| ポティウイルス | |
|---|---|
| プラムポックスウイルスのゲノム、電子顕微鏡写真、ウイルス粒子のモデル | |
| ウイルスの分類 | |
| (ランク外): | ウイルス |
| レルム: | リボビリア |
| 王国: | オルタナウイルス科 |
| 門: | ピスビリコタ |
| クラス: | ステルパビリセテス |
| 注文: | パタタビラレス |
| 家族: | ポティウイルス科 |
| 属: | ポティウイルス |
| 種 | |
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本文参照 | |
ポティウイルスは、ポティウイルス科に属するプラス鎖RNAウイルスの属(その基準種であるジャガイモウイルスY(Potyvirus yituberosi、 PVY)にちなんで命名)である。植物が自然宿主となる。ベゴモウイルスと同様に、この属のウイルスは、農業、牧畜、園芸、観賞用の作物に甚大な被害をもたらす可能性がある。200種以上のアブラムシがポティウイルスを媒介し、そのほとんどはAphidinae亜科( Macrosiphum属およびMyzus属)に属する。 [要出典]この属には190種が含まれており、ポティウイルスは現在知られている植物ウイルスの約30%を占めている。 [1] [2]
構造
ウイルス粒子はエンベロープを持たず、長さ680~900ナノメートル(nm)、直径11~20nmの屈曲性かつ糸状のヌクレオカプシドを有する。 [1]ヌクレオカプシドには約2000個のカプシドタンパク質が含まれている。ヌクレオカプシドの対称性はらせん状で、ピッチは3.4~3.5nmである。[1]
ゲノム

ゲノムは9,000~12,000ヌクレオチド塩基からなる直鎖状のプラス鎖一本鎖RNAです。ほとんどのポティウイルスは非分節ゲノムですが[1] 、いくつかの種は二分節ゲノムです。タイプ種PVYの最も一般的な非組換え株の典型的な塩基組成は、Gが約23.4~23.8%、Aが約31~31.6%、Cが約18.2~18.8%、Uが約26.5~26.8%です[3]。
単分節ゲノムを持つ種では、ゲノムに連結されたVPgタンパク質が5'末端に共有結合し、3'末端はポリアデニル化されている。ゲノムは単一のオープンリーディングフレーム(ORF)をコードし、350 kDaのポリタンパク質前駆体として発現する。このポリタンパク質は、10個のより小さなタンパク質に分解される。タンパク質1プロテアーゼ(P1-Pro)、ヘルパーコンポーネントプロテアーゼ(HC-Pro)、タンパク質3(P3)、円筒状封入体(CI)、ウイルスタンパク質ゲノム連結体(Vpg)、核封入体A(NIa)、核封入体B(NIb)、カプシドタンパク質(CP)、そして6K1および6K2として知られる2つの小さな推定タンパク質である。P3シストロンには、「Pretty interesting Potyviridae ORF」(PIPO)と呼ばれる重複するリーディングフレームも含まれる。[4] PIPOはP3タンパク質の代替C末端をコードしており、これは保存されたGA 6反復配列におけるリボソームスリッページ機構によって引き起こされる+2フレームシフトによって、転写産物のサブセットに生成される。[5] [6]結果として生じるタンパク質はP3N-PIPOと呼ばれる。同様の機構により、サツマイモ羽毛状斑紋ウイルス( Potyvirus batataplumei)を含む多くのサツマイモ感染性ポティウイルスにおいて、P1シストロン内に「pretty interesting sweet potatoes potyvirus ORF」(PISPO)と呼ばれる代替リーディングフレームが生成されると考えられている。 [ 7]
プロテオーム

P1(分子量約33キロダルトン(kDa))はセリン プロテアーゼであり、P1-HC-Pro接合部におけるポリタンパク質からの切断を促進する。[8] P1は保存されたC末端プロテアーゼドメインと、ポティウイルス種間で配列と長さに大きなばらつきがあるものの、保存された固有の無秩序パターンを示すN末端領域から構成される。P1はウイルスRNAの複製も促進するが、複製には必須ではない。[9]
HC-Pro (~52 KDa) は、自身のC 末端でグリシン- グリシン ジペプチドを切断するシステイン プロテアーゼです。 [8]また、真核生物感染開始因子 4 (eIF4) と相互作用します。宿主のAGOタンパク質との相互作用を介して、ウイルスのRNA サイレンシングサプレッサーとして機能します。 [10] HC-Pro の活性は隣接する P1 タンパク質によって制御されます。P1 が P1-HC-Pro 中間体を切断する前に、P1 末端が HC-Pro の RNA サイレンシング抑制活性を低下させます。 [8]そのため、P1 切断速度が感染中の RNA 干渉抑制のレベルを制御します。HC-Pro はアブラムシの伝染にも関与しています。 [11]正確なメカニズムは不明ですが、HC-Pro は N 末端のジンクフィンガー様ドメインを介して宿主のアブラムシの口器に付着し、カプシド タンパク質との相互作用を介してウイルス粒子を固定すると提案されています。 [12]
P3(約41 kDa)は、ウイルスの複製に必要な膜タンパク質であり、ウイルス複製小胞に蓄積します。[13] P3は、複製小胞と移動複合体タンパク質との相互作用を媒介し、複製小胞を移動複合体にリクルートして効率的な細胞間移動を可能にすると考えられています。[14] P3は、リブロース-1,5-ビスリン酸カルボキシラーゼ/オキシゲナーゼの大サブユニットとも相互作用します。[要出典]
