである程度市中感染が明らかになったことである。^{[ 198 ] [ 199 ]}デルタ変異株の症例が急増したことから、英国の科学者らは、2021年6月初旬に英国におけるSARS-CoV-2の優勢な変異株としてデルタ変異株がアルファ変異株を追い抜いたと考えた。^{[ 200 ]}イングランド公衆衛生局の研究者らはその後、2021年6月初旬の英国における新規症例の90%以上がデルタ変異株であったことを発見した。また、デルタ変異株はアルファ変異株と比較して家庭内感染のリスクが約60％増加するという証拠も挙げている。^{[ 201 ]}

カナダで最初に確認された変異株の症例は、 2021年4月21日にケベック州で確認され、同日、ブリティッシュコロンビア州で39件の変異株の症例が確認されました。^{[ 202 ]} アルバータ州は2021年4月22日に変異株の症例を1件報告しました。^{[ 203 ]} ノバスコシア州は2021年6月にデルタ変異株の症例を2件報告しました。^{[ 204 ]}

フィジーでも2021年4月19日にラウトカでこの変異株の最初の症例が確認され、それ以来症例数は47,000件にまで増加し、増加し続けています。^{[ 205 ]}この変異株はスーパースプレッダーとして特定されており、国の人口のほぼ3分の2を占める地域であるラウトカ、ナンディ、スバ、ラミ、ナウソリの5つの都市のロックダウンにつながっています。

2021年4月29日、フィンランド社会保健省（STM）とフィンランド保健福祉研究所（THL）の保健当局は、2021年3月まで遡る3つのサンプルで変異株が検出されたと報告した。^{[ 167 ]}

フィリピンは、インド亜大陸諸国（ブータンとモルディブを除く）からの渡航禁止措置にもかかわらず、2021年5月11日に変異株の最初の症例2例を確認した。両症例とも過去14日間にインドへの渡航歴はなく、オマーンとUAEからの渡航歴があった。^{[ 206 ]}

北マケドニアは、2021年6月7日にイラクでウイルスから回復した人が北マケドニアに移送された後、同国で最初の変異株の症例を確認した。検査で、この人から変異株が検出された。2021年6月22日、同国は最初の症例の同僚で、イラクに滞在していた後に症状が出たデルタ変異株の2例目を報告した。^{[ 207 ]}

一部の国では、変異株専用のキットや遺伝子検査を実施できる研究所の不足により、B.1.617の検出が阻害されている。^{[ 208 ] [ 209 ]}例えば、5月18日時点でパキスタンでは症例は報告されていないが、当局は国内のCOVID-19検体の15%が「未知の変異株」であったと指摘している。検査が不可能なため、B.1.617であるかどうかは断言できない。他の国では、パキスタンから到着した旅行者がB.1.617に感染していたことが報告されている。^{[ 208 ]}

2021年6月、インドのゲノミクス・統合生物学研究所の科学者ヴィノド・スカリア氏は、デルタ変異体と比較してK417N変異が追加されているB.1.617.2.1変異体（AY.1またはデルタプラスとも呼ばれる）の存在を強調しました。^{[ 53 ]} B.1.617.2.1は2021年3月にヨーロッパで検出され、その後アジアとアメリカでも検出されています。^{[ 53 ]}

2021年6月23日、欧州疾病予防管理センター（ECDC）は、この変異株が8月末までに欧州連合（EU）における新規感染者の90%を占めるだろうと警告した。^{[ 210 ]}

2021年7月3日までに、デルタ航空は米国で優位に立った。^{[ 211 ]}

2021年7月9日、イングランド公衆衛生局はSARS-CoV-2変異株に関する技術ブリーフィング18を発表し、28日間の追跡調査で英国におけるSARS-CoV-2デルタ変異株の症例45,136件のうち112件が死亡し、致死率は0.2%であったと報告した。^{[ 212 ]}ブリーフィング16は、「死亡率は遅行指標であり、28日間の追跡調査を完了した症例数は非常に少ないことを意味する。したがって、デルタ変異株の症例致死率を年齢別に他の変異株と比較して正式に評価するには時期尚早である」と指摘している。^{[ 213 ]} ブリーフィング18は、「症例致死率は、変異株ごとにパンデミックの異なる時点でピークを迎えたため、比較することはできない。また、病院の負担、ワクチン接種の可用性と接種率、症例プロファイル、治療の選択肢、報告遅延の影響など、さまざまな要因が異なる」と警告している。^{[ 212 ]} 最も懸念されるのは、アルファ変異株と比較したロジスティック増加率が0.93/週である点です。これは、デルタ変異株のサンプル数/症例数がアルファ変異株に対してexp(0.93)=2.5倍増加していることを意味します。このため、同じ感染予防対策を講じたとしても、時間の経過とともに症例数は大幅に増加し、最終的には多くの人がデルタ変異株に感染することになります。^{[ 214 ] [ 215 ]}

