コアオリゴ糖（またはコアOS ）は、グラム陰性 リポ多糖（LPS）に含まれる短い糖鎖です。コアOSは細菌種間、さらには菌株間でも非常に多様性に富んでいます[1] 。
構造
コアドメインには常にオリゴ糖成分が含まれており、これは脂質Aに直接結合し、一般的にはヘプトースや3-デオキシ-D-マンノオクツロソン酸（KDOまたはケト-デオキシオクツロソン酸とも呼ばれる）などの糖が含まれています。 [2]多くの細菌のLPSコアには、リン酸、アミノ酸、エタノールアミン置換基などの非炭水化物成分も含まれています。
文献では多くのコア構造が記述されていますが、本記述は従来の一般的な構造（腸内細菌およびPseudomonas属細菌に見られるもの）に基づいています。大腸菌R1 に見られる構造の概要については、上の図をご覧ください。
内核
内核の「塩基」は1～3個のKDO残基です。最後のKDOは、リン酸基またはエタノールアミン基で修飾されることがよくあります。KDOから2～3個のヘプトース（例：L-グリセロ-D-マンノヘプツロース）が付加され、通常はリン酸化されます。これらのKDOとヘプトースが「内核」を構成します。KDOと脂質A（α2→6）間のケトシド結合は、特に酸分解を受けやすいです。LPS研究者は、弱酸処理を用いてLPSの脂質部分と多糖部分を分離します。
脂質 A と内部コアのみ（またはそれ以下。例を参照）を含む LPS 分子は、「ディープ ラフ LPS」と呼ばれます。
外核
外核は、内核の最後のヘプトース残基に結合したヘキソース残基で構成されています。外核によく見られるヘキソースには、D-グルコース、D-マンノース、D-ガラクトースなどがあります。通常、少なくとも3つのヘキソースがβ1 → 3結合しており、O抗原は3番目のヘキソースに結合しています。その他のヘキソースは、メインオリゴマーから分岐して外核に結合していることがよくあります。
脂質 A と完全なコアオリゴ糖 (内側と外側) を含む LPS は、「粗 LPS」と呼ばれます。
生合成
コアオリゴ糖合成に関与する酵素は大腸菌とサルモネラ菌の間で保存されている。緑膿菌は独自の酵素をいくつか有する。[3] : 273
関数
リポ多糖のコアオリゴ糖が膜挙動に影響を及ぼすメカニズムは十分に解明されていない。
参照
参考文献
- ^ ab Heinrichs DE, Yethon JA, Whitfield C (1998年10月). 「大腸菌およびサルモネラ・エンテリカのリポ多糖類のコア領域における構造多様性の分子的基盤」.分子微生物学. 30 (2): 221–32 . doi :10.1046/j.1365-2958.1998.01063.x. PMID 9791168.
- ^ Hershberger C, Binkley SB (1968年4月). 「3-デオキシ-D-マンノオクツロソン酸の化学と代謝。I. 立体化学測定」. The Journal of Biological Chemistry . 243 (7): 1578–84 . PMID 4296687.[永久リンク切れ]
- ^ King JD, Kocíncová D, Westman EL, Lam JS (2009年10月). 「レビュー：Pseudomonas aeruginosaにおけるリポ多糖生合成」. Innate Immunity . 15 (5): 261– 312. doi : 10.1177/1753425909106436 . PMID 19710102.
