DNAグリコシラーゼ

塩基除去修復に関与する酵素

DNAグリコシラーゼは、塩基除去修復に関与する酵素ファミリーであり、EC番号EC 3.2.2に分類されています。塩基除去修復は、 DNA中の損傷した塩基を除去し、置換するメカニズムです。DNAグリコシラーゼはこのプロセスの第一段階を触媒します。DNAグリコシラーゼは、糖-リン酸骨格をそのままに、損傷した窒素塩基を除去し、一般的にAP部位と呼ばれる脱プリン/脱ピリミジン部位を生成します。これは、損傷した塩基を二重らせん構造から反転させ、続いてN-グリコシド結合を切断することによって達成されます。[1]

グリコシラーゼは細菌で初めて発見され、その後、あらゆる生物界で発見されています。塩基除去修復における役割に加え、DNAグリコシラーゼ酵素は、A. thaliana、N. tabacum、その他の植物において、活性脱メチル化による遺伝子サイレンシングの抑制に関与していることが示唆されています。5-メチルシトシン残基が除去され、非メチル化シトシンに置換されることで、転写とそれに続く翻訳に必要な酵素やタンパク質のクロマチン構造へのアクセスが可能になります。[2] [3]

単機能性グリコシラーゼと二機能性グリコシラーゼ

グリコシラーゼには、単機能性と二機能性の2つの主要なクラスがあります。単機能性グリコシラーゼはグリコシラーゼ活性のみを有しますが、二機能性グリコシラーゼはAPリアーゼ活性も有しており、DNAのリン酸ジエステル結合を切断することで、 APエンドヌクレアーゼを必要とせずに一本鎖切断を引き起こします。グリコシラーゼリアーゼによるAP部位のβ脱離により、5'リン酸に隣接する3'α,β-不飽和アルデヒドが生成されます。これはAPエンドヌクレアーゼの切断産物とは異なります。[4] 一部のグリコシラーゼリアーゼはさらにδ脱離を行い、3'アルデヒドを3'リン酸に変換します。

生化学的メカニズム

DNAグリコシラーゼの最初の結晶構造は、大腸菌Nthで得られました[5] 。 この構造から、酵素が損傷した塩基を二重らせん構造から活性部位のポケットへと反転させ、除去することが明らかになりました。その後、下図に示すヒトUNGを含む他のグリコシラーゼも同様の一般的なパラダイムに従うことが発見されました。N-グリコシド結合を切断するために、単官能性グリコシラーゼは活性化水分子を用いて基質の1番炭素を攻撃します。一方、二官能性グリコシラーゼは、シッフ塩基中間体を経て、アミン残基を求核剤として用いて同じ炭素を攻撃します。

グリコシラーゼの種類

多くのグリコシラーゼの結晶構造が解明されています。構造の類似性に基づき、グリコシラーゼは4つのスーパーファミリーに分類されます。UDGファミリーとAAGファミリーは小型でコンパクトなグリコシラーゼを含み、MutM/FpgファミリーとHhH-GPDファミリーは複数のドメインを持つ大型の酵素を含みます。[4]

多種多様なグリコシラーゼが、様々な損傷塩基を認識するように進化してきました。以下の表は、一般的に研究されているモデル生物における既知のグリコシラーゼの特性をまとめたものです。

細菌、酵母、ヒトのグリコシラーゼ[6] [7]
大腸菌 セレウス菌 酵母（S. cerevisiae） 人間 タイプ 基質
アルカ アルケE マグ1 MPG（N-メチルプリンDNAグリコシラーゼ） 単機能 3-meA（3-アルキルアデニン）、ヒポキサンチン
UDG ウン1 国連 単機能 ウラシル
フラッシュ オッグ1 h OGG1 二機能性 8-オキソG（8-オキソグアニン）、FapyG
N番目 Ntg1 hNTH1 二機能性 Tg、hoU、hoC、尿素、FapyG（2,6-ジアミノ-4-ヒドロキシ-5-ホルムアミドピリミジン）
Ntg2
ネイ 存在しない hNEIL1 二機能性 Tg、hoU、hoC、尿素、FapyG、FapyA（4,6-ジアミノ-5-ホルムアミドピリミジン）
hNEIL2 APサイト、hoU
hNEIL3 未知
ミュートY 存在しない hMYH 単機能 A:8-オキソG
存在しない 存在しない hSMUG1 単機能 U、hoU(5-ヒドロキシウラシル)、hmU(5-ヒドロキシメチルウラシル)、fU(5-ホルミルウラシル)
存在しない 存在しない TDG 単機能 T:G ミスペア
存在しない 存在しない MBD4 単機能 T:G ミスペア
アルキルC アルキルC 存在しない 存在しない 単機能 アルキルプリン
アルクD アルクD 存在しない 存在しない 単機能 アルキルプリン