CI (約71 kDa)は、 ATPase活性を持つRNAヘリカーゼである。[15]その最も珍しい特性は、中央の空洞円筒から外側に放射状に広がる積層シートが折り畳まれ、「風車」とよく表現されるパターンを形成する、大きく高度に対称的な円錐状および円筒状の封入体を形成する能力である。これらの封入体は、感染組織の透過型電子顕微鏡写真で容易に観察でき、歴史的にはポティウイルス感染の診断基準として使用されていた。CI封入体は、原形質連絡で組み立てられるポティウイルス移動複合体の主要構成要素である。CIはウイルスの複製にも必要であり、複製膜上に存在している。複製へのCIの正確な寄与は明らかではないが、RNAヘリカーゼとして、CIはウイルスRNAの二次構造を解体することで複製を促進していると考えられる。
NIa(約50 kDa)は宿主核内で結晶性封入体を形成し、NIa-ProとVPgに切断される。
NIa-Pro(約27 kDa)は、ポリタンパク質の切断部位のほとんどを処理するシステインプロテアーゼである。 [16]唯一の例外は、P1とHC-Proの自己切断である。切断配列の高度特異性と保存性により、NIa-Pro(多くの場合、タバコエッチウイルスのもの)はバイオテクノロジー、特にアフィニティー精製後に組み換えタンパク質からアフィニティータグを除去する必要がある用途において貴重なツールとなっている。NIa-Proはまた、配列非依存性のDNase活性を示し、宿主DNAのメチル化を阻害することが示されている。これは、NIaおよび/またはNIa-Proが宿主遺伝子発現を変化させていることを示唆している。[17]ポティウイルスNIa-Proは、ピコルナウイルス3Cプロテアーゼと高いレベルの相同性を共有している。[18]
VPg(約22 kDa)は、ウリジル化を介してウイルスゲノムRNAの5'末端に共有結合しており、ピコルナウイルス科のVPgタンパク質と同様に、ウイルスゲノム複製のプライマーとして機能すると考えられています。[19] VPgは非常に不規則なタンパク質であり、その柔軟性により、他の多くのウイルスタンパク質と相互作用することが示唆されています。VPgは、真核生物開始因子4E(eIF4E)、真核生物伸長因子1A(eEF1A)、ポリ(A)結合タンパク質(PABP)など、さまざまな宿主タンパク質とも相互作用します。[20] [21]
NIb(約59 kDa)は、スーパーファミリーIIに属するRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)であり、複製中にウイルスRNAを重合する。[22] NIaと同様に、NIbは2つの核局在配列を有するため、宿主核内に封入体を形成し、そこに輸送される。NIbは、RdRpに典型的な3つのドメインからなる「手のひら、親指、指」の構造を有する。
6K1(約6 kDa)の機能は不明ですが、複製小胞に蓄積し、膜貫通ドメインを持っていることから、6K1はウイルス誘導性小胞形成に寄与すると考えられています。[23]
6K2(約6 kDa)は、宿主膜をウイルス誘導膜構造に再配置する膜貫通タンパク質です。 [24] 6K2は様々なER出口部位タンパク質と相互作用して小胞および管状の伸長部を生成し、最終的に複製小胞へと成熟します。[25] 6K2には3つの主要なドメインがあります。細胞間移動に必要なN末端ドメイン、中央の疎水性膜貫通αヘリックス、およびウイルス複製に必要なC末端ドメインです。[26]
P3N-PIPO(約25 kDa)は、移動複合体をプラズモデスマに固定する専用の移動タンパク質である。[27]また、プラズモデスマのアクチンフィラメントを切断し、カロースの沈着を減少させる宿主タンパク質と相互作用することにより、プラズモデスマのサイズ排除限界を調節する可能性がある。[28] [29]リブロース-1,5-ビスリン酸カルボキシラーゼ/オキシゲナーゼの大サブユニットと小サブユニットの両方と相互作用する。[要出典]
CP(約30~35 kDa)はカプシドタンパク質です。2つの末端ドメインを持ち、これらは無秩序に配列し、ウイルス粒子の表面に露出しています。[30] [31]中央のコアドメインには、ウイルスRNAと結合するRNA結合ポケットがあります。ポティウイルスでは、カプシドタンパク質の構造は高度に保存されていますが、配列の変異は比較的大きいです。CPコアドメインは、ウイルス粒子をカプシドで包むだけでなく、細胞間移動にも必要であり、種子の伝播にも寄与します。[32]
特定の非定型ポティウイルスは、P1-PISPO、アルキル化B(AlkB)、イノシン三リン酸ピロホスファターゼ(ITPaseまたはHAM1として知られる)などの追加のタンパク質またはタンパク質ドメインをコードしています。[33]このような異常は、しばしば高可変性P1-HC-Pro領域に存在します。[8]
ライフサイクル

伝染 ; 感染
ほとんどのポティウイルスは、アブラムシが吸血時に口針で植物組織を探ることで媒介されます。[34]ポティウイルスはアブラムシの体内で循環したり増殖したりすることはなく、通常はアブラムシの体内で数分間しか持続しません。特定のポティウイルスは、媒介アブラムシの吸血パターンを変化させることが示されており、感染植物上での滞在時間が長くなる、探針を使わない吸血時間が短くなる、師管液の摂取量が増えるといった症状が現れることがあります。
種子や花粉による伝染は、特定のポティウイルス種、例えばPVYやカブモザイクウイルス(Potyvirus rapae、 TUMV)で記録されています。[35]感染した塊茎や接ぎ木材料による栄養伝染は、それぞれジャガイモや果樹などの特定の農作物にとって特に懸念されます。
感染した植物や汚染された道具、衣服、水との接触によっても感染する可能性がある。[36]
翻訳
ポティウイルスは侵入後、粒子の殻を脱ぎ捨て、ゲノムRNAを宿主細胞質に放出する。ポティウイルスRNAは宿主mRNAを模倣する。5'VPgタンパク質は5'キャップと機能的に類似しており、3'末端はポリアデニル化されている。[37] VPgとeIF4EおよびeIF4(iso)Eとの相互作用により、ウイルスは宿主のキャップ依存性翻訳機構を利用して翻訳することができる。真核生物の翻訳と同様に、VPg-eIF4E相互作用はウイルスRNAの周囲に eIF4F複合体を形成する。
