組み合わせる
COMBINE （生物学における計算モデリングネットワーク）は、システム生物学と関連分野における計算モデルの様々なコミュニティ標準とフォーマットの開発を調整するためのイニシアチブです。[ 1 ]
歴史
COMBINEイニシアチブは、システム生物学グラフィカル表記法（SBGN）とシステム生物学マークアップ言語（SBML）の会議などの、いくつかのより小規模でより焦点を絞った会議やハッカソンに代わる、より広範な科学会議シリーズを開始する試みとして2010年に開始されました。最初のCOMBINE会議はIgor Goryaninによって組織され、 2010年10月にエディンバラ大学情報学部で開催されました。会議の最終セッションの後には、SBMLの10周年を記念するイベントが続きました。[ 2 ] COMBINE会議はそれ以来毎年開催されており、COMBINE 2014は南カリフォルニア大学によって、COMBINE 2015はユタ大学のChris Myersのグループによって組織されます。[ 3 ]
表現形式
COMBINEイニシアチブは、特にシステム生物学における計算モデリングのためのコミュニティ標準とフォーマットの開発を調整することを目的としています。これにより、生物学のあらゆる分野における計算モデリングのあらゆる側面を網羅し、補完的でありながら重複のない一連の標準が開発されることが期待されています。[ 1 ] COMBINE活動でカバーされている主要な表現形式は、BioPAX標準言語、SBGN、SBML、そしてSED-MLおよびCellMLマークアップ言語です。[ 4 ] 関連する標準化活動としては、MIRIAM、SBO、KiSAO、そしてBioModels.netモデルリポジトリがあります。[ 4 ]
参考文献
- ^ a b「生物学ネットワークにおける計算モデリング」 . Combine . 2014年4月23日閲覧。
- ^ 「Events/Forums/COMBINE 2010 - SBML.caltech.edu」 。 2015年8月6日閲覧。
- ^ 「イベント - COMBINE」 。 2015年8月6日閲覧。
- ^ a b「COMBINE活動の対象となる、またはCOMBINE活動に関連する標準」 . Combine . 2014年4月23日閲覧。
外部リンク