DNA グリコシラーゼは、基質に基づいて次のカテゴリに分類できます。

ウラシルDNAグリコシラーゼ

塩基除去修復酵素ウラシル-DNAグリコシラーゼの構造。ウラシル残基は黄色で示されている。

分子生物学において、ウラシルDNAグリコシラーゼ（UDG）というタンパク質ファミリーは、DNAの変異を修復する酵素です。最も一般的な変異は、シトシンからウラシルへの脱アミノ化です。UDGはこれらの変異を修復します。UDGはDNA修復に不可欠であり、UDGがなければこれらの変異は癌につながる可能性があります。[8]

このエントリは、ウラシルDNAグリコシラーゼと関連DNAグリコシラーゼ（EC Archived 2019-09-25 at the Wayback Machine）を表すものであり、例えばウラシルDNAグリコシラーゼ、[9] 好熱性ウラシルDNAグリコシラーゼ、[10] G:T/Uミスマッチ特異的DNAグリコシラーゼ（Mug）、[11]および一本鎖選択的単官能性ウラシルDNAグリコシラーゼ（SMUG1）[12]などである。

ウラシルDNAグリコシラーゼはDNAからウラシルを除去します。これはシトシンの自発的な脱アミノ化、またはDNA複製中のdAの反対側のdUの誤った取り込みによって起こります。このファミリーの典型的なメンバーは大腸菌UDGで、最初に発見されたグリコシラーゼの一つです。哺乳動物細胞では、UNG、SMUG1、TDG、MBD4の4つの異なるウラシル-DNAグリコシラーゼ活性が特定されています。これらは基質特異性や細胞内局在が異なります。SMUG1は基質として一本鎖DNAを好みますが、二本鎖DNAからもUを除去します。修飾されていないウラシルに加えて、SMUG1は環C5に酸化基を持つ5-ヒドロキシウラシル、5-ヒドロキシメチルウラシル、および5-ホルミルウラシルを切除できます。 [13] TDGとMBD4は二本鎖DNAに厳密に特異的です。 TDGは、グアニンの反対側に存在するチミングリコールだけでなく、5位炭素が修飾されたU誘導体も除去することができます。最新の知見によると、ヒト細胞において、TDGとSMUG1は、自発的なシトシン脱アミノ化によって引き起こされるU:Gミスマッチの修復を担う主要な酵素であり、一方、dUの誤取り込みによってDNAに生じたウラシルは、主にUNGによって処理されることが示唆されています。MBD4は、CpG部位における5-メチルシトシンからチミンへの脱アミノ化によって生じるT:Gミスマッチを修正すると考えられています。[14] MBD4変異マウスは正常に発達し、癌感受性の増加や生存率の低下は示しません。しかし、小腸上皮細胞のCpG配列においてCT変異がより多く発生します。[15]

DNAと複合したヒトUNGの構造は、他のグリコシラーゼと同様に、標的ヌクレオチドを二重らせん構造から活性部位ポケットへと反転させることが明らかになった。[16] UDGは、開いた非結合状態から閉じたDNA結合状態へと 構造変化を起こす。 [17]

タンパク質ファミリー
UDG
エプスタイン・バーウイルスウラシルDNAグリコシラーゼとPBS-2由来のUGIの複合体
識別子
シンボルUDG
ファムPF03167
インタープロIPR005122
プロサイトPDOC00121
SCOP21udg / スコープ / SUPFAM
CDDcd09593
利用可能なタンパク質構造:
ファム  構造 / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム構造の概要

歴史

リンダールはDNAにおけるウラシルの修復を初めて観察した。UDGは大腸菌から精製され、DNA骨格のデオキシリボース糖と塩基を繋ぐN-グリコシド結合を加水分解した。 [8]

関数

UDG の機能は DNA の変異を除去すること、具体的にはウラシルを除去することです。

構造

これらのタンパク質は3層のα/β/α構造を有する。UDGのポリペプチドトポロジーは、典型的なα/βタンパク質のものである。その構造は、主に中央の4本鎖の平行βシートと、その両側を合計8本のαヘリックスが囲む構造から成り、平行二重巻きβシートと呼ばれる。[9]

