PSMC6

PSMC6
識別子
別名	PSMC6、CADP44、HEL-S-73、P44、SUG2、p42、プロテアソーム26Sサブユニット、ATPase 6、RPT5
外部ID	OMIM : 602708 ; MGI : 1914339 ; HomoloGene : 100630 ; GeneCards : PSMC6 ; OMA : PSMC6 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 14番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 14q22.1 開始 52,707,178 bp [ 1 ] 終点 52,728,590bp [ 1 ]
遺伝子位置（マウス） 染色体 14番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 14|14 C1 開始 45,567,245 bp [ 2 ] 終点 45,587,162 bp [ 2 ]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している 頬粘膜細胞 眼瞼結膜 鼻咽頭上皮 羊水 脛骨 胚上皮 臓側胸膜 壁側胸膜 副鼻腔粘膜 口腔 最もよく発現している 房室弁 下顎突出 上顎突出 腹壁 耳板 嗅上皮 長趾伸筋 足底筋 内側神経節隆起 胚葉上層 その他の参考発現データ バイオGPS その他の参考発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ヌクレオチド結合 タンパク質-高分子アダプター活性 ATPase活性 タンパク質結合 TBPクラスタンパク質結合 ATP結合 加水分解酵素活性 同一タンパク質結合 プロテアソーム活性化活性 細胞成分 細胞質 核プロテアソーム複合体 細胞質 プロテアソーム調節粒子、塩基サブ複合体 膜 プロテアソーム補助複合体 核質 細胞質プロテアソーム複合体 プロテアソーム複合体 細胞外エクソソーム 核 生物学的プロセス RNAポリメラーゼII転写開始前複合体の組み立ての正の制御 細胞アミノ酸代謝プロセスの調節 MHCクラスI、TAP依存性を介した外因性ペプチド抗原の抗原処理および提示 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス mRNAの安定性の調節 標準的なWntシグナル伝達経路の正の制御 タンパク質ポリユビキチン化 刺激性C型レクチン受容体シグナル伝達経路 腫瘍壊死因子を介したシグナル伝達経路 MAPKカスケード Fc-ε受容体シグナル伝達経路 タンパク質分解プロセス NIK/NF-κBシグナル伝達 ユビキチン依存性ERAD経路 後期促進複合体依存性分解プロセス T細胞受容体シグナル伝達経路 標準的なWntシグナル伝達経路の負の制御 プロテアソームタンパク質分解プロセスの正の調節 Wntシグナル伝達経路、平面細胞極性経路 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 有糸分裂細胞周期のG2/M移行の負の調節 タンパク質の脱ユビキチン化 SCF依存性プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 膜輸送 低酸素状態への応答におけるRNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写の調節 翻訳後タンパク質修飾 造血幹細胞の分化制御 インターロイキン-1を介したシグナル伝達経路 有糸分裂細胞周期の相転移の調節 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス Entrez 5706 67089 アンサンブル ENSG00000100519 ENSMUSG00000021832 ユニプロット P62333 P62334 RefSeq (mRNA) NM_002806 NM_001366414 NM_025959 RefSeq（タンパク質） NP_002797 NP_001353343 NP_080235 場所 (UCSC) 14番地: 52.71～52.73 MB 14番地: 45.57～45.59 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
ヒトの表示/編集 マウスの表示/編集

26Sプロテアーゼ調節サブユニットS10Bは、26SプロテアソームAAA-ATPaseサブユニットRpt4としても知られ、ヒトではPSMC6遺伝子によってコードされる酵素です。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}このタンパク質は、完全に組み立てられた19Sプロテアソーム複合体の19の必須サブユニットの1つです。^{[ 8 ]} 6つの26SプロテアソームAAA-ATPaseサブユニット（Rpt1、Rpt2、Rpt3、Rpt4（このタンパク質）、Rpt5、およびRpt6）と4つの非ATPaseサブユニット（Rpn1、Rpn2 、 Rpn10、およびRpn13 ）が、19Sプロテアソーム調節粒子複合体の基本サブ複合体を形成します。^{[ 8 ]}

遺伝子

PSMC6遺伝子は、シャペロン様活性を持つATPaseのトリプルAファミリーのメンバーであるATPaseサブユニットの1つをコードしています。偽遺伝子は8番染色体と12番染色体上に同定されています。^{[ 7 ]}ヒト遺伝子PSMC6は 15のエクソンを持ち、染色体バンド14q22.1に位置します

タンパク質

ヒトタンパク質26Sプロテアーゼ調節サブユニットS10Bは44kDaの大きさで、389個のアミノ酸で構成されています。このタンパク質の理論的な等電点は7.09と計算されています。^{[ 9 ]}

