アファディン

AFDN
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1T2M、1XZ9、2AIN、2EXG、5A6C​​
識別子
エイリアス	AFDN、AF6、MLL-AF6、MLLT4、骨髄性/リンパ性または混合系白血病、転座、4、アファジン、接着結合形成因子、L-アファジン
外部ID	オミム: 159559 ; MGI : 1314653 ;ホモロジーン: 21202 ;ジーンカード: AFDN ; OMA : AFDN - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 6番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 6q27 始める 1億6782万6911bp [ 1 ] 終わり 1億6797万2023bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 17番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 17|17 A1- A2 始める 13,980,801 bp [ 2 ] 終わり 14,126,412 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 右卵管 腓骨神経 気管支上皮細胞 神経節隆起 右肺 口腔粘膜細胞 小唾液腺 膵臓の体 直腸 精巣上体頭 上位の表現 リップ 上頸部神経節 毛包 腹部の皮膚 外耳の皮膚 原腸胚 耳石器官 卵形嚢 結膜円蓋 髄質集合管 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質C末端結合 タンパク質結合 カドヘリン結合 細胞接着分子の結合 アクチンフィラメント結合 細胞成分 接着結合 細胞接合 細胞膜 核質 細胞質 細胞間接合 核の粒子 細胞間接触領域 タイトジャンクション 生物学的プロセス 細胞間シグナル伝達 GTPase活性の正の調節 細胞接着 腸管内皮バリアの確立 シグナル伝達 タンパク質の局在の制御 接着結合組織 遺伝子発現の正の調節 細胞間接着の正の調節 細胞移動の負の調節 カドヘリンを介した細胞間接着 タンパク質の細胞膜への局在の確立 二細胞タイトジャンクションアセンブリ カドヘリンを介した細胞間接着の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 4301 17356 アンサンブル ENSG00000130396 ENSMUSG00000068036 ユニプロット P55196 Q9QZQ1 RefSeq (mRNA) NM_001040000 NM_001040001 NM_001207008 NM_001291964 NM_005936 NM_001366319 NM_001366320 NM_001366321 NM_001386888 NM_010806 RefSeq（タンパク質） NP_001035089 NP_001193937 NP_001278893 NP_001353248 NP_001353249 NP_001353250 NP_034936 場所（UCSC） 6章: 167.83 – 167.97 MB 17章: 13.98 – 14.13 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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アファディンはヒトではAFDN遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ]}

関数

アファジンはRas（HRAS参照；MIM 190020）の標的であり、Ras活性化の下流における細胞間接着を制御する。t(6;11)転座によって引き起こされる白血病では、MLL（MIM 159555）と融合している（Taya et al., 1998）。[OMIM提供] ^{[ 6 ]}

相互作用

アファディンは以下と相互作用することが分かっています:

• BCR遺伝子、^{[ 7 ]}
• EPHB3 , ^{[ 8 ]}
• F11受容体、^{[ 9 ]}
• HRAS ^{[ 10 ] [ 11 ]}および
• LMO2 , ^{[ 12 ]}
• PVRL1 , ^{[ 13 ]}
• PVRL3、^{[ 14 ] [ 15 ]}
• プロフィリン1 , ^{[ 10 ]}
• RAP1A , ^{[ 10 ]}
• RAP1GAP , ^{[ 16 ]}
• SORBS1 , ^{[ 17 ]}
• SSX2IP、^{[ 18 ]}
• タイトジャンクションタンパク質1、^{[ 11 ]} および
• USP9X ^{[ 19 ] [ 20 ]}​

参考文献

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さらに読む

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