化学生物学において、バイオオーソゴナル化学レポーターとは、生体システムの天然に存在する生体分子に、一般的には代謝工学またはタンパク質工学によって導入される非ネイティブな化学官能基です。これらの官能基は、その後、生体分子のタグ付けや可視化に利用されます。バイオオーソゴナル化学の開発者であるジェニファー・プレッシャーとキャロリン・R・ベルトッツィは、バイオオーソゴナル化学レポーターを「生体システム内で、外因性プローブとの高度に選択的な反応を通じて改変できる、非ネイティブで非摂動的な化学ハンドル」と定義しました。これは、タンパク質の濃縮やプロテオーム解析に利用されています。
この技術の開発初期段階では、生体直交性化学レポーターとして認められるためには、化学モチーフが生体適合性と選択的反応性の基準を満たす必要がありました。タンパク質構成アミノ酸側鎖の組み合わせの中には、ケトンタグやアルデヒドタグと同様に、この基準を満たすものがあります。アジドやアルキンも化学レポーターの例として挙げられます。
生体直交性化学レポーターは生体分子に組み込まれる必要があります。これは代謝によって起こります。化学レポーターは細胞が代謝できる基質に結合しています。