機構

ウラシル-DNAグリコシラーゼは、DNAのN-グリコシド結合を切断することでウラシル残基を除去し、塩基除去修復経路を開始するDNA修復酵素です。DNA中のウラシルは、シトシンの脱アミノ化によって変異原性U:Gミスペアを形成するか、DNAポリメラーゼによるdUMPの取り込みによってU:Aペアを形成することで生じます。[18]これらの異常なウラシル残基は遺伝毒性があります。[19]

ローカリゼーション

真核細胞では、UNG活性は核とミトコンドリアの両方に認められます。ヒトUNG1タンパク質はミトコンドリアと核の両方に輸送されます。[20]

保全

ウラシルDNAグリコシラーゼの配列は、細菌や真核生物、そしてヘルペスウイルスにおいて非常によく保存されている[ 21 ]。より遠縁のウラシルDNAグリコシラーゼは、ポックスウイルスにも存在する[22]。UNG1の N末端77アミノ酸はミトコンドリアへの局在に必要と思われるが、ミトコンドリア輸送ペプチドの存在は直接実証されていない。最もN末端に保存されている領域にはアスパラギン酸残基が含まれており、 X線構造に基づいて[23] 、触媒機構における一般的な塩基として作用することが提案されている。

家族

UDGファミリーにはファミリー1とファミリー2の2つがあります。ファミリー1はssDNAとdsDNA中のウラシルに対して活性を示します。ファミリー2はグアニンとのミスマッチからウラシルを除去します。[8]

酸化塩基のグリコシラーゼ

dA ( anti )との Hoogsteen 塩基対の8-oxoG ( syn )

様々なグリコシラーゼが、細胞代謝中に生成される活性酸素種によって一般的に形成される酸化塩基を認識するように進化してきた。グアニン残基に形成される最も豊富な損傷は、2,6-ジアミノ-4-ヒドロキシ-5-ホルムアミドピリミジン（FapyG）と8-オキソグアニンである。複製中にアデニンと誤って対合するため、8-オキソGは変異原性が高く、GからTへの転座を引き起こす。この損傷の修復は、Cと対合した8-オキソGを認識する二機能性DNAグリコシラーゼOGG1によって開始される。hOGG1は、ヘリックス-ヘアピン-ヘリックス（HhH）ファミリーに属する二機能性グリコシラーゼである。MYHは8-オキソGと誤って対合したアデニンを認識し、Aを除去して8-オキソGをそのまま残す。 OGG1ノックアウトマウスでは腫瘍発生率の上昇は見られないが、加齢とともに肝臓に8-oxoGが蓄積する。[24] MYHの不活性化でも同様の表現型が観察されるが、MYHとOGG1の同時不活性化は肺や小腸を含む複数の組織に8-oxoGが蓄積する。[25]ヒトでは、MYHの変異は大腸ポリープや大腸がん の発生リスク増加と関連している。OGG1とMYHに加えて、ヒト細胞にはNEIL1、NEIL2、およびNEIL3という3つのDNAグリコシラーゼが含まれている。これらは細菌のNeiと相同性があり、その存在がOGG1およびMYHノックアウトマウスの軽度の表現型を説明できると考えられる。

アルキル化塩基のグリコシラーゼ

このグループには、大腸菌AlkAおよび高等真核生物の関連タンパク質が含まれます。これらのグリコシラーゼは単機能であり、3-メチルアデニンなどのメチル化塩基を認識します。

アルカ

AlkAは3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼIIを指します。[26]

病理学

  • 塩基除去修復（BER）に関与するDNAグリコシラーゼは、BRCA1およびBRCA2変異キャリアの癌リスクと関連している可能性がある。[27]

がんにおけるエピジェネティックな欠陥

DNAグリコシラーゼ遺伝子のエピジェネティックな変化（エピ変異）は、他のDNA修復経路（ミスマッチ修復におけるMLH1や直接的な逆転におけるMGMTなど）に作用する遺伝子のエピ変異に関するこれまでの多数の研究と比較すると、ごく少数の癌において最近になって評価され始めたばかりである。[要出典] 癌で発生するDNAグリコシラーゼ遺伝子のエピ変異の2つの例を以下にまとめる。

