PSMC5
PSMC5
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスPSMC5、S8、SUG-1、SUG1、TBP10、TRIP1、p45、p45/SUG、プロテアソーム26Sサブユニット、ATPase 5、RPT6
外部IDオミム: 601681 ; MGI : 105047 ;ホモロジーン: 2098 ;ジーンカード: PSMC5 ; OMA : PSMC5 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

5705

19184

アンサンブル

ENSG00000087191

ENSMUSG00000020708

ユニプロット

P62195

P62196

RefSeq (mRNA)

NM_001199163 NM_002805

NM_008950

RefSeq（タンパク質）

NP_001186092 NP_002796

NP_032976

場所（UCSC）17章: 63.83 – 63.83 Mb11章: 106.15 – 106.15 Mb
PubMed検索[ 3 ][ 4 ]
ウィキデータ
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26S プロテアーゼ調節サブユニット 8 は、 26S プロテアソーム AAA-ATPase サブユニット Rpt6としても知られ、ヒトではPSMC5遺伝子によってコードされている酵素です。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]このタンパク質は、完全に組み立てられた 19S プロテアソーム複合体の 19 の必須サブユニットの 1 つです。[ 8 ] 6 つの 26S プロテアソーム AAA-ATPase サブユニット ( Rpt1、Rpt2、Rpt3、Rpt4、Rpt5 、および Rpt6 (このタンパク質)) は、4 つの非 ATPase サブユニット ( Rpn1、Rpn2、Rpn10、およびRpn13 )とともに、 19Sプロテアソーム複合体の調節粒子の基本サブ複合体を形成します。[ 8 ]

遺伝子

PSMC5遺伝子は、シャペロン様活性を有するATPaseのトリプルAファミリーに属するATPaseサブユニットの一つをコードしています。このサブユニットはプロテアソーム機能への関与に加え、甲状腺ホルモン受容体およびレチノイドX受容体αと相互作用することが示されているため、転写制御にも関与している可能性があります。[ 7 ] ヒトPSMC5遺伝子は13のエクソンから構成され、染色体バンド17q23.3に位置しています。

タンパク質

ヒトタンパク質26Sプロテアーゼ調節サブユニット8は45.6kDaの大きさで、406個のアミノ酸から構成されています。このタンパク質の理論的な等電点は8.23と計算されています。[ 9 ]

複雑な組み立て

26Sプロテアソーム複合体は、通常、20Sコア粒子（CPまたは20Sプロテアソーム）と、樽型の20Sの片側または両側にある1つまたは2つの19S調節粒子（RPまたは19Sプロテアソーム）で構成されています。 CPとRPは、異なる構造特性と生物学的機能に関係しています。 簡単に言うと、20Sサブ複合体は、カスパーゼ様、トリプシン様、キモトリプシン様活性を含む3種類のタンパク質分解活性を示します。 これらのタンパク質分解活性部位は、20Sサブユニットの4つの積み重ねられたリングによって形成されたチャンバーの内側に位置し、ランダムなタンパク質-酵素の遭遇と制御されていないタンパク質分解を防ぎます。 19S調節粒子は、ユビキチン標識タンパク質を分解基質として認識し、タンパク質を線状になるように展開し、20Sコア粒子のゲートを開き、基質をタンパク質分解チャンバーに導きます。このような機能的複雑さに対応するため、19S調節粒子は少なくとも18個の構成サブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、サブユニットのATP依存性に基づいて、ATP依存性サブユニットとATP非依存性サブユニットの2つのクラスに分類できます。この多サブユニット複合体のタンパク質相互作用とトポロジカル特性によると、19S調節粒子はベースサブ複合体とリッドサブ複合体で構成されています。ベースは、6つのAAA ATPase（サブユニットRpt1-6、系統的命名法）のリングと4つの非ATPaseサブユニット（Rpn1、Rpn2、Rpn10、およびRpn13）で構成されています。したがって、26Sプロテアーゼ調節サブユニット4（Rpt2）は、19S調節粒子のベースサブ複合体を形成する上で不可欠な構成要素です。 19S塩基サブ複合体の組み立てにおいては、4組の重要な組み立てシャペロン（酵母/哺乳類での命名法ではHsm3/S5b、Nas2/P27、Nas6/P28、およびRpn14/PAAF1）が4つのグループによって独立して同定された。[ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]これらの19S調節粒子塩基専用シャペロンはすべて、C末端領域を介して個々のATPaseサブユニットに結合する。例えば、Hsm3/S5bはサブユニットRpt1およびRpt2（このタンパク質）に、Nas2/p27はRpt5に、Nas6/p28はRpt3に、Rpn14/PAAAF1はRpt6（このタンパク質）にそれぞれ結合する。その後、Nas6/p28-Rpt3-Rpt6-Rpn14/PAAF1モジュール、Nas2/p27-Rpt4-Rpt5モジュール、Hsm3/S5b-Rpt1-Rpt2-Rpn2モジュールという3つの中間アセンブリモジュールが形成される。最終的に、これら3つのモジュールが組み合わさり、Rpn1を含む6つのアトラスからなるヘテロヘキサマーリングを形成する。最後にRpn13が加わることで、19S塩基サブ複合体のアセンブリが完了する。[8 ]

