PMEL（遺伝子）

PMEL
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1TVB、1TVH、3CC5、4IS6、5EU6、5EU4、5EU3​​​​​​​​
識別子
エイリアス	PMEL、D12S53E、ME20、ME20-M、ME20M、P1、P100、PMEL17、SI、SIL、SILV、gp100、プレメラノソームタンパク質、HMB-45、HMB45
外部ID	オミム: 155550 ; MGI : 98301 ;ホモロジーン: 5048 ;ジーンカード: PMEL ; OMA : PMEL - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 12番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 12q13.2 始める 55,954,105 bp [ 1 ] 終わり 55,973,317 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 10番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 10 D3|10 77.13 cM 始める 1億2854万6400塩基対[ 2 ] 終わり 128,556,107 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 網膜色素上皮 太ももの皮膚 外陰部 腹部の皮膚 睾丸 子宮頸管 人間のペニス 腕の皮膚 乳首 生殖腺 上位の表現 虹彩 毛包 毛様体 水晶体上皮 卵形嚢 結膜円蓋 精子細胞 角膜 網膜色素上皮 前庭感覚上皮 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 細胞成分 多小胞体 膜 細胞外領域 多小胞体膜 膜の不可欠な構成要素 エンドソーム 細胞膜 小胞体 メラノソーム ゴルジ体 小胞体膜 細胞膜の不可欠な構成要素 生物学的プロセス メラニン生合成プロセス メラノソーム組織 発達性色素沈着 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6490 20431 アンサンブル ENSG00000185664 ENSMUSG00000025359 ユニプロット P40967 Q60696 Q9CZB2 RefSeq (mRNA) NM_001200053 NM_001200054 NM_006928 NM_001320121 NM_001320122 NM_001384361 NM_021882 RefSeq（タンパク質） NP_001186982 NP_001186983 NP_001307050 NP_001307051 NP_008859 NP_068682 場所（UCSC） 12章: 55.95 – 55.97 MB 10章: 128.54 – 128.56 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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メラノサイトタンパク質PMELは、プレメラノソームタンパク質（PMEL）、シルバーローカスタンパク質ホモログ（SILV）、糖タンパク質100（gp100）とも呼ばれ、ヒトではPMEL遺伝子によってコードされているタンパク質です。^{[ 5 ] [ 6 ]}その遺伝子産物は、PMEL、シルバー、ME20、gp100、またはPmel17と呼ばれることもあります。

構造と機能

PMELはI型膜貫通糖タンパク質で、主にメラノソーム（皮膚や眼の色素細胞のメラノサイトにおけるメラニン産生細胞小器官）およびほとんどの悪性黒色腫に発現しています。661アミノ酸から成り、質量は100kDaです。

このタンパク質は、メラニン生成、メラノソーム生合成、およびメラニン重合（アイゼンバーグ）[1]を含むメラノソームの成熟に関与している。膜貫通型PMELは、分泌経路においてN結合型オリゴ糖の合成、ならびにO結合型オリゴ糖の付加および修飾によって修飾される。その後、PMELは色素小器官であるメラノソームの前駆体に標的化され、そこでタンパク質分解によって複数の小さな断片に分解される。これらの断片の一部は非病理的なアミロイドを形成し、シート状に集合してメラノソームの超微細構造の基礎となる横紋パターンを形成する。PMELの切断は、フーリンファミリーのプロタンパク質転換酵素、 α-ディスインテグリン・メタロプロテアーゼ（ADAM）ファミリーのメンバーを含む可能性のある「シェダーゼ」、そしてメラノソームまたはその前駆体中のその他のプロテアーゼなど、複数のプロテアーゼによって媒介される。アミロイド形成領域が切断された後、残った小さな膜貫通断片はγセクレターゼによって消化されます。

PMEL遺伝子の発現は小眼球症関連転写因子（MITF）によって制御されている。^{[ 7 ] [ 8 ]}

がんとがん治療における機能

gp100 タンパク質は黒色腫抗原、すなわち腫瘍関連抗原です。

その短い断片はgp100:209-217(210M)を含むgp100癌ワクチンの開発に使用されてきた。^{[ 9 ]}

親水性組換えgp100タンパク質（HR-gp100）は、in vitro試験においてヒトの健常皮膚に局所塗布され、マウスモデルにおいてワクチンとして使用されています。HR-gp100はヒト皮膚に浸透し、ヒト樹状細胞によって処理・提示されることが実証されています。マウスモデルにおいて、HR-gp100をベースとしたワクチンは、増殖​​アッセイ、ELISA、およびIFN-γの細胞内染色によって、抗原特異的T細胞応答を誘発することが示されました。

gp100タンパク質は分化抗原を含んでおり[2]、メラノーマ免疫療法の標的として広く研究されてきました。GP100ペプチドの異なる配列は、腫瘍に対する免疫化に利用できる可能性があります。ある症例研究によると、GP100-209やGP100-208といったGP100の改変体は、抗原特異的CTL（細胞傷害性Tリンパ球）の数を増加させ、がん細胞を標的として殺傷できることが示されています（Eisenberg）。[3]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000185664 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000025359 – Ensembl、2017年5月
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4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
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6. 「Entrez Gene: SILV silver homolog (mouse)」。
7. Du J, Miller AJ, Widlund HR, Horstmann MA, Ramaswamy S, Fisher DE (2003). 「MLANA/MART1とSILV/PMEL17/GP100はメラノサイトおよびメラノーマにおいてMITFによって転写制御されている」 . Am. J. Pathol . 163 (1): 333– 43. doi : 10.1016/ S0002-9440 (10)63657-7 . PMC 1868174. PMID 12819038 .  
8. Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (2008). 「2段階DNAマイクロアレイ戦略を用いた新規MITF標的の同定」 . Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665– 76. doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971. S2CID 24698373 .  
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さらに読む

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外部リンク

• PDBe-KBのUniProt : P40967 (メラノサイトタンパク質 PMEL)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。