多くのポティウイルス種では弱い内部リボソーム進入部位(IRES)が同定されているが、キャップ非依存性翻訳がポティウイルスにとって重要な翻訳機構であるかどうかは分かっていない。[37]
レプリケーション
他の多くのプラス鎖RNAウイルスと同様に、ポティウイルスの複製は宿主膜と深く関わっている。[1] [38]ウイルスの6K2タンパク質は、宿主膜を様々な感染関連構造へと再配置する役割を担う。ポティウイルスの種類によって、小さな円形のウイルス小胞から、多数の嚢または葉片を持つ複雑な球状構造まで、様々な構造をとる。これらの構造にはウイルス複製複合体が点在しており、「複製小胞」、「ウイルス質」、「ウイルス工場」などと呼ばれることが多い。複製小胞膜は様々な宿主細胞小器官に由来し、その起源はポティウイルスの種類によって異なる。膜起源としては、ER、葉緑体、ゴルジ体、液胞などが挙げられる。
正確な複製機構は不明ですが、マイナス鎖RNA中間体が関与し、ウイルスと宿主タンパク質の両方を必要とします。複製複合体中に検出されるウイルスタンパク質には、HC-Pro、P3、6K1、6K2、CI、VPg、NIa-Pro、NIbなどがあります。[39]複製小胞に存在する宿主因子には、 eIF4Aやいくつかの熱ショックタンパク質などがあります。
細胞間移動
ほとんどの植物ウイルスと同様に、ポティウイルスは、原形質連絡を介して1つの植物細胞から別の細胞に移動するように進化しました。しかし、タバコモザイクウイルスなどのよく研究されている植物ウイルスとは異なり、ポティウイルスは単一の移動タンパク質を持たず、代わりに原形質連絡の周りに移動複合体を組み立てます。[40]この複合体は主に3つのウイルスタンパク質、CI、CP、P3N-PIPOで構成されています。円錐状のCI封入体は、ポティウイルス感染の初期段階でP3N-PIPOによって原形質連絡に固定されます。これにより、封入体はウイルス粒子またはウイルスRNA-CP複合体のいずれかを原形質連絡に送り込むことができます。複製小胞も移動複合体にリクルートされるため、複製と移動は連動していることが示唆されます。複製小胞は、共有P3Nドメインを介してCIとP3の両方と相互作用するP3N-PIPOによってリクルートされます。[14] P3と6K2の相互作用により、複製小胞が移動複合体に固定される。
進化
ポティウイルスは6,600年から7,250年前に進化しました。[41] [42]ユーラシア南西部または北アフリカで進化したと考えられています。推定される変異率は、 1部位あたり年間約1.15 × 10 -4ヌクレオチド置換です。 [要出典]
地理的分布
オーストラリアへの農業導入は18世紀に行われました。この導入には植物病原体も含まれていました。オーストラリアでは38種のポティウイルスが分離されています。そのうち18種はオーストラリアでのみ発見されており、オーストラリア固有のウイルスと考えられています。残りの20種は農業とともに導入されたと考えられています。[要出典]
診断
歴史的に、ポティウイルスの診断は、感染植物細胞中の様々なタンパク質封入体の検出に依存していました。これらは、細胞質または核内に結晶として、あるいは不定形のX体、膜状体、ウイロプラズム、あるいは風車として出現することがあります。[43]封入体には(種によって)ビリオンが含まれる場合と含まれない場合があります。[要出典]これらの封入体は、オレンジグリーン(タンパク質染色)で染色した感染植物組織の葉片を光学顕微鏡で観察できますが、アズールA(核酸染色)では観察できません。 [44] [45] [46]
現代の検出方法は主に逆転写PCRに依存している。[47]
分類学
ポティウイルスには以下の種が含まれる: [2]
- P. achyranthisアキランテスウイルスA
- P. adiurisロバランウイルスA
- P. algeriaenseアルジェリアスイカモザイクウイルス
- P. alliumagrestis野生タマネギ無症状ウイルス
- P. almeidi Alternanthera軽度モザイクウイルス
- P. alstromeriaeアルストロメリアモザイクウイルス
- P. amaranthiアマランサス葉斑ウイルス
- P. アンペロプラシネギ黄縞ウイルス
- P.アネモネ アネモネモザイクウイルス
- P. angelicaeアンジェリカウイルスY
- P. apii セリ科ウイルスY
- P. apiumtessellatiセロリモザイクウイルス
- P. arachidisピーナッツ斑紋ウイルス
- P. araojiae アロウジア モザイク ウイルス
- P. arracachaeアラカチャ斑点ウイルス
- P. artichokis中国アーティチョークモザイクウイルス
- P. ascaloniaeエシャロットイエローストライプウイルス
- P. ascaloniavirgaeネギモザイクウイルス
- P. ashitabaeアシタバモザイクウイルス
- P. asparagiアスパラガスウイルス1
- P. アツベロシジャガイモ ウイルス A およびタマリロ モザイク ウイルス
- P. バルバセネンセバルバセナ ウイルス Y
- P. basellaeバセラ・ルゴースモザイクウイルスとピースリリーモザイクウイルス
- P. Batatatentisサツマイモ潜伏ウイルス
- P. batatamaculaeサツマイモ軽度斑点ウイルス
- P. batataplumeiサツマイモ羽毛状斑点ウイルス
- P. begoniaeベゴニア花壊しウイルス
- P. betaceumビートモザイクウイルス
- P. betaciタマリロ葉奇形ウイルス
- P. ビデンシア ビデンス モザイク ウイルス
- P. bidenstessellatiバイデンス斑点ウイルス
- P. brugmansiaeブルグマンシアモザイクウイルス
- P. calistephiカリステフス斑点ウイルス
- P. callanthis Calanthe軽度モザイクウイルス