関数

細胞内タンパク質分解の約 70% を担う分解装置として、[ 16 ]プロテアソーム複合体 (26S プロテアソーム) は、細胞プロテオームの恒常性維持に重要な役割を果たしています。したがって、誤って折り畳まれたタンパク質や損傷したタンパク質は、新しい合成のためにアミノ酸をリサイクルするために継続的に除去する必要があります。同時に、いくつかの重要な調節タンパク質は選択的分解によって生物学的機能を果たします。さらに、タンパク質は MHC クラス I 抗原提示のためにペプチドに消化されます。空間的および時間的なタンパク質分解を介して生物学的プロセスにおけるこのような複雑な要求を満たすには、タンパク質基質を認識し、リクルートし、最終的に十分に制御された方法で加水分解する必要があります。したがって、19S 調節粒子は、これらの機能的課題に対処するための一連の重要な機能に関係しています。タンパク質を指定された基質として認識するために、19S 複合体は、特別な分解タグであるユビキチン化を持つタンパク質を認識できるサブユニットを持っています。また、19S 粒子と 20S 粒子間の会合を促進するためにヌクレオチド (例: ATP) と結合できるサブユニットがあり、また 20S 複合体の基質入口を形成するアルファサブユニット C 末端の確認変化を引き起こします。

ATPase サブユニットは、Rpt1–Rpt5–Rpt4–Rpt3–Rpt6–Rpt2 の配列を持つ 6 メンバーリングに組み立てられ、20S コア粒子の 7 メンバーアルファリングと相互作用して、19S RP と 20S CP の間に非対称インターフェースを確立します。[ 17 ] [ 18 ]異なる Rpt ATPase の HbYX モチーフを持つ 3 つの C 末端テールが、CP の 2 つの定義されたアルファサブユニット間のポケットに挿入され、CP アルファリングの中央チャネルのゲート開口部を制御します。[ 19 ] [ 20 ] ATPaseサブユニットRpt5は、他のユビキチン化された19Sプロテアソームサブユニット（Rpn13、Rpn10）および脱ユビキチン化酵素Uch37とともに、プロテアソーム関連ユビキチン化酵素によってin situでユビキチン化されることが示されています。プロテアソームサブユニットのユビキチン化は、細胞内のユビキチン化レベルの変化に応じてプロテアソームの活性を制御します。[ 21 ]

相互作用

PSMC5 は以下と相互作用することが示されています。

PSMC5変異を持つ小児

2021年現在、PSMC5遺伝子変異を持つ小児の報告はわずか18件しか見つかっていません。<GeneMatcher> PSMC5遺伝子変異を持つ小児を対象とした研究を行っている財団が1つあります。PSMC5財団（www.psmc5.org）です。この財団の目的は、治療法の発見と、変異に伴う問題の解決方法の理解を深めることです。一般的な影響としては、運動発達の遅れから言語表現の遅れに至るまで、発達の遅れが挙げられます。

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さらに読む

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