シストウイルス
| シストウイルス科 | |
|---|---|
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| シュードモナスファージphi6粒子、再構成、ゲノム | |
ウイルスの分類 | |
| （ランク外）: | ウイルス |
| レルム: | リボビリア |
| 王国： | オルタナウイルス科 |
| 門: | デュプロルナビリコタ |
| クラス： | ビダベルビリセテス |
| 注文： | ミンディウイルス科 |
| 家族： | シストウイルス科 |
| 属と種 | |
シストウイルスは、細菌に感染する二本鎖RNAウイルスの一種で、シストウイルス科を構成します。シストウイルス科の名称「Cysto」は、ギリシャ語で「膀胱」または「袋」を意味する「kystis」に由来します。この科には7つの属が含まれます。[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
発見
シュードモナスウイルスphi6は、この科で最初に発見されたウイルスであり、1973年にネブラスカ大学リンカーン校のアン・ヴィダバーによって初めてその特徴が明らかにされました。彼女は、細菌株シュードモナス・ファセオリコラHB1OYをハロー枯れ病に感染した豆の茎と培養したところ、培養された芝生に細胞変性効果が検出され、溶菌性微生物またはバクテリオファージが存在することを示唆しました。[ 4 ]
1999年、ニューヨーク大学公衆衛生研究所のレオナルド・ミンディッチ研究室によってphi7–14が同定されました。彼らは、様々な葉をリソジェニーブロスで培養し、そのブロスをPseudomonas syringae pv phaseolicolaの菌床に塗布することで、このウイルスプラークを同定し、その後ゲノム配列を解析しました。[ 5 ]
微生物学
構造
シストウイルス粒子はエンベロープで覆われ、正二十面体および球形の形状をしており、T=13、T=2の対称性を持つ。ウイルス粒子の直径は約85 nmである。[ 1 ] [ 2 ]
ゲノム
シストウイルスは、全長約14 kbpの三分二本鎖RNAゲノムを有する。ゲノムは線状で分節構造をしており、大（L）6.4 kbp、中（M）4 kbp、小（S）2.9 kbpの長さに分類される。ゲノムは12種類のタンパク質をコードしている。[ 1 ] [ 2 ]
ライフサイクル
シストウイルスは、細菌の線毛に吸着し、その後膜融合することで細菌内に侵入する。ウイルスの複製は細胞質内で行われる。複製は二本鎖RNAウイルスの複製モデルに従う。転写は二本鎖RNAウイルスの転写によって行われる。子孫ウイルスは溶解によって細胞外に放出される。[ 1 ] [ 2 ]
同定されているシストウイルスのほとんどはシュードモナス属に感染しますが、スクリーニングと濃縮の方法が原因で偏りがある可能性があります。[ 6 ]この科には多くのメンバーが提案されています。シュードモナスウイルス φ7、φ8、φ9、φ10、φ11、φ12、および φ13 が同定され命名されていますが[ 5 ]、他のシストウイルス様ウイルスも分離されています。[ 6 ]これらの 7 つの推定上の近縁種は、φ6 に近い近縁種 (φ7、φ9、φ10、φ11) または遠い近縁種 (φ8、φ12、φ13) に分類され[ 5 ] 、遠い近縁種は線毛ではなくLPSを介して感染すると考えられています。 [ 7 ]
しかし、シストウイルスはシュードモナス属に感染するだけでなく、ストレプトマイセス属[ 8 ] 、ミクロビルグラ属[ 9 ] 、アシネトバクター属[ 10 ] 、ラクトコッカス属、ペクトバクテリウム属[ 11 ]、そしておそらく他の細菌属にも感染します。
分類学
この科には以下の属と種が含まれる（-ウイルスは属を表す）: [ 12 ]
その他の未割り当てファージ:
- ストレプトマイセスウイルスphi0 [ 8 ]
- ラクトコッカスウイルスphi7-4 [ 11 ]
- ペクトバクテリウムウイルスMA14 [ 11 ]
- アシネトバクターウイルスCAP3 [ 10 ]
- アシネトバクターウイルスCAP4 [ 10 ]
- アシネトバクターウイルスCAP5 [ 10 ]
- アシネトバクターウイルスCAP6 [ 10 ]
- アシネトバクターウイルスCAP7 [ 10 ]
参考文献
- ^ a b c d「ICTV レポート シストウイルス科」。
- ^ a b c d「Viral Zone」 . ExPASy . 2015年6月15日閲覧。
- ^ 「NCBI Taxonomy Browser: Cystoviridae」 . NCBI . 2016年6月19日閲覧。
- ^ Vidaver AK, Koski RK, Van Etten JL (1973年5月). 「バクテリオファージΦ6 a 脂質含有Pseudomonas phaseolicolaウイルス」 . Journal of Virology . 11 (15): 799– 805. doi : 10.1128/jvi.11.5.799-805.1973 . PMC 355178. PMID 16789137 .
- ^ a b c Mindich L, Qiao X, Qiao J, Onodera S, Romantschuk M, Hoogstraten D (1999年8月). 「分節化二本鎖RNAゲノムを有する追加バクテリオファージの単離」 . J. Bacteriol . 181 (15): 4505–8 . doi : 10.1128/JB.181.15.4505-4508.1999 . PMC 103579. PMID 10419946 .
- ^ a b Silander OK, Weinreich DM, Wright KM, et al. (2005年12月). 「陸生バクテリオファージ間の広範な遺伝子交換」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 102 (52): 19009–14 . Bibcode : 2005PNAS..10219009S . doi : 10.1073/pnas.0503074102 . PMC 1323146. PMID 16365305 .
- ^ Gottlieb P, Potgieter C, Wei H, Toporovsky I (2002). 「φ6に関連するバクテリオファージφ12の特性：大型二本鎖RNAのヌクレオチド配列」 . Virology . 295 (2): 266– 271. doi : 10.1006/viro.2002.1436 . PMID 12033785 .
- ^ a b Krishnamurthy, Siddharth R.; Janowski, Andrew B.; Zhao, Guoyan; Barouch, Dan; Wang, David (2016). 「RNAバクテリオファージ多様性の超拡大」 . PLOS Biology . 14 (3) e1002409. doi : 10.1371/journal.pbio.1002409 . PMC 4807089 .
- ^ Cai, Xiaoyao; Tian, Fengjuan; Teng, Li; Liu, Hongmei; Tong, Yigang; Le, Shuai; Zhang, Tingting (2021). 「Microvirgula aerodenitrificansに感染する溶菌性二本鎖RNAバクテリオファージの培養は、相互的な寄生生活様式を明らかにする」 . Journal of Virology . 95 (17) e0039921. doi : 10.1128/JVI.00399-21 . PMC 8354237. PMID 34133887 .
- ^ a b c d e f Crippen, CS; Zhou, B.; Andresen, S.; Patry, RT; Muszyński, A.; Parker, CT; Cooper, KK; Szymanski, CM (2021). 「RNAと糖：多剤耐性アシネトバクター・ラジオレシステンスLH6株に感染するバクテリオファージの特異な特性」.ウイルス. 13 ( 8): 1652. doi : 10.3390/v13081652 . PMC 8402811. PMID 34452516 .
- ^ a b cシストウイルス科. NCBI分類.
- ^ 「ウイルス分類：2024年版」国際ウイルス分類委員会。 2025年5月4日閲覧。
外部リンク