- P. cannaeカンナ黄条ウイルス
- P. capsianuliチリリングスポットウイルス
- P. capsiflaviトウガラシ黄色モザイクウイルス
- P. capsimaculaeペッパーモットルウイルス
- P. capsiseverumペッパー重度モザイクウイルス
- P. capsivenaeトウガラシ葉脈斑紋ウイルス
- P. capsivenamaculaeチリ脈斑点ウイルス
- P. caricaeパパイヤ葉歪曲モザイクウイルス
- P. carotaeニンジンウイルスY
- P. carotatenuifoliニンジン薄葉ウイルス
- P. caryaeピーカンモザイク関連ウイルス
- P. catharantessellati Catharanthus モザイク ウイルス
- P. cebatataeサツマイモウイルス C
- P. cepaeタマネギ黄矮ウイルス
- P. ceratobii Ceratobiumモザイクウイルス
- P. chamaescillaeブルースクイルウイルスA
- P. chichoriiエンダイブ壊死性モザイクウイルス
- P. citrulliスイカモザイクウイルス
- P. citrullimoroccenseモロッコスイカモザイクウイルス
- P. citrullufolimaculaeスイカ葉斑紋ウイルス
- P. clitoriaeクリトリアウイルスY
- P. cliviaflavilineaeクンシラン黄縞ウイルス
- P. colchiciメドウサフラン破壊ウイルス
- P. ツユクサツユクサ モザイク ウイルス
- P. cordophaniスーダンスイカモザイクウイルス
- P.costusコスタスストライプモザイクウイルス
- P. crociサフラン潜伏ウイルス
- P. cucurbitaeウリ科静脈バンディング ウイルス
- P. cucurbitaflavitesselatiズッキーニ黄斑モザイクウイルス
- P. cynanchi Keunjorongモザイクウイルス
- P. cypripedii Cypripedium ウイルス Y
- P. cyrtanthi Cyrtanthus elatus ウイルス A
- P. dactylisコックフット条線ウイルス
- P. daphnisミジンコモザイクウイルス
- P. dasheenisダシーンモザイクウイルスとバニラモザイクウイルス
- P. daturaeチョウセンアサガオ靴紐ウイルス
- P. dendrobiiデンドロビウムクロロティックモザイクウイルス
- P. dianthiカーネーション葉脈斑紋ウイルス
- P. dioscoreaeヤマノイモモザイクウイルス
- P. デュオバタエサツマイモ ウイルス 2
- P. esculentinecrosisトマト壊死性矮小ウイルス
- P. eucharaeアマゾンユリモザイクウイルス
- P. euphorbiaeユーフォルビアリングスポットウイルス
- P. fountaingrassiペニセタム・アロペキュロイデスモザイクウイルス
- P. freesiaeフリージアモザイクウイルス
- P. fritillariaeヒメフクロモモンガウイルスY
- P. gebatataeサツマイモウイルス G
- P. gladioliグラジオラスモザイクウイルス
- P. gloriosaeグロリオサ ストライプ モザイク ウイルス
- P. glycitessellatiダイズモザイクウイルス
- P. gomphocarphiゴンフォカルプスモザイクウイルス
- P. habenariaeハベナリアモザイクウイルス
- P. halapensisジョンソングラスモザイクウイルス
- P. hardenbergiaeハーデンベルギアモザイクウイルス
- P. heliannulabisヒマワリ輪紋病ウイルス
- P. helichloromaculaeヒマワリクロロティックモットルウイルス
- P. helitenuitessellatiヒマワリマイルドモザイクウイルス
- P. helitesellatiヒマワリモザイクウイルス
- P. henbanisヒヨスモザイクウイルス
- P. hibbertiaeヒベルティアウイルスY
- P. hiemalisdaphnisダフネ ウイルス Y
- P. hippeastri Hippeastrumモザイクウイルス
- P. hyacinthiヒヤシンス モザイク ウイルス
- P. impatiensisインパチェンス花壊ウイルス
- P. irisアヤメ フルバ モザイク ウイルス
- P. iriseverumアイリス重症モザイクウイルス
- P. iristenuisアイリスマイルドモザイクウイルス
- P. jasminiジャスミンウイルスT
- P. kalanchoesカランコエ モザイク ウイルス
- P. konjacコンニャクモザイクウイルス
- P. lactucae レタスモザイクウイルス
- P. lactucaitalicenseレタスイタリアンネクロティックウイルス
- P. lilimaculaeユリ斑点ウイルス
- P. lupinusルピナスモザイクウイルス
- P. lycorsis Lycoris 軽度斑点ウイルス
- P. malvaeアマルバ静脈除去ウイルス
- P. melongenaeアフリカナスモザイクウイルス
- P. melozonati野生メロンバンディングウイルス
- P.ミラビリスミラビリスクリンクルモザイクウイルス
- P. ミスカンティMiscanthus sinensis モザイク ウイルス
- P. morindatescellatiノニ モザイク ウイルス
- P. muricati野生ジャガイモモザイクウイルス
- P. musaeバナナ苞モザイク ウイルス
- P. narcissusナルシサス黄条ウイルス
- P. narcissusdegenerisナルシサス変性ウイルス
- P. narcissuslineaeナルキッソス晩期黄化ウイルス
