アトゥム

アトゥム
会社の種類プライベート
業界バイオテクノロジー
設立2003
創設者シュリダール・ゴビンダラジャン、クレス・グスタフソン、ジェレミー・ミンシュル、ジョン・ネス
本部
製品人工遺伝子合成タンパク質工学タンパク質生産バイオインフォマティクス、細胞株開発、トランスポザーゼ

ATUMはアメリカのバイオテクノロジー企業です。最適化されたDNAの設計と合成、タンパク質生産GMP細胞株開発のためのツールを提供しています。

会社

ATUM(旧DNA2.0)は2003年にカリフォルニア州メンロパーク設立されました。非公開企業[ 1 ]であり、研究開発と生産はすべてカリフォルニア州で行われており、現在はニューアークにある5万平方フィートの施設で行われています。[ 2 ] ATUMは、学術機関、政府機関、製薬、化学、農業、バイオテクノロジー業界向けに遺伝子合成タンパク質工学を提供する企業として始まり、現在も事業を続けています。多くの学術研究機関や企業の研究室では、遺伝子合成が分子クローニングに急速に取って代わり、「バイオテクノロジー時代のファウンドリー」として、生物学研究のためのオーダーメイドの遺伝子製造を可能にしました。[ 3 ]

DNA2.0はPBSの番組「Nova ScienceNow」[ 4 ]で紹介され、実験室で遺伝子がどのように合成されるかを紹介しました。2008年には、合成細菌ゲノムを作成するために使用されたDNA配列の一部を提供しました。[ 5 ]

ダン・ラザー・レポートは、合成生物学に関するエピソードにDNA2.0を取り上げ[ 6 ]、この分野が「世界が直面している最も重要な問題のいくつか」をどのように解決しているかを紹介した[ 6 ] 。

2009年、The Scientist誌はDNA2.0が開発したコドン設計アルゴリズム[ 7 ](現在はGeneGPSとして商標登録されている)を、生命科学におけるその年の「トップ10イノベーション」の1つに挙げた。[ 8 ] ATUMは、 IIS型制限酵素SapIとT4 DNAリガーゼを単一チューブ反応で使用するユニバーサルクローニングシステムであるElectra Vector Systemを開発した。 [ 9 ] ATUMは、合成蛍光タンパク質などの一部の分子成分をDNAパーツのオープンアクセスコレクション(BioBricks Foundation)で利用できるようにしている。[ 10 ] Atumは、遺伝子合成産業におけるバイオセキュリティを促進する国際遺伝子合成コンソーシアム(IGSC)の創設メンバーである。[ 11 ] [ 12 ] DNA2.0の製品やサービスを使用して発表された科学論文は1,200件以上[ 13 ]あり、そのうち44件[ 14 ]には同社の従業員が著者として含まれています。

研究ツール

パートナーシップ

  • ペンシルバニア大学ペレルマン医学部は、 ATUMが開発したGeneGPS技術を主に、生体内でのタンパク質発現を最適化することでHIV-1ワクチン開発における遺伝子治療プログラムの研究を支援するために使用します。 [ 20 ] [ 21 ]
  • ロンドン大学セントジョージ校の感染免疫研究センターとアトゥムは、植物由来の医薬品の開発で提携した。[ 22 ]
  • Adimab LLC. と ATUM は、抗体ライブラリーの設計と構築を通じて、抗体の発見とバイオ製造の分野で提携しています。
  • Cytovance Biologics は、バイオ製​​造を成功させるための微生物株開発用の Keystone Expression System の一部として、ATUM の GeneGPS を活用しています。
  • アーチャー・ダニエルズ・ミッドランド社は、 ATUM独自のタンパク質工学技術であるProteinGPSをADMの産業用酵素工学プロセスに適用しています。[ 23 ]
  • ATUM は、MIT の Natalie Kuldell 博士によって設立された、中学生、高校生の生徒と教師を対象とした合成生物学に関する実践的なアクティビティと情報アニメーションのリソースである BioBuilder のスポンサーです。

