リガメンウイルス目
リガメンウイルス目
ウイルスの分類この分類を編集する
（ランク外）: ウイルス
レルム: アドナビリア
王国： ジリグビラエ
門: タレアビリコタ
クラス： トキビリケテス
注文： リガメンウイルス目
家族

リガメンウイルス目は、サーモプロテオータ門（旧クレンアーキオータ門）の古細菌に感染し、二本鎖DNAゲノムを持つ線状ウイルスの目である。 [ 1 ]この目は2012年にデイビッド・プランギシュビリとマート・クルポビッチによって提唱され、その後、国際ウイルス分類委員会（ICTV）によって作成された。 [ 2 ]

名前

名前は、糸や繊維を意味するラテン語のligamenに由来します。

分類学

この目には、チヨウウイルス科、リポスリックスウイルス科、ルディウイルス科、ウングラウイルス科の4つの科があります。[ 2 ]

ウイルス粒子は糸状で、らせん状のヌクレオカプシドを有しています。両端には繊維、あるいは宿主との接着に関与するより複雑な構造が付着しています。[ 3 ] [ 4 ]

リポトリックスウイルスとルディウイルスの両方の主要なコートタンパク質は、珍しい4つのらせん束のトポロジーを持っています。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]ゲノムは、分節のない線状二本鎖DNAです。2つのファミリーのウイルスは、最大10個の遺伝子を共有しています。2つのファミリーの主な違いは、ルディウイルス科のメンバーはエンベロープを持たないのに対し、リポトリックスウイルスのヌクレオカプシドは脂質膜に囲まれていることです。さらに、ルディウイルスのカプシドは単一の主要なカプシドタンパク質から構成されているのに対し、リポトリックスウイルスのカプシドは2つのパラログの主要なカプシドタンパク質から形成されます。どちらのグループのウイルスでも、主要なカプシドタンパク質は、dsDNAを包み込む爪のような二量体（ルディウイルスではホモ二量体、リポトリックスウイルスではヘテロ二量体）を形成します。

リガメンウイルス科のメンバーは、リポトリックスウイルス科と同様に、リガメンウイルス科と同じ折り畳み構造を持つ2つの相同な主要カプシドタンパク質をコードする、トリストロマウイルス科の古細菌ウイルスと構造的に関連している。 [ 9 ]これらの構造的類似性により、リガメンウイルス目とトリストロマウイルス科は、「トキビリセテス」クラスに統合することが提案された（トキはグルジア語で「糸」を意味し、ビリセテスはウイルスクラスの公式接尾辞である）。[ 9 ]

参考文献

  1. ^ Prangishvili D ; Krupovic M (2012). 「二本鎖DNAウイルス、リガメンウイルス目の新たな分類群の提案」Arch Virol . 157 (4): 791– 795. doi : 10.1007/s00705-012-1229-7 . PMID  22270758 .
  2. ^ a b「ウイルス分類：2024年版」国際ウイルス分類委員会。 2025年3月5日閲覧。
  3. ^ 「ウイルスゾーン：リポスリックスウイルス」 ExPASy . 2023年9月14日閲覧。
  4. ^ 「ウイルスゾーン：ルディウイルス科」 ExPASy . 2023年9月14日閲覧。
  5. ^ Goulet A, Blangy S, Redder P, Prangishvili D, Felisberto-Rodrigues C, Forterre P, Campanacci V, Cambillau C (2009) Acidianus filamentous virus 1のコートタンパク質は、糸状古細菌ウイルスの系統にまたがるらせん状の折り畳み構造を示す。PNAS 106 (50) 21155–60
  6. ^ DiMaio, F; Yu, X; Rensen, E; Krupovic, M; Prangishvili, D; Egelman, EH (2015). 「ウイルス学．超好熱菌に感染するウイルスはA型DNAをカプシド化する」．Science．348 ( 6237 ) : 914–7 . doi : 10.1126 / science.aaa4181．PMC 5512286．PMID 25999507．  
  7. ^ Kasson, P; DiMaio, F; Yu, X; Lucas-Staat, S; Krupovic, M; Schouten, S; Prangishvili, D; Egelman, EH (2017). 「糸状超好熱ウイルスにおける新規膜エンベロープモデル」 . eLife . 6 e26268. doi : 10.7554 / eLife.26268 . PMC 5517147. PMID 28639939 .  
  8. ^ Liu, Y; Osinski, T; Wang, F; Krupovic, M; Schouten, S; Kasson, P; Prangishvili, D; Egelman, EH (2018). 「超好熱性好酸菌に感染する膜エンベロープ糸状ウイルスの構造保全」 . Nature Communications . 9 (1): 3360. Bibcode : 2018NatCo...9.3360L . doi : 10.1038/ s41467-018-05684-6 . PMC 6105669. PMID 30135568 .  
  9. ^ a bワン、フォンビン;バケロ、ダイアナ P;蘇、張麗。オシンスキー、トマシュ。プランギシヴィリ、デイビッド。イーゲルマン、エドワード・H;クルポビッチ、マート（2020）。「糸状ウイルスの構造は古細菌ウイルス圏内の家族関係を明らかにする」。ウイルスの進化。6 (1) veaa023。土井：10.1093/ve/veaa023。PMC 7189273。PMID 32368353。  
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