複雑な組み立て

26Sプロテアソーム複合体は、通常、20Sコア粒子（CPまたは20Sプロテアソーム）と、樽型の20Sの片側または両側にある1つまたは2つの19S調節粒子（RPまたは19Sプロテアソーム）で構成されています。 CPとRPは、異なる構造特性と生物学的機能に関係しています。 簡単に言うと、20Sサブ複合体は、カスパーゼ様、トリプシン様、キモトリプシン様活性を含む3種類のタンパク質分解活性を示します。 これらのタンパク質分解活性部位は、20Sサブユニットの4つの積み重ねられたリングによって形成されたチャンバーの内側に位置し、ランダムなタンパク質-酵素の遭遇と制御されていないタンパク質分解を防ぎます。 19S調節粒子は、ユビキチン標識タンパク質を分解基質として認識し、タンパク質を線状になるように展開し、20Sコア粒子のゲートを開き、基質をタンパク質分解チャンバーに導きます。このような機能的複雑さに対応するため、19S調節粒子は少なくとも18個の構成サブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、サブユニットのATP依存性に基づいて、ATP依存性サブユニットとATP非依存性サブユニットの2つのクラスに分類できます。この多サブユニット複合体のタンパク質相互作用とトポロジカル特性によると、19S調節粒子はベースサブ複合体とリッドサブ複合体で構成されています。ベースは、6つのAAA ATPase（サブユニットRpt1-6、系統的命名法）のリングと4つの非ATPaseサブユニット（Rpn1、Rpn2、Rpn10、およびRpn13）で構成されています。したがって、26Sプロテアーゼ調節サブユニット4（Rpt2）は、19S調節粒子のベースサブ複合体を形成する上で不可欠な構成要素です。 19S塩基サブ複合体の組み立てにおいては、4組の重要な組み立てシャペロン（酵母/哺乳類での命名法ではHsm3/S5b、Nas2/P27、Nas6/P28、およびRpn14/PAAF1）が4つのグループによって独立して同定された。^{[ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]}これらの19S調節粒子塩基専用シャペロンはすべて、C末端領域を介して個々のATPaseサブユニットに結合する。例えば、Hsm3/S5bはサブユニットRpt1およびRpt2（このタンパク質）に、Nas2/p27はRpt5に、Nas6/p28はRpt3に、Rpn14/PAAAF1はRpt6にそれぞれ結合する。その後、Nas6/p28-Rpt3-Rpt6-Rpn14/PAAF1モジュール、Nas2/p27-Rpt4-Rpt5モジュール、Hsm3/S5b-Rpt1-Rpt2-Rpn2モジュールという3つの中間アセンブリモジュールが形成されます。最終的に、これら3つのモジュールが組み合わさり、Rpn1を含む6つのアトラスからなるヘテロヘキサマーリングを形成します。最後にRpn13が追加されることで、19S塩基サブ複合体のアセンブリが完了します。^{[ 8 ]}

関数

細胞内タンパク質分解の約 70% を担う分解装置として、^{[ 16 ]}プロテアソーム複合体 (26S プロテアソーム) は、細胞プロテオームの恒常性維持に重要な役割を果たしています。したがって、誤って折り畳まれたタンパク質や損傷したタンパク質は、新しい合成のためにアミノ酸をリサイクルするために継続的に除去する必要があります。同時に、いくつかの重要な調節タンパク質は選択的分解によって生物学的機能を果たします。さらに、タンパク質は MHC クラス I 抗原提示のためにペプチドに消化されます。空間的および時間的なタンパク質分解を介して生物学的プロセスにおけるこのような複雑な要求を満たすには、タンパク質基質を認識し、リクルートし、最終的に十分に制御された方法で加水分解する必要があります。したがって、19S 調節粒子は、これらの機能的課題に対処するための一連の重要な機能に関係しています。タンパク質を指定された基質として認識するために、19S 複合体は、特別な分解タグであるユビキチン化を持つタンパク質を認識できるサブユニットを持っています。また、19S 粒子と 20S 粒子間の会合を促進するためにヌクレオチド (例: ATP) と結合できるサブユニットがあり、また 20S 複合体の基質入口を形成するアルファサブユニット C 末端の確認変化を引き起こします。

ATPase サブユニットは、Rpt1–Rpt5–Rpt4–Rpt3–Rpt6–Rpt2 の配列を持つ 6 メンバーリングに組み立てられ、20S コア粒子の 7 メンバーアルファリングと相互作用して、19S RP と 20S CP の間に非対称インターフェースを確立します。^{[ 17 ] [ 18 ]}異なる Rpt ATPase の HbYX モチーフを持つ 3 つの C 末端テールが、CP の 2 つの定義されたアルファサブユニット間のポケットに挿入され、CP アルファリングの中央チャネルのゲート開口部を制御します。^{[ 19 ] [ 20 ]} ATPaseサブユニットRpt5は、他のユビキチン化された19Sプロテアソームサブユニット（Rpn13、Rpn10）および脱ユビキチン化酵素Uch37とともに、プロテアソーム関連ユビキチン化酵素によってin situでユビキチン化されることが示されています。プロテアソームサブユニットのユビキチン化は、細胞内のユビキチン化レベルの変化に応じてプロテアソームの活性を制御します。^{[ 21 ]}

参考文献

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さらに読む

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