- P. nerinisネリネ黄縞ウイルス
- P. nicotianainsculpentisタバコエッチウイルス
- P. nicotianamaculaeタバコモスクアドウイルス
- P. nicotianavenamaculaeタバコ葉脈斑点ウイルス
- P. nicotianavenaobscurumタバコ葉脈縞状モザイクウイルス
- P. nippodioscoreaeヤムイモモザイクウイルス
- P. nothoscordiノトスコルダムモザイクウイルス
- P. orionspassiflorae東アジアのトケイソウ ウイルス
- P. オルニソガリオルニソガラム ウイルス 2
- P. ornithogalitessellatiオルニソガラムストライプモザイクウイルス
- P. pachyrhizusヤンベアンモザイクウイルス
- P. panax PanaxウイルスY
- P. papayanuliパパイヤリングスポットウイルス
- P. parisパリウイルス1
- P. parisnecrosisパリモザイク壊死ウイルス
- P. passifloradistorti東アジアのトケイソウ歪みウイルス
- P.トケイソウパッションフルーツ木質ウイルス
- P. passifloraflaviトケイソウ白化症ウイルス
- P. passiflorafricanseウガンダ トケイソウ ウイルス
- P. passifloramaculaeパッションフルーツ ベトナム ウイルス
- P.トケイソウパシフローラ ウイルス Y
- P. pastinacaeパースニップモザイクウイルス
- P. ペニセティペニセタム モザイク ウイルス
- P. pepoズッキーニ黄斑ウイルス
- P. peporesticulaeズッキーニシューストリングウイルス
- P. pepotigrisズッキーニティグレモザイクウイルス
- P. perulycopersiciペルートマトモザイクウイルス
- P. pfaffiaeパフィアモザイクウイルス
- P. phaseoli豆類モザイク壊死ウイルス
- P. phaseoluteumインゲンマメ黄斑モザイクウイルスと白ルピナスモザイクウイルス
- P. phaseovulgarisインゲン豆モザイクウイルスとピーナッツストライプウイルス
- P. phytolaccaeヨウシュヤマゴボウモザイクウイルス
- P. pisumsemenportatiエンドウ種子伝染性モザイクウイルス
- P. platycodonisキキョウ軽度斑点ウイルス
- P. pleioblasti Pleioblastusモザイクウイルス
- P. pleionisプレオネ花破壊ウイルス
- P. plumpoxiプラムポックスウイルス
- P. polianthis Tuberose軽度モザイクウイルス
- P. polianthismaculaeチューベローズマイルドモットルウイルス
- P. polygonatiタデモザイク随伴ウイルス1
- P.ラナンキュリラナンキュラスモザイクウイルス
- P. ranunculideformationisラナンキュラス葉変形ウイルス
- P. ranunculitenuisラナンキュラスマイルドモザイクウイルス
- P. rapae カブモザイクウイルス
- P. rhopalanthiロパランテウイルスY
- P. rutae地中海ルダ ウイルス
- P.サッカリサトウキビモザイクウイルス
- P. sarcochiliサルコキルスウイルスY
- P. schizanthi蝶花モザイクウイルス
- P. scorzaureumスコルツネラ ウイルス A
- P. sorghitessellatiソルガムモザイクウイルス
- P. spiranthesisスピランテスモザイクウイルス3
- P. streptopiねじれ茎萎縮条斑ウイルス
- P. suaveolensブルグマンシア・スアベオレンス斑点ウイルス
- P. tagetisマリーゴールドモザイクウイルス
- P. telfairiaeテルフェアリアモザイクウイルス
- P. telosmaeテロスマモザイクウイルス
- P.テトラパリスパリポティウイルス4
- P. thevetiaeテベティア白斑ウイルス
- P. thladiatessellati Thladiantha dubiaモザイクウイルス
- P. thurnbergiiツンベルグヒョウモンモザイクウイルス
- P. torvi野生トマトモザイクウイルス
- P. tradescantiaeトレードスキャンティア マイルド モザイク ウイルス
- P. trifoliiクローバー黄脈ウイルス
- P. trompetaeコロンビアチョウセンアサガオウイルス
- P. tropaeoliマシュアウイルスY
- P. tuberosiflaviジャガイモ黄斑ウイルス
- P. tulipadefractumチューリップブレイキングウイルス
- P. tulipatessellatiチューリップモザイクウイルス
- P. vallotae Vallota モザイク ウイルス
- P. vanillaeバニラ歪曲モザイクウイルス
- P. verbenaeバーベナウイルスY
- P. vetuberosiジャガイモウイルスV
- P. vignaeササゲアブラムシ媒介モザイクウイルス
- P. wisteriaeウィステリア葉脈モザイクウイルス
- P. yamplacidumヤム軽度モザイクウイルス
- P. yamtesselatiヤムモザイクウイルス
- P. yidiurisディウリスウイルスY
- P. yililiiユリ黄色モザイクウイルス
- P. yiornithogaliオルニソガラム ウイルス 3
- P. yipleionisプレオネウイルスY
- P. yituberosi ジャガイモウイルスY
- P. zantedeschiaeオランダカイウ潜在ウイルス