参考文献

  1. ^ Duan, Mary (2009年10月18日). 「遺伝子合成:DNA 2.0にとって負担ではない」 . Silicon Valley Business Journal . サンノゼ, カリフォルニア州.
  2. ^ 「DNA2.0、カリフォルニア州ニューアークに最先端のバイオ製造施設を建設」 MercuryNews.com サンノゼ・マーキュリー・ニュース。 2016年3月22日閲覧
  3. ^ポラック(2007年9月12日)「遺伝子はいかがですか?バイオファブが注文を受ける」ニューヨーク・タイムズ紙。ニューヨーク。
  4. ^ 「人工生命」 Nova ScienceNow 2005年10月18PBS
  5. ^ポラック(2008年1月24日)「科学者たちは人工生命に向けて新たな一歩を踏み出す」ニューヨーク・タイムズ紙。ニューヨーク。
  6. ^ a b「Cutting Edge」ダン・ラザー・レポート、2013年4月30日、AXS TV
  7. ^ Welch; Govindarajan; Ness; Villalobos; Gurney; Minshull; Gustafsson (2009年9月14日). 「大腸菌における合成遺伝子発現を制御するための設計パラメータ」 . PLOS ONE . 4 (9) e7002. Bibcode : 2009PLoSO...4.7002W . doi : 10.1371/journal.pone.0007002 . PMC 2736378. PMID 19759823 .  
  8. ^「2009年トップ10イノベーション」『ザ・サイエンティスト23 (12): 41–52 . 2009年12月1日。
  9. ^ Whitman、Gore、Ness、Theodorou、Minshull(2013年6月)、「SapI、T4 DNAリガーゼ、DNA2.0 Electra Vector Systemを用いた遺伝子断片の迅速で傷のないクローニング」(PDF)NEB ExpressionsII:8
  10. ^ Ledford, Heidi (2013年7月4日). 「バイオエンジニアは特許の先を見据える」 . Nature . 499 (7456). Macmillan Publishers Limited: 16–17 . Bibcode : 2013Natur.499...16L . doi : 10.1038/499016a . PMID 23823774 . 
  11. ^ Hayden, Erika Check (2009年11月18日). 「遺伝子メーカーが安全保障連合を形成」 Nature . doi : 10.1038 /news.2009.1095 .
  12. ^ 「遺伝子合成企業がバイオセキュリティプロトコルを策定」遺伝子工学・バイオテクノロジーニュース、2009年11月18日
  13. ^ 「文献データベース全検索」 DNA2.0 2016年4月29日。
  14. ^ 「文献データベース検索著者所属:DNA2.0」 DNA2.0 2016年4月29日。
  15. ^ Villalobos, Alan; Ness, Jon E; Gustafsson, Claes; Minshull, Jeremy; Govindarajan, Sridhar (2006). Gene Designer:人工DNAセグメント構築のための合成生物学ツール」 . BMC Bioinformatics . 7 285. doi : 10.1186/1471-2105-7-285 . PMC 1523223. PMID 16756672 .  
  16. ^ Villalobos, Alan; Welch, Mark; Minshull, Jeremy (2012). 「In Silico Design of Functional DNA Constructs」. Gene Synthesis . Methods in Molecular Biology. Vol. 852. pp.  197– 213. doi : 10.1007/978-1-61779-564-0_15 . ISBN 978-1-61779-563-3. PMID  22328435 .
  17. ^ Welch, M; Villalobos, A; Gustafsson, C; Minshull, J (2011). 「タンパク質発現を成功させるための遺伝子設計」.合成生物学 パートB - コンピュータ支援設計とDNAアセンブリ. Methods in Enzymology. 第498巻. pp.  43– 66. doi : 10.1016/B978-0-12-385120-8.00003-6 . ISBN 978-0-12-385120-8. PMID  21601673 .
  18. ^ダンス、アンバー(2012年7月1日)。「母なる自然よ、去れ」ザ・サイエンティスト
  19. ^「ベスト・オブ・ザ・ウェブ」。遺伝子工学ニュース。2007年4月15日。
  20. ^ 「DNA2.0テクノロジーによる遺伝子発現の最適化」 GEN 2012年11月14日。
  21. ^ McEnery, Regina (2013年2月4日)、「Delivering the DNA」VAX: The Bulletin on AIDS Vaccine Research11 (1)、2014年11月29日時点のオリジナルよりアーカイブ2014年11月19日閲覧。
  22. ^ Cohen, Bryan (2013年12月24日). 「DNA2.0、セントジョージ病院とのバイオ医薬品提携を発表」 . Vaccine News .
  23. ^ 「ADMとDNA2.0、タンパク質工学技術へのアクセスおよびサービスに関する契約を締結」サンノゼ・マーキュリー・ニュース、カリフォルニア州サンノゼ、2014年11月17日。