MBD4

シトシンからウラシルへの加水分解

MBD4（メチルCpG結合ドメインタンパク質4）は、塩基除去修復の初期段階で利用されるグリコシラーゼである。MBD4タンパク質は、完全にメチル化されたCpG部位に優先的に結合する。[28] これらの変化した塩基は、シトシンからウラシルへの加水分解（画像参照）と5-メチルシトシンからチミンへの加水分解が頻繁に起こることで生じ、G:UおよびG:T塩基対を生成する。[29] これらの塩基対の不適切なウラシルまたはチミンがDNA複製前に除去されない場合、遷移 突然変異を引き起こす。MBD4は、CpG部位内でグアニン（G）と対になったTおよびUの除去を特異的に触媒する。[30]ヒト癌における遺伝子内一塩基対突然変異 の約1/3はCpGジヌクレオチドで起こり、G:CからA:Tへの遷移の結果であるため、これは重要な修復機能である。[30] [31] これらのトランジションは、ヒト癌において最も頻繁に発生する変異です。例えば、大腸癌における腫瘍抑制遺伝子p53の体細胞変異の約50%は、CpG部位におけるG:CからA:Tへのトランジションです。[30] したがって、MBD4の発現低下は、発癌性変異の増加を引き起こす可能性があります。

MBD4の発現は、MBD4のプロモーター領域のメチル化により、ほぼすべての大腸腫瘍で低下しています。[32] また、大腸癌の約4％では、変異によりMBD4が欠乏しています。[33]

大腸の腫瘍性増殖（腺腫および大腸癌）を囲む組織学的に正常な領域の大部分も、大腸腫瘍を一度も患ったことのない人の組織学的に正常な組織と比較して、MBD4 mRNAの発現が低下している（領域欠損）ことを示しています。[32]この知見は、MBD4のエピジェネティックサイレンシングが大腸癌発生の初期段階であることを示唆しています。

評価された中国人集団では、MBD4 Glu346Lys多型は子宮頸がんのリスクを約50％減少させることと関連しており、MBD4の変化がこのがんにおいて重要であることを示唆している。[34]

ニール1

Nei-like (NEIL) 1は、Neiファミリー（NEIL2とNEIL3も含む）のDNAグリコシラーゼである。[35] NEIL1は、複製前の酸化塩基の監視に必要なDNA複製複合体の構成要素であり、NEIL1がグリコシラーゼとして作用して酸化損傷を受けた塩基を除去できるようになるまで、複製を遅らせる「カウキャッチャー」として作用すると考えられる。[35]

NEIL1タンパク質は、特定の酸化損傷塩基を認識（標的とする）して除去し、 β,δ脱離によって脱塩基部位を切断して、3'および5'リン酸末端を残す。NEIL1は、酸化ピリミジン、ホルムアミドピリミジン、メチル基で酸化されたチミン残基、およびチミングリコールの両立体異性体を認識する。[36] ヒトNEIL1に最適な基質は、 8-オキソGのさらなる酸化生成物であるヒダントイン損傷、グアニジノヒダントイン、およびスピロイミノジヒダントインであると思われる。NEIL1は、一本鎖DNAだけでなく、バ​​ブルDNAやフォークDNA構造からも損傷を除去することができる。 NEIL1の欠損は8-オキソ-Gua:Cペアの部位での突然変異の増加を引き起こし、ほとんどの突然変異はG:CからT:Aへの転座である。[37]

2004年の研究では、原発性胃癌の46%でNEIL1 mRNAの発現が低下していることが明らかになったが、その低下のメカニズムは不明であった。[38] この研究では、胃癌の4%でNEIL1遺伝子の変異が認められた。著者らは、NEIL1遺伝子の発現低下および／または変異に起因するNEIL1活性の低下が、胃癌の発生にしばしば関与していると示唆した。

頭頸部扁平上皮癌（HNSCC）患者20名の組織と非癌患者5名の頭頸部粘膜サンプルを用いて、145個のDNA修復遺伝子の異常なプロモーターメチル化スクリーニングを実施した。[39] このスクリーニングの結果、NEIL1遺伝子の過剰メチル化が大幅に増加していることが示され、評価した145個のDNA修復遺伝子のうち、NEIL1のメチル化頻度が最も有意に異なっていた。さらに、過剰メチル化はNEIL1 mRNA発現の減少と相関していた。さらに、135個の腫瘍組織と38個の正常組織を用いた解析では、HNSCC組織サンプルの71%でNEIL1プロモーターメチル化が上昇していることが示された。[39]