- P. zantedeschiatenuisザンテデスキア マイルド モザイク ウイルス
- P. zeananusトウモロコシ萎縮モザイクウイルス
- P. zeatessellatiトウモロコシモザイクウイルスとイランジョンソングラスモザイクウイルス
さらに4つのウイルスが以前はこの属の種として分類されていましたが、遺伝子配列情報が不足していたため廃止されました。[48]
- ササゲ緑脈帯ウイルス
- 落花生眼斑ウイルス
- ヘレニウムウイルスY
- トロペオラムモザイクウイルス
種群
ポティウイルスは1992年にさらにPVY、SCMV、BYMV、BCMVの種群に分類されました。2010年にギブスとオオシマは、同じ4つのグループに加えて、BtMV、ChVMV、DaMV、OYDV、PRSV、TEV、TuMVといういくつかの新しいグループを含む、より広範な分子系統樹を作成しました。 [42]
PVY
ジャガイモウイルスY属の基準種を含む16種を含む。主な宿主は、ナス科9種、アマランサス科3種、キク科3種、ユリ科1種、アマリリス科1種である。[42]
参考文献
- ^ abcde 井上=永田 AK、ジョーダン R、クロイツェ J、リー F、ロペス=モヤ JJ、マキネン K、他。 (2022 年 5 月)。 「ICTV ウイルス分類プロファイル: Potyviridae 2022」。一般ウイルス学ジャーナル。103 (5) 001738.土井:10.1099/jgv.0.001738。hdl : 10568/130320。PMID 35506996。S2CID 248515288 。
- ^ ab 「ウイルス分類:2020年版」。国際ウイルス分類委員会(ICTV)。2021年3月。 2021年5月21日閲覧。
- ^ ゴメスMM、デメロ・ヴォロトンE、アサンドリIR、ペイルーM、クリスティーナJ (2020年9月)。 「ジャガイモウイルス Y 非組換え株におけるコドン使用バイアスの分析」。ウイルス研究。286 198077.土井:10.1016/j.virusres.2020.198077。PMID 32619560。S2CID 220335898 。
- ^ Chung BY, Miller WA, Atkins JF, Firth AE (2008年4月). 「ポティウイルス科における重複必須遺伝子」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 105 (15): 5897– 5902. Bibcode :2008PNAS..105.5897C. doi : 10.1073/pnas.0800468105 . PMC 2311343. PMID 18408156 .
- ^ ロダミランズ B、ヴァリ A、ミンゴット A、サン レオン D、バウルコム D、ロペス モヤ JJ、ガルシア JA (2015 年 7 月)。サイモン A (編)。 「ポティウイルス科の植物ウイルスにおけるフレームシフト遺伝子産物の産生機構としてのRNAポリメラーゼスリッページ」。ウイルス学ジャーナル。89 (13): 6965–6967。土井:10.1128/JVI.00337-15。PMC 4468506。PMID 25878117。
- ^ Olspert A, Chung BY, Atkins JF, Carr JP, Firth AE (2015年8月). 「ポジティブセンスRNAウイルス科ポティウイルスにおける転写ずれ」. EMBO Reports . 16 (8): 995– 1004. doi :10.15252/embr.201540509. PMC 4552492. PMID 26113364 .
- ^ Untiveros M, Olspert A, Artola K, Firth AE, Kreuze JF, Valkonen JP (2016年9月). 「新規サツマイモポティウイルスのオープンリーディングフレーム(ORF)はポリメラーゼスリッページを介して発現し、RNAサイレンシングを抑制する」. Molecular Plant Pathology . 17 (7): 1111– 1123. doi :10.1111/mpp.12366. PMC 4979677. PMID 26757490 .
- ^ abcd Pasin F, Simón-Mateo C, García JA (2014年3月). 「P1プロテアーゼの高可変アミノ末端はポティウイルスの複製と宿主防御反応を調節する」. PLOS Pathogens . 10 (3) e1003985. doi : 10.1371/journal.ppat.1003985 . PMC 3946448. PMID 24603811 .
- ^ Verchot J, Carrington JC (1995年6月). 「ポティウイルスP1プロテアーゼがゲノム増幅の補助因子としてトランス機能する証拠」. Journal of Virology . 69 (6): 3668– 3674. doi :10.1128/jvi.69.6.3668-3674.1995. PMC 189082. PMID 7745715 .
- ^ Pollari M, De S, Wang A, Mäkinen K (2020年10月). 「ポティウイルスサイレンシング抑制因子HCProは宿主ARGONAUTE1をリクルートし、プロウイルス機能に利用する」. PLOS Pathogens . 16 (10) e1008965. doi : 10.1371/journal.ppat.1008965 . PMC 7575100. PMID 33031436 .
- ^ Pirone TP, Blanc S (1996年9月). 「植物ウイルスのヘルパー依存性ベクター伝播」. Annual Review of Phytopathology . 34 (1): 227– 247. doi :10.1146/annurev.phyto.34.1.227. PMID 15012542.
