
浮力密度遠心分離(等密度遠心分離または平衡密度勾配遠心分離とも呼ばれる)は、浮力の概念を利用して、溶液中の分子を密度の違いによって分離します。
歴史的には塩化セシウム(CsCl)溶液がよく使用されていましたが、より一般的にはショ糖またはパーコール溶液が密度勾配溶液として使用されています。この用途では、高密度でありながら比較的低い粘度を持つ溶液が必要であり、CsClは水への溶解度が高く、Csの質量が大きいため密度が高く、CsCl溶液は粘度が低く安定性が高いため適しています。[ 1 ]
サンプルを溶液の上に置き、チューブを非常に高速で長時間(時には数日間)回転させます。CsCl分子は底部に向かって密集するため、密度(およびCsCl濃度)の異なる層が連続的に勾配を形成します。元の溶液の密度はほぼ同じであるため、サンプルの密度とCsClの密度が一致する層まで移動し、その層で鮮明で特徴的なバンドを形成します。

この方法は非常に鋭敏に分子を分離し、異なる分子同位体同士を分離することさえ可能である。[ 2 ]この方法はメセルソン・スタールの実験で利用されている。
DNAの大部分の浮力密度は1.7g/cm 3 [ 3 ]で、これは6M CsCl溶液の密度に等しい。DNAの浮力密度はGC含有量によって変化する。「サテライトDNA」とは、主成分DNAの上(A+Tに富む)または下(G+Cに富む)に浮かぶ、異なる塩基組成を持つ反復DNA配列の小さなバンドを指す。