非小細胞肺癌（NSCLC）腫瘍において8つのDNA修復遺伝子を評価したところ、42%のNEIL1プロモーター領域が高メチル化していた。[40]これは、検査された8つのDNA修復遺伝子の中で最も頻繁に発見されたDNA修復異常であった。NEIL1は、大腸癌 においてプロモーター領域が高メチル化していることが発見された6つのDNA修復遺伝子の1つでもある。[41]

参考文献

  1. ^ Lindahl, T. (1986). 「DNA修復におけるDNAグリコシラーゼ」. DNA損傷と修復のメカニズム. 第38巻. pp.  335– 340. doi :10.1007/978-1-4615-9462-8_36. ISBN 978-1-4615-9464-2. PMID  3527146。 {{cite book}}:|journal=無視されました (ヘルプ)
  2. ^ Aguis, F.; Kapoor, A; Zhu, JK (2006). 「アラビドプシスDNAグリコシラーゼ／リアーゼROS1の活性DNA脱メチル化における役割」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (31): 11796– 11801. Bibcode :2006PNAS..10311796A. doi : 10.1073/pnas.0603563103 . PMC 1544249. PMID  16864782 . 
  3. ^ Choi, CS.; Sano, H. (2007). 「タバコDNAから5-メチルシトシンを除去する活性を持つタンパク質をコードするタバコ遺伝子の同定」. Plant Biotechnology . 24 (3): 339– 344. Bibcode :2007PBiot..24..339C. doi : 10.5511/plantbiotechnology.24.339 .
  4. ^ ab Fromme JC, Banerjee A, Verdine GL (2004年2月). 「DNAグリコシラーゼの認識と触媒作用」Current Opinion in Structural Biology . 14 (1): 43–9 . doi :10.1016/j.sbi.2004.01.003. PMID  15102448.
  5. ^ Kuo CF, McRee DE, Fisher CL, O'Handley SF, Cunningham RP, Tainer JA (1992年10月). 「DNA修復酵素[4Fe-4S]エンドヌクレアーゼIIIの原子構造」. Science . 258 (5081): 434–40 . Bibcode :1992Sci...258..434K. doi :10.1126/science.141​​1536. PMID : 1411536  .
  6. ^ Ide H, Kotera M (2004年4月). 「酸化損傷を受けたDNAの修復に関与するヒトDNAグリコシラーゼ」. Biol. Pharm. Bull . 27 (4): 480–5 . doi : 10.1248/bpb.27.480 . PMID  15056851.
  7. ^ Alseth I, Osman F, Korvald H, et al. (2005). 「Schizosaccharomyces pombeにおけるMag1を介した塩基除去修復の生化学的特徴とDNA修復経路の相互作用」Nucleic Acids Res . 33 (3): 1123–31 . doi :10.1093/nar/gki259. PMC 549418. PMID 15722486  . 
  8. ^ abc Pearl LH (2000). 「ウラシル-DNAグリコシラーゼス​​ーパーファミリーの構造と機能」. Mutat Res . 460 ( 3–4 ): 165–81 . doi :10.1016/S0921-8777(00)00025-2. PMID  10946227.
  9. ^ ab Mol CD, Arvai AS, Slupphaug G, Kavli B, Alseth I, Krokan HE, Tainer JA (1995年3月). 「ヒトウラシルDNAグリコシラーゼの結晶構造と変異解析：特異性と触媒作用の構造的基盤」. Cell . 80 (6): 869–78 . doi : 10.1016/0092-8674(95)90290-2 . PMID  7697717. S2CID  14851787.
  10. ^ Sandigursky M, Franklin WA (1999年5月). 「Thermotoga maritima由来の耐熱性ウラシル-DNAグリコシラーゼ：新規DNA修復酵素群の一員」. Curr. Biol . 9 (10): 531–4 . Bibcode :1999CBio....9..531S. doi : 10.1016/S0960-9822(99)80237-1 . PMID  10339434. S2CID  32822653.
  11. ^ Barrett TE, Savva R, Panayotou G, Barlow T, Brown T, Jiricny J, Pearl LH (1998年1月). 「G:T/Uミスマッチ特異的DNAグリコシラーゼの結晶構造：相補鎖相互作用によるミスマッチ認識」. Cell . 92 (1): 117–29 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80904-6 . PMID  9489705. S2CID  9136303.