- ^ Valli AA, Gallo A, Rodamilans B, López-Moya JJ, García JA (2018年3月). 「ポティウイルス科由来のHCPro:あらゆるウイルスが欲しがる、うらやましいマルチタスクヘルパーコンポーネント」. Molecular Plant Pathology . 19 (3): 744– 763. doi :10.1111/mpp.12553. PMC 6638112. PMID 28371183 .
- ^ Cui X, Yaghmaiean H, Wu G, Wu X, Chen X, Thorn G, Wang A (2017年10月). 「カブモザイクウイルスP3タンパク質のC末端領域は、P3をウイルス複製複合体に標的化することでウイルス感染に必須である」. Virology . 510 : 147–155 . doi :10.1016/j.virol.2017.07.016. PMID 28735115.
- ^ ab Chai M, Wu X, Liu J, Fang Y, Luan Y, Cui X, et al. (2020年3月). Simon AE (編). 「P3N-PIPOは共有N末端ドメインを介してP3と相互作用し、細胞間移動のためにウイルス複製小胞をリクルートする」. Journal of Virology . 94 (8). doi :10.1128/JVI.01898-19. PMC 7108826. PMID 31969439 .
- ^ Sorel M, Garcia JA, German-Retana S (2014年3月). 「ポティウイルス科の円筒状封入体ヘリカーゼ:重要な多機能タンパク質」. Molecular Plant-Microbe Interactions . 27 (3): 215– 226. doi : 10.1094/MPMI-11-13-0333-CR . PMID 24405034.
- ^ Mann KS, Sanfaçon H (2019年1月). 「植物プラス鎖RNAウイルスプロテアーゼのレパートリー拡大」.ウイルス. 11 (1): 66. doi : 10.3390/v11010066 . PMC 6357015. PMID 30650571 .
- ^ Gong YN, Tang RQ, Zhang Y, Peng J, Xian O, Zhang ZH, 他 (2020年2月21日). 「ペッパーモットルウイルスがコードするNIaプロテアーゼタンパク質は病原性決定因子であり、ニコチアナ・ベンサミアナのDNAメチル化を解除する」. Frontiers in Microbiology . 11 : 102. doi : 10.3389/fmicb.2020.00102 . PMC 7047827. PMID 32153517 .
- ^ Koonin EV , Wolf YI, Nagasawa K, Dolja VV (2008年12月). 「ピコルナ様ウイルスの進化のビッグバンは、真核生物スーパーグループの放散よりも先行していた」. Nature Reviews. Microbiology . 6 (12): 925– 939. doi : 10.1038/nrmicro2030 . PMID 18997823. S2CID 205497478.
- ^ Walter J, Barra A, Doublet B, Céré N, Charon J, Michon T (2019年4月). 「本質的に無秩序なポティウイルスタンパク質VPg、翻訳開始因子eIF4E、およびそれらの二成分複合体の流体力学的挙動」. International Journal of Molecular Sciences . 20 (7): 1794. doi : 10.3390/ijms20071794 . PMC 6479716. PMID 30978975 .
- ^ Léonard S, Plante D, Wittmann S, Daigneault N, Fortin MG, Laliberté JF (2000年9月). 「ポティウイルスVPgと真核生物翻訳開始因子4Eの複合体形成はウイルスの感染性と相関する」. Journal of Virology . 74 (17): 7730– 7737. doi :10.1128/jvi.74.17.7730-7737.2000. PMC 112301. PMID 10933678 .
- ^ Wang A (2015年8月4日). 「ウイルス-植物相互作用の分子ネットワークの解明:宿主因子の複雑な役割」Annual Review of Phytopathology . 53 (1): 45– 66. doi : 10.1146/annurev-phyto-080614-120001 . PMID 25938276.
- ^ Shen W, Shi Y, Dai Z, Wang A (2020年1月). 「ポティウイルスのRNA依存性RNAポリメラーゼNIbは、ウイルス感染において多機能かつ対照的な役割を果たす」.ウイルス. 12 (1): 77. doi : 10.3390/v12010077 . PMC 7019339. PMID 31936267 .
- ^ Cui H, Wang A (2016年5月). Simon A (編). 「プラムポックスウイルス6K1タンパク質はウイルス複製に必須であり、感染初期段階でウイルス複製複合体を標的とする」. Journal of Virology . 90 (10): 5119– 5131. doi :10.1128/JVI.00024-16. PMC 4859702. PMID 26962227 .
- ^ Laliberté JF, Sanfaçon H (2010年7月1日). 「植物ウイルス感染時の細胞リモデリング」Annual Review of Phytopathology 48 ( 1): 69– 91. doi :10.1146/annurev-phyto-073009-114239. PMID 20337516.
- ^ Wei T, Wang A (2008年12月). 「植物ポティウイルスの複製のための細胞質膜小胞の生合成は、COPIおよびCOPII依存的に小胞体出口部位で起こる」. Journal of Virology . 82 (24): 12252– 12264. doi :10.1128/JVI.01329-08. PMC 2593340. PMID 18842721 .
- ^ González R, Wu B, Li X, Martínez F, Elena SF (2019年4月). Wayne M (編). 「変異誘発スキャンによるタバコエッチポティウイルス膜結合型6K2タンパク質の進化的制約の解明」. Genome Biology and Evolution . 11 (4): 1207– 1222. doi :10.1093/gbe/evz069. PMC 6482416. PMID 30918938 .
- ^ Wei T, Zhang C, Hong J, Xiong R, Kasschau KD, Zhou X, et al. (2010年6月). Manchester M (編). 「ポティウイルスの細胞間移動のための原形質連絡における複合体の形成は、ウイルスタンパク質P3N-PIPOによって媒介される」. PLOS Pathogens . 6 (6) e1000962. doi : 10.1371/journal.ppat.1000962 . PMC 2891837. PMID 20585568 .
