ニール2

ニール2
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1VZP
識別子
エイリアス	NEIL2、NEH2、NEI2、nei like DNA グリコシラーゼ 2
外部ID	オミム: 608933 ; MGI : 2686058 ;ホモロジーン: 17032 ;ジーンカード: NEIL2 ; OMA : NEIL2 - オルソログ
遺伝子の位置（マウス） キリスト 14番染色体（マウス）[ 1 ] バンド 14|14 D1 始める 63,419,892 bp [ 1 ] 終わり 63,431,305 bp [ 1 ]
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 微小管結合 亜鉛イオン結合 加水分解酵素活性、N-グリコシル化合物を加水分解する 金属イオン結合 グリコシル結合に作用する加水分解酵素活性 損傷したDNA結合 タンパク質結合 触媒活性 リアーゼ活性 核酸結合 DNA（アプリンまたはアピリミジン部位）エンドヌクレアーゼ活性 加水分解酵素活性 DNA N-グリコシラーゼ活性 クラスI DNA（アプリンまたはアピリミジン部位）エンドヌクレアーゼ活性 細胞成分 細胞質 微小管細胞骨格 紡錘体微小管 核 核質 細胞内膜小器官 生物学的プロセス ヌクレオチド除去修復 DNA損傷刺激に対する細胞応答 脱ピリミジン化 代謝 塩基除去修復 DNA修復 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 252969 382913 アンサンブル ENSG00000154328 ENSMUSG00000035121 ユニプロット Q969S2 Q6R2P8 RefSeq (mRNA) NM_001135746 NM_001135747 NM_001135748 NM_145043 NM_201610 RefSeq（タンパク質） NP_001129218 NP_001129219 NP_001129220 NP_659480 NP_001336368 NP_001336369 NP_001336370 NP_001336371 NP_963904 場所（UCSC） 該当なし 14章: 63.42 – 63.43 Mb PubMed検索 [ 2 ] [ 3 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

エンドヌクレアーゼVIII様2は、ヒトではNEIL2遺伝子によってコードされている酵素である。^{[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]}

NEIL2は、細菌のFpg/Neiファミリーと相同性のあるDNAグリコシラーゼのクラスに属します。これらのグリコシラーゼは、活性酸素種によって損傷を受けた塩基を切断し、関連するリアーゼ反応を介してDNA鎖切断を誘導することで、塩基除去修復の第一段階を開始します（Bandaru et al., 2002）[OMIM提供] ^{[ 6 ]}

参照

• ニール1
• ニール3
• OGG1
• NTHL1

参考文献

1. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000035121 – Ensembl、2017年5月
2. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
3. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. Hazra TK, Kow YW, Hatahet Z, Imhoff B, Boldogh I, Mokkapati SK, Mitra S, Izumi T (2002年8月). 「シトシン由来病変の修復における新規ヒトDNAグリコシラーゼの同定と特性評価」 . J Biol Chem . 277 (34): 30417–20 . doi : 10.1074/jbc.C200355200 . PMID 12097317 . 
5. Das S, Chattopadhyay R, Bhakat KK, Boldogh I, Kohno K, Prasad R, Wilson SH, Hazra TK (2007年9月). 「酸化ストレス下におけるYB-1との相互作用によるNEIL2を介した酸化塩基除去修復の促進」 . J Biol Chem . 282 (39): 28474–84 . doi : 10.1074/jbc.M704672200 . PMC 2679419. PMID 17686777 .  
6. "Entrez Gene: NEIL2 ネイライク 2 (大腸菌)" .

さらに読む

• 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID  8125298 .
• 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID  9373149 .
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」 . Genome Res . 10 (11): 1788–95 . doi : 10.1101 / gr.143000 . PMC  310948. PMID  11076863 .
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ作成に向けて：新規完全タンパク質コードヒトcDNA500個の配列決定と解析」. Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC  311072. PMID 11230166  .
• Takao M, Kanno S, Kobayashi K, et al. (2003). 「Nth1ノックアウトマウスのバックアップグリコシラーゼは機能的なNei（エンドヌクレアーゼVIII）ホモログである」 . J. Biol. Chem . 277 (44): 42205–13 . doi : 10.1074/jbc.M206884200 . PMID  12200441 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウスの完全長cDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Bandaru V, Sunkara S, Wallace SS, Bond JP (2003). 「酸化DNA損傷を除去し、大腸菌エンドヌクレアーゼVIIIと相同性を持つ新規ヒトDNAグリコシラーゼ」DNA Repair (Amst.) . 1 (7): 517–29 . doi : 10.1016/S1568-7864(02)00036-8 . PMID  12509226 .
• Dou H, Mitra S, Hazra TK (2004). 「ヒトDNAグリコシラーゼNEIL1およびNEIL2によるDNAバブル構造中の酸化塩基の修復」 . J. Biol. Chem . 278 (50): 49679–84 . doi : 10.1074/jbc.M308658200 . PMID  14522990 .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039 .
• 片渕 明、中野 哲也、正岡 明 他(2004)。「酸化塩基損傷に対するヒトおよび大腸菌エンドヌクレアーゼ III および VIII ホモログの特異性の差異」。Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。279 (14): 14464–71 .土井: 10.1074/jbc.M400393200。PMID  14734554。
• Bhakat KK, Hazra TK, Mitra S (2004). 「ヒトDNAグリコシラーゼNEIL2のアセチル化とその活性阻害」 . Nucleic Acids Res . 32 (10): 3033–9 . doi : 10.1093 / nar/gkh632 . PMC  434438. PMID  15175427 .
• Das A, Rajagopalan L, Mathura VS, et al. (2004). 「ヒトNEIL2（Nei-like-2）タンパク質におけるジンクフィンガードメインの同定」 . J. Biol. Chem . 279 (45): 47132–8 . doi : 10.1074/jbc.M406224200 . PMID  15339932 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）の現状、品質、および拡大」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC  528928. PMID 15489334  .
• Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeomeから生物学へ：機能ゲノミクスパイプライン」 . Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC  528930. PMID  15489336 .
• Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). 「LIFEdbデータベース 2006」 . Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8. doi : 10.1093/nar/ gkj139 . PMC  1347501. PMID  16381901 .
• Das A, Wiederhold L, Leppard JB, et al. (2007). 「NEIL2を介したAPE非依存性DNA酸化塩基修復：ヒト細胞における修復複合体の存在を示す証拠」 . DNA Repair (Amst.) . 5 (12): 1439–48 . doi : 10.1016/j.dnarep.2006.07.003 . PMC  2805168. PMID  16982218 .
• Broderick P, Bagratuni T, Vijayakrishnan J, et al. (2006). 「家族性大腸がん素因におけるNTHL1、NEIL1、NEIL2、MPG、TDG、UNG、およびSMUG1遺伝子の評価」 . BMC Cancer . 6 : 243. doi : 10.1186/1471-2407-6-243 . PMC  1624846. PMID  17029639 .
• 片淵 明、松原 正之、寺戸 秀一、他 (2007). 「酸化ピリミジン損傷に対するヒトDNAグリコシラーゼの損傷特異性」 . Nucleic Acids Symp Ser (Oxf) . 48 (48): 175–6 . doi : 10.1093/nass/48.1.175 . PMID  17150535 .