フレックスエイド

フレキシブル人工知能ドッキング（FlexAID）
原作者	ルイ・フィリップ・モランシー、フランシス・ゴードロー、ラファエル・J・ナジュマノヴィッチ
リポジトリ	github .com /NRGlab /FlexAID
書かれた	C、C++
オペレーティング·システム	Linux、macOS、Win64 （2022年以降はサポートと開発が中止されます）
プラットフォーム	x86_64、ARMベースのシステムオンチップ（Apple M1 [ Pro Max ]）
タイプ	タンパク質-リガンドドッキング
ライセンス	Apacheライセンス
Webサイト	nrglab .github .io

FlexAIDは、低分子やペプチドをリガンド、タンパク質や核酸をドッキングターゲットとして使用できる分子ドッキングソフトウェアです。その名の通り、FlexAIDはリガンドの柔軟性だけでなく、ターゲットの側鎖の柔軟性も完全にサポートします。FlexAIDは、2つの表面（リガンドとターゲット）の相補性に基づくソフトスコアリング機能を用いてこれを実現します。

FlexAIDは、結合ポーズの予測において、AutoDock VinaやFlexXといった既存の広く使用されているソフトウェアよりも優れた性能を示すことが示されています。これは特に、ホモロジーモデルを用いる場合のように、標的の柔軟性が極めて重要な場合に当てはまります。 ^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]}ソースコードはApacheライセンスの下でGitHubで公開されています。^{[ 4 ]}

グラフィカルユーザーインターフェース

FlexAID用のPyMOLプラグインであるNRGsuiteもオリジナルの著者によって開発されました。^{[ 5 ]}

参照

• ドッキング（分子）
• バーチャル上映
• タンパク質-リガンドドッキングソフトウェアの一覧

参考文献

1. 「計算システムと構造薬理学」 . biophys.umontreal.ca . Najmanovich研究グループ. 2025年12月17日閲覧。
2. Morency, Louis-Philippe; Gaudreault, Francis; Najmanovich, Rafael (2018). 「NRGsuiteと分子ドッキングソフトウェアFlexAIDの計算創薬・設計への応用」.計算創薬・設計. 分子生物学の方法. 第1762巻. pp.  367– 388. doi : 10.1007/978-1-4939-7756-7_18 . ISBN 978-1-4939-7755-0. PMID  29594781 .
3. Gaudreault, Francis; Najmanovich, Rafael J. (2015-07-27). 「FlexAID：非ネイティブ複合体構造におけるドッキングの再考」(PDF) . Journal of Chemical Information and Modeling . 55 (7): 1323– 1336. doi : 10.1021/acs.jcim.5b00078 . ISSN 1549-9596 . PMID 26076070 .  
4. GitHub - NRGlab/FlexAID: 柔軟な人工知能ドッキング。NRGlab、2018年2月28日、 2019年5月22日取得
5. Gaudreault, Francis; Morency, Louis-Philippe; Najmanovich, Rafael J. (2015-12-01). 「NRGsuite: FlexAIDを用いてドッキングシミュレーションをリアルタイムで実行するPyMOLプラグイン」 . Bioinformatics . 31 (23): 3856– 3858. doi : 10.1093/bioinformatics/btv458 . ISSN 1367-4803 . PMC 4653388. PMID 26249810 .   

外部リンク

• — ナジマノビッチ研究グループのリソース