第二波による感染者数の増加を受け、少なくとも20カ国が4月と5月にインドからの渡航者に対して渡航禁止および制限措置を講じた。英国のボリス・ジョンソン首相はインド訪問を2度キャンセルし、日本の菅義偉首相は4月の訪問を延期した。^{[ 216 ] [ 217 ] [ 218 ]}

2021年5月、ドイツのフェルバートにある2棟の高層ビルの住民は、建物内の女性がデルタ変異株の検査で陽性反応を示したため、隔離された。^{[ 219 ]}

5月、デリーのアルビンド・ケジリワル首相は、シンガポールから来た新たなコロナウイルス変異株は子供にとって極めて危険であり、インドで第3波を引き起こす可能性があると述べた。

2021年5月16日から6月13日まで、および2021年7月22日から2021年8月10日まで、シンガポールは2020年と同様に「フェーズ2強化警戒」と呼ばれるロックダウンに入りました。

6月14日、英国のボリス・ジョンソン首相は、新規感染者の大半（90％）を占めるデルタ変異株への懸念を受けて、英国で6月21日に予定されていたすべての制限措置の解除を最大4週間延期し、ワクチン接種の展開を加速すると発表した。^{[ 220 ]}英国の科学者らは、デルタ変異株は、英国で最初に確認された（ケント変異株として）これまで優勢だったアルファ変異株よりも40％から60％伝染性が高いと述べている。^{[ 221 ]}

6月23日、カナダのオンタリオ州は、トロント、ピール、ハミルトンなどのデルタ州のホットスポットに住む人々に対する2回目のワクチン接種の予約を加速させた。^{[ 222 ]}

6月25日、イスラエルはデルタの脅威を理由にマスク着用義務を復活させた。^{[ 223 ]}

6月28日、シドニーとダーウィンはデルタ州の感染拡大により再びロックダウンに入った。^{[ 224 ]} 南アフリカは葬儀を除く屋内外の集会を禁止し、夜間外出禁止令を発令し、アルコールの販売を禁止した。^{[ 225 ]}

7月3日、インドネシアのバリ島とジャワ島は緊急封鎖された。^{[ 226 ]}

7月8日、菅義偉首相は東京が再び緊急事態宣言を発令し、7月23日に開幕予定のオリンピックへの観客の大半の入場を禁止すると発表した。 ^{[ 227 ]}

7月9日、韓国のソウルは、屋外でのマスク着用を促し、集会の規模を制限するなどの規制を強化した。^{[ 228 ]}

7月12日、フランスのエマニュエル・マクロン大統領は、すべての医療従事者は9月15日までにワクチン接種を受ける必要があり、フランスでは8月からバー、カフェ、レストラン、ショッピングセンターへの入場に健康パスポートの使用を開始すると発表した。^{[ 229 ]}

ロサンゼルスは、 2021年7月17日から屋内でのマスク着用を義務付けると発表した。^{[ 230 ]}

英国は、デルタ株の優勢化に伴う感染者数の急増にもかかわらず、7月19日にCOVID-19に関する規制の大部分を解除した。政府はCOVID-19ワクチン接種プログラムの保護と広範な普及率を理由に挙げたが、保健専門家はこの措置に懸念を表明した。^{[ 231 ] [ 232 ]}

7月23日、ベトナムはホーチミン市の封鎖措置を8月1日まで延長し、ハノイにも封鎖措置を導入すると発表した。これは同国の人口の3分の1に影響を与える。デルタ変異株は、 2020年を通して概ね成功を収めてきた封じ込め策の後、同国でこれまでで最大の感染拡大を引き起こした。 ^{[ 233 ] [ 234 ]}

8月17日、ニュージーランドはオークランドで陽性者が報告されたことを受け、警戒レベル4のロックダウンに入った。コロマンデル半島でもすぐに感染者が続出した。^{[ 235 ]}これは、ニュージーランドで170日ぶり（2021年2月以来）に報告された市中感染事例であった。^{[ 236 ]}

2021年10月、英国保健安全保障局の最高経営責任者であるジェニー・ハリーズ博士は、アルファ変異株などの以前に流行していた変異株は「消滅し」、デルタ変異株に取って代わられたと述べた。^{[ 237 ]} 2022年3月、世界保健機関は、デルタ変異株とそれに続くオミクロン変異株の優勢により、過去数週間および数か月間に検出された症例がなかったことを理由に、アルファ、ベータ、ガンマ変異株を以前に流行していた変異株としてリストした。^{[ 238 ]}しかし、数か月以内にデルタ変異株は以前に流行した変異株としてリストされ、オーストラリアなどの国では12週間デルタが検出されなかった。^{[ 4 ]}

• SARS-CoV-2 の変異体:アルファ、ベータ、ガンマ、イプシロン、ゼータ、イータ、シータ、イオタ、カッパ、ラムダ、ミュー、オミクロン、系統 B.1.617