コンピュータ支援有機合成ソフトウェアの一覧
コンピュータ支援有機合成ソフトウェアは、有機化学において計算化学と連携して使用されるアプリケーションソフトウェアの一種であり、化学反応の設計、予測、生成といったタスクの効率化を支援します。CAOSは、出発化合物から目的の分子を生成する一連の化学反応を特定することを目的としています。CAOSアルゴリズムは通常、2つのデータベースを使用します。1つは既知の化学反応のデータベース、もう1つは既知の出発物質（通常は市販されている分子）のデータベースです。望ましい合成計画は、コストが低く、収率が高く、危険な反応や中間体の使用を回避します。CAOSは一般的に計画問題として扱われており、大きな進歩を遂げてきました。
CAOSプログラム
- CAS搭載のM1 RetroScore – デモ版あり。CAS SciFinderデータでトレーニングしたMLモデルに基づく[1]
- シンセセウス – [2]
- ChemAIRS – デモ版あり。Chemical.AIが商用ソフトウェアスイートとして開発。逆合成に加えて、SA（合成アクセシビリティ）スコアやプロセスケミストリーといった独自の機能も備えている。[ 1 ]
- Spaya – Iktosが提供する無料でアクセス可能な逆合成計画ツール。 2023年6月11日にWayback Machineにアーカイブ。
- IBM RXN – IBMが開発した、無料でアクセスできるクラウドベースのサービス。AIモデルを用いて化学反応を予測し、逆合成経路を生成します。このツールスイートは、有料会員向けにロボット統合やモデルの微調整といった追加機能も提供しています。[3]
- AiZynthFinder –アストラゼネカとベルン大学の共同開発により開発された、自由にアクセスできるオープンソースの逆合成計画ツール。AiZynthFinderは、与えられた標的化合物への合成経路を予測し、公開されているものでも独自のものでも、ユーザー独自のデータセットを用いて再学習させることができます。 [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]
- Manifold – PostEraが開発した、学術ユーザーが自由にアクセスできる化合物検索および逆合成計画ツール。 2022年1月13日にWayback Machineでアーカイブ。
- WODCA – 試用版なし、プロプライエタリソフトウェア[ 5 ]
- 有機合成探索ツール（OSET） -オープンソースソフトウェア、放棄された[ 6 ]
- CHIRON – 試用版なし、プロプライエタリソフトウェア[ 7 ]
- SynGen – デモ版。独自のソフトウェア。自動有機合成生成のための独自のプログラム。与えられたターゲット有機化合物の最短かつ最低コストの合成経路を生成することに重点を置いており、合成計画に役立つツールです。
- LHASA – デモ版は利用可能だがリンクされていない(?)。プロプライエタリソフトウェア
- SYLVIA – デモ版。独自ソフトウェア。有機化合物の合成容易性を迅速に評価。数千の構造（例えば、デノボ設計実験によって生成されたものや、大規模な仮想化合物ライブラリから取得されたもの）を合成の複雑さに応じて優先順位付けできる[ 8 ]
- ChemPlanner（旧称ARChem – Route Designer）は、化学者が標的分子の合成経路を設計するのを支援するエキスパートシステムです。反応ルールの知識ベースは反応データベースからアルゴリズム的に導出され、市販の出発物質は逆合成探索の終点として使用されます。
- ICSYNTH – デモ版あり。独自ソフトウェア。化学者が標的分子の合成経路と多段階のインタラクティブな合成ツリーを生成できるようにするコンピュータ支援合成設計ツール。その中核となるのは、反応データベースから自動的に生成される変換ライブラリのアルゴリズム化学知識ベースです。[ 9 ]
- Chematica（現在はSynthiaとして知られています）
- ASKCOS – オープンソースの合成計画および計算化学ツールスイート。[ 10 ]
参照
- 分子力学モデリングソフトウェアの比較
- 分子設計ソフトウェア
- 分子エディター
- GPUによる分子モデリング
- ナノ構造モデリング用ソフトウェア一覧
- 半経験的量子化学法
- 周期境界条件を用いた固体物理学における計算化学手法
- 原子価結合プログラム
参考文献
- ^ "Chemical.AI" . chemical.ai . 2025年2月5日閲覧。
- ^ AiZynthFinder GitHub
- ^ AiZynthFinder 論文
- ^ AiZynthFinder: 医薬品分野におけるデータセットとそのパフォーマンスに関する論文
- ^ WODCA
- ^オセト
- ^ "CHIRON" . 2015年4月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。2013年2月18日閲覧。
- ^シルビア
- ^ ICSYNTH
- ^ "ASKCOS MIT" . askcos.mit.edu . 2025年5月11日閲覧。