  12. ^ Buckley B, Ehrenfeld E (1987年10月). 「非感染およびポリオウイルス感染HeLa細胞におけるキャップ結合タンパク質複合体」. J. Biol. Chem . 262 (28): 13599–606 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)76470-9 . PMID  2820976.
  13. ^ 松原 正之、田中 剛志、寺戸 秀、大前 栄、泉 誠、片柳 健、井出 秀 (2004). 「ヒトSMUG1 DNAグリコシラーゼの損傷認識と触媒機構の変異解析」Nucleic Acids Res . 32 (17): 5291– 5302. doi :10.1093/nar/gkh859. PMC 521670. PMID 15466595  . 
  14. ^ Wu, Peiying; Qiu, Chen; Sohail, Anjum; Zhang, Xing; Bhagwat, Ashok S.; Cheng, Xiaodong (2003-02-14). 「メチル化DNAにおけるミスマッチ修復：メチルCpG結合タンパク質MBD4のミスマッチ特異的チミングリコシラーゼドメインの構造と活性」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (7): 5285– 5291. doi : 10.1074/jbc.M210884200 . ISSN  0021-9258. PMC 2764232. PMID 12456671  . 
  15. ^ Wong E; Yang K; Kuraguchi M; Werling U; Avdievich E; Fan K; Fazzari M; Jin B; Brown MC; et al. (1995). 「Mbd4の不活性化はC→T転位変異を増加させ、消化管腫瘍の形成を促進する」. PNAS . 99 (23): 14937– 14942. doi : 10.1073 / pnas.232579299 . PMC 137523. PMID  12417741. 
  16. ^ Mol CD, Arvai AS, Slupphaug G, Kavli B, Alseth I, Krokan HE, Tainer JA (1995). 「ヒトウラシルDNAグリコシラーゼの結晶構造と変異解析」. Cell . 80 (6): 869– 878. doi : 10.1016/0092-8674(95)90290-2 . PMID  7697717. S2CID  14851787.
  17. ^ Slupphaug G, Mol CD, Kavli B, Arvai AS, Krokan HE, Tainer JA. (1996). DNAに結合したヒトウラシル-DNAグリコシラーゼの構造から明らかになったヌクレオチド反転機構. 384: 87-92.
  18. ^ Kavli B, Otterlei M, Slupphaug G, Krokan HE (2007年4月). 「DNA中のウラシル：一般的な変異原性を持つが、獲得免疫においては正常な中間体となる」. DNA Repair (Amst.) 6 ( 4): 505–16 . doi :10.1016/j.dnarep.2006.10.014. PMID  17116429.
  19. ^ Hagen L; Peña-Diaz J; Kavli B; Otterlei M; Slupphaug G; Krokan HE (2006年8月). 「ゲノムウラシルとヒト疾患」. Exp. Cell Res . 312 (14): 2666–72 . doi :10.1016/j.yexcr.2006.06.015. PMID  16860315.
  20. ^ Slupphaug G, Markussen FH, Olsen LC, Aasland R, Aarsaether N, Bakke O, Krokan HE, Helland DE (1993年6月). 「ヒトウラシルDNAグリコシラーゼの核型とミトコンドリア型は同一遺伝子によってコードされている」. Nucleic Acids Res . 21 (11): 2579–84 . doi :10.1093/nar/21.11.2579. PMC 309584. PMID 8332455  . 
  21. ^ Olsen LC, Aasland R, Wittwer CU, Krokan HE, Helland DE (1989年10月). 「高度に保存されたDNA修復酵素、ヒトウラシル-DNAグリコシラーゼの分子クローニング」. EMBO J. 8 ( 10): 3121–5 . doi :10.1002/j.1460-2075.1989.tb08464.x. PMC 401392. PMID 2555154  . 
  22. ^ Upton C, Stuart DT, McFadden G (1993年5月). 「ウラシルDNAグリコシラーゼをコードするポックスウイルス遺伝子の同定」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (10): 4518–22 . Bibcode :1993PNAS...90.4518U. doi : 10.1073/pnas.90.10.4518 . PMC 46543. PMID 8389453  . 
  23. ^ Savva R, McAuley-Hecht K, Brown T, Pearl L (1995年2月). 「ウラシルDNAグリコシラーゼによる特異的塩基除去修復の構造基盤」. Nature . 373 (6514): 487–93 . Bibcode :1995Natur.373..487S. doi :10.1038/373487a0. PMID  7845459. S2CID  4315434.
