モルケル

モルケル
開発者	スイス国立スーパーコンピューティングセンター
安定版リリース	5.4 / 2009年8月 （2009-08）
リポジトリ	github.com / ugovaretto /molekel
オペレーティングシステム	Linux、Microsoft Windows、Mac OS X
タイプ	分子モデリング
ライセンス	GNU一般公衆利用許諾契約書
ウェブサイト	ugovaretto .github .io /molekel /

Gaussian03 の Mulliken 静電ポテンシャル B3LYP/6-31G* のマッピングを使用した DFT を使用して決定されたノルボルニルカチオンの電子密度プロット。Gaussian cube ファイルを使用して molekel で描画された画像。この画像では、正電荷は青色で表示されています。

Molekelは、フリーソフトウェアのマルチプラットフォーム分子可視化プログラムです。^{[ 1 ]}元々は1990年代にジュネーブ大学のPeter F. FlükigerによってSilicon Graphics Computers向けに開発されました。1998年にStefan Portmannが開発を引き継ぎ、バージョン3.0をリリースしました。バージョン4.0はほぼプラットフォームに依存しないバージョンでした。その後、Stefan Portmannは開発を中断し、バージョン4.3へと発展しました。2006年、スイス国立スーパーコンピューティングセンター（CSCS）のUgo Varettoがプロジェクトを再開し、2006年12月21日にバージョン5.0がリリースされました。^{[ 2 ]}

Molekel はVTKと Qwt を使用するため、 Qtも使用します。

主な特徴

• 残留物の可視化（リボンまたは模式図）
• 分子表面の生成（境界ボックスと解像度）を完全に制御
• 次のサーフェスの視覚化:

• 軌道
• 電子密度データからの等値面
• ガウスキューブグリッドデータからの等値面
• 溶媒接触表面（SAS）
• 溶媒排除表面（SES）
• ファンデルワールス半径

• 分子表面のアニメーション
• PostScriptまたはTIFFにエクスポート

参照

• Gabedit
• 分子グラフィックスシステムの一覧
• モールデン
• 分子グラフィックス
• 分子力学モデリング用ソフトウェア
• サムソン
• 無料およびオープンソースソフトウェアパッケージのリスト

参考文献

1. ノエル・オブログ
2. Molekel About 2009年8月27日アーカイブ（Wayback Machine）

外部リンク

• モレケルホームページ