- ^ Cheng G, Yang Z, Zhang H, Zhang J, Xu J (2020年3月). 「PCaP1と相互作用するレモリンはカブモザイクウイルスの細胞間移動を阻害するが、VPgによって拮抗される」. The New Phytologist . 225 (5): 2122– 2139. Bibcode :2020NewPh.225.2122C. doi : 10.1111/nph.16285 . PMID 31657467. S2CID 204948140.
- ^ Rocher M, Simon V, Jolivet MD, Sofer L, Deroubaix AF, Germain V, et al. (2022年3月). 「StREM1.3 REMORINタンパク質はN. benthamianaにおけるポティウイルスの細胞間移動においてアゴニスト的な役割を果たす」.ウイルス. 14 (3): 574. doi : 10.3390/v14030574 . PMC 8951588. PMID 35336981 .
- ^ クエスタ R、ユステ=カルボ C、ジル=カルトン D、サンチェス F、ポンツ F、ヴァジェ M (2019 年 10 月)。 「カブモザイクウイルスとそのウイルス様粒子の構造」。科学的報告書。9 (1): 15396。ビブコード:2019NatSR...915396C。土井:10.1038/s41598-019-51823-4。PMC 6817885。PMID 31659175。
- ^ ケジャール A、カヴチッチ L、ポラーク M、ノヴァーチェク J、グティエレス=アギーレ I、ジニダリッチ MT、他。 (2019年7月)。 「ジャガイモウイルスYコートタンパク質のマルチタスク性の構造的基礎」。科学の進歩。5 (7) eaaw3808。Bibcode :2019SciA....5.3808K。土井:10.1126/sciadv.aaw3808。PMC 6636993。PMID 31328164。
- ^ Martínez-Turiño S, García JA (2020年1月). 「ポティウイルス外被タンパク質とゲノムRNA:ビリオンの組み立てとその他を導く驚くべき連携」. Kielian M, Mettenleiter TC, Roossinck MJ (編).ウイルスの組み立てと出口経路. ウイルス研究の進歩. 第108巻. アカデミック・プレス. pp. 165– 211. doi :10.1016/bs.aivir.2020.09.001. ISBN 9780128207611. PMID 33837716. S2CID 224990458.
- ^ Pasin F, Daròs JA, Tzanetakis IE (2022年7月). 「ポティウイルス科の進化放散におけるプロテオーム拡大」. FEMS Microbiology Reviews . 46 (4) fuac011. doi :10.1093/femsre/fuac011. PMC 9249622. PMID 35195244 .
- ^ Gadhave, KR; Gautam, S; Rasmussen, DA; Srinivasan, R (2020年7月17日). 「ポティウイルスのアブラムシによる伝播:植物感染性RNAウイルス属の中で最大規模」.ウイルス. 12 (7): 773. doi : 10.3390/v12070773 . ISSN 1999-4915. PMC 7411817. PMID 32708998 .
- ^ Simmons, HE; Munkvold, GP (2014), Gullino, ML; Munkvold, Gary (eds.) 「Potyviridaeにおける種子伝染」、種子と植物繁殖材料の健康に関する世界的展望、ドルドレヒト:Springer Netherlands、pp. 3– 15、doi :10.1007/978-94-017-9389-6_1、ISBN 978-94-017-9388-9、 2023年8月16日閲覧
- ^ Mehle, N.; Gutiérrez-Aguirre, I.; Prezelj, N.; Delić, D.; Vidic, U.; Ravnikar, M. (2014年2月15日). 「ジャガイモYウイルス、ペピーノモザイクウイルス、およびジャガイモ紡錘体ウイロイドの水中における生存と伝播」.応用環境微生物学. 80 (4): 1455– 1462. Bibcode :2014ApEnM..80.1455M. doi :10.1128/AEM.03349-13. ISSN 0099-2240. PMC 3911042. PMID 24334672 .
- ^ ab Jaramillo-Mesa, Helena; Rakotondrafara, Aurélie M. (2023年10月1日). 「すべての卵を一つのバスケットに:ポティウイルス感染はキャップ非依存的な単一の翻訳イベントでどのように制御されるか」. Seminars in Cell & Developmental Biology . 特集号:植物病原体と疾患感受性. 148–149 : 51–61 . doi : 10.1016/j.semcdb.2022.12.011 . ISSN 1084-9521. PMID 36608998. S2CID 255728197.
- ^ Wei, Taiyun; Huang, Tyng-Shyan; McNeil, Jamie; Laliberté, Jean-François; Hong, Jian; Nelson, Richard S.; Wang, Aiming (2010年1月15日). 「植物ポティウイルス複製における小胞体と葉緑体の連続的リクルートメント」. Journal of Virology . 84 (2): 799– 809. doi :10.1128/JVI.01824-09. ISSN 0022-538X. PMC 2798358. PMID 19906931 .
- ^ Lõhmus, Andres; Varjosalo, Markku; Mäkinen, Kristiina (2016年8月). 「ジャガイモウイルスA感染時に形成される6K2誘導膜構造のタンパク質組成:PVA複製複合体プロテオーム」. Molecular Plant Pathology . 17 (6): 943– 958. doi :10.1111/mpp.12341. PMC 6638329. PMID 26574906 .
- ^ Wang, Aiming (2021年6月). 「植物ウイルスの細胞間移動における原形質連絡:ポティウイルスに関する最新の