  24. ^ Klungland A; Rosewell I; Hollenbach S; Larsen E; Daly G; Epe A; Seeberg E; Lindahl T; Barnes DE; et al. (1999). 「酸化塩基損傷の除去に欠陥のあるマウスにおける前変異原性DNA病変の蓄積」. PNAS . 96 (23): 13300– 13305. Bibcode :1999PNAS...9613300K. doi : 10.1073/pnas.96.23.13300 . PMC 23942. PMID 10557315  . 
  25. ^ Russo, Maria Teresa; De Luca, Gabriele; Degan, Paolo; Parlanti, Eleonora; Dogliotti, Eugenia; Barnes, Deborah E.; Lindahl, Tomas; Yang, Hanjing; Miller, Jeffrey H.; Bignami, Margherita; et al. (2004). 「MyhおよびOgg1 DNAグリコシラーゼの両方に欠陥のある腫瘍形成能の高いマウスのDNAにおける酸化塩基病変8-ヒドロキシグアニンの蓄積」Cancer Res . 64 (13): 4411– 4414. doi :10.1158/0008-5472.can-04-0355. PMID  15231648.
  26. ^ Moe E, Hall DR, Leiros I, Monsen VT, Timmins J, McSweeney S (2012). 「デイノコッカス・ラジオデュランス由来の特異な3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼII（AlkA）の構造機能研究」. Acta Crystallogr D. 68 ( 6): 703–12 . doi :10.1107/S090744491200947X. PMID  22683793.
  27. ^ オソリオ、A;ミルン、ロードアイランド州。クーヘンバッカー、K;ヴァクロバ、T;ピタ、G;アロンソ、R;ペテロロンゴ、P;ブランコ、私。デ・ラ・ホーヤ、M;デュラン、M;ディエス、O;ラモン・イ・カハル、T;コンスタントポロウ、私。マルティネス・ブザス、C;アンドレス・コネヘロ、共和党。スーシー、P;マクガフォッグ、L;ワシントン州バローデール。リー、A;スウェー・ブルカ;アーバー、B;ランタラ、J;ローマン、N;エーレンクロナ、H;オイラ島、オロパデ。ミシシッピ州ビーティー。ドムチェク、SM;ネイサンソン、K;テスラ州レベック。他。 （2014年）。 「塩基除去修復に関与するDNAグリコシラーゼは、BRCA1およびBRCA2変異キャリアにおける癌リスクと関連する可能性がある」。PLOS Genetics . 10 (4) e1004256. doi : 10.1371/journal.pgen.1004256 . PMC 3974638. PMID  24698998 . 
  28. ^ Walavalkar, Ninad (2014). 「DNA上のメチルシトシン結合ドメインタンパク質4（MBD4）の溶液構造と分子内交換は、mCpG/TpGミスマッチをスキャンするメカニズムを示唆している」. Nucleic Acids Research . 42 (17): 11218– 11232. doi :10.1093/nar/gku782. PMC 4176167. PMID 25183517  . 
  29. ^ Bellacosa A, Drohat AC (2015年8月). 「CpG部位の遺伝的およびエピジェネティックな完全性維持における塩基除去修復の役割」. DNA Repair . 32 : 33–42 . doi :10.1016/j.dnarep.2015.04.011. PMC 4903958. PMID  26021671 . 
  30. ^ abc Sjolund AB, Senejani AG, Sweasy JB (2013). 「MBD4とTDG：生物学的役割を拡大し続ける多面的なDNAグリコシラーゼ」. Mutation Research . 743– 744: 12– 25. Bibcode :2013MRFMM.743...12S. doi :10.1016/j.mrfmmm.2012.11.001. PMC 3661743. PMID 23195996  . 
  31. ^ Cooper DN, Youssoufian H (1988年2月). 「CpGジヌクレオチドとヒト遺伝病」. Human Genetics . 78 (2): 151–5 . doi :10.1007/bf00278187. PMID  3338800. S2CID  41948691.
  32. ^ ab Howard JH, Frolov A, Tzeng CW, Stewart A, Midzak A, Majmundar A, Godwin A, Heslin M, Bellacosa A, Arnoletti JP (2009年1月). 「大腸がんおよび卵巣がんにおけるDNA修復遺伝子MED1/MBD4のエピジェネティックダウンレギュレーション」. Cancer Biology & Therapy . 8 (1): 94– 100. doi :10.4161/cbt.8.1.7469. PMC 2683899. PMID 19127118  . 
  33. ^ トリカリコ R、コルテッリーノ S、リッチョ A、ジャグモハン＝チャングール S、ファン デル クリフト H、ワイネン J、ターナー D、ヴェントゥーラ A、ロベラ V、ペルセセペ A、ルッチ＝コルディスコ E、ラディーチェ P、ベルタリオ L、ペドロニ M、ポンツ デ レオン M、マンキューソ P、デヴァラジャン K、カイ KQ、クライン サント AJ、ネリG、Møller P、Viel A、Genuardi M、Fodde R、Bellacosa A (2015 年 10 月)。 「ミスマッチ修復欠損腫瘍形成におけるMBD4不活化の関与」(PDF)。オンコターゲット。6 (40): 42892–904。土井:10.18632/oncotarget.5740。PMC 4767479。PMID  26503472。 
  34. ^ Xiong XD, Luo XP, Liu X, Jing X, Zeng LQ, Lei M, Hong XS, Chen Y (2012). 「MBD4 Glu346Lys多型は中国人集団における子宮頸がんリスクと関連している」. Int. J. Gynecol. Cancer . 22 (9): 1552–6 . doi : 10.1097/IGC.0b013e31826e22e4 . PMID  23027038. S2CID  788490.
  35. ^ ab Hegde ML, Hegde PM, Bellot LJ, Mandal SM, Hazra TK, Li GM, Boldogh I, Tomkinson AE, Mitra S (2013). 「ヒトゲノムにおける酸化塩基の複製前修復は、NEIL1 DNAグリコシラーゼと複製タンパク質によって媒介される」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 110 (33): E3090–9. Bibcode :2013PNAS..110E3090H. doi : 10.1073 /pnas.1304231110 . PMC 3746843. PMID  23898192. 
  36. ^ Nemec AA, Wallace SS, Sweasy JB (2010年10月). 「変異塩基除去修復タンパク質：ゲノム不安定性への寄与因子」. Seminars in Cancer Biology . 20 (5): 320–8 . doi :10.1016/j.semcancer.2010.10.010. PMC 3254599. PMID 20955798  . 
  37. ^ 鈴木 剛志、原島 秀、神谷 浩 (2010). 「シトシンおよびアデニンと対をなす8-オキソ-7,8-ジヒドログアニン（8-ヒドロキシグアニン）による変異誘発に対する塩基除去修復タンパク質の影響」DNA修復（Amst.） . 9 (5): 542– 50. doi :10.1016/j.dnarep.2010.02.004. hdl : 2115/43021 . PMID  20197241. S2CID  207147128.
  38. ^ 新村 功、田尾 秀、後藤 正治、五十嵐 秀、谷口 剛、前川 正治、竹崎 剛、杉村 秀 (2004). 「胃癌におけるヒト塩基除去修復遺伝子NEIL1の不活性化変異」.発癌. 25 (12): 2311–7 . doi : 10.1093/carcin/bgh267 . PMID  15319300.
  39. ^ ab Chaisaingmongkol J、Popanda O、Warta R、Dyckhoff G、Herpel E、Geiselhart L、Claus R、Lasitschka F、Campos B、Oakes CC、Bermejo JL、Herold-Mende C、Plass C、Schmezer P (2012)。 「ヒト DNA 修復遺伝子のエピジェネティック スクリーニングにより、頭頸部扁平上皮癌における NEIL1 の異常なプロモーター メチル化が特定されました。」がん遺伝子。31 (49): 5108–16 .土井: 10.1038/onc.2011.660。PMID  22286769。
  40. ^ Do H, Wong NC, Murone C, John T, Solomon B, Mitchell PL, Dobrovic A (2014). 「非小細胞肺癌におけるDNA修復遺伝子プロモーターメチル化の批判的再評価」Scientific Reports 4 4186. Bibcode :2014NatSR...4.4186D. doi :10.1038/srep04186. PMC 3935198. PMID 24569633  . 
  41. ^ Farkas SA, Vymetalkova V, Vodickova L, Vodicka P, Nilsson TK (2014年4月). 「散発性大腸がんにおいて頻繁に変異する遺伝子およびDNA修復・Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路遺伝子におけるDNAメチル化変化」.エピゲノミクス. 6 (2): 179–91 . doi :10.2217/epi.14.7. PMID  24811787.
この記事には、パブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR005122のテキストが組み込まれています。
  • ウィキメディア・コモンズのDNAグリコシラーゼ関連メディア
  • 米国国立医学図書館医学件名表（MeSH）のDNA+グリコシラーゼ
「https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=DNA_glycosylase&oldid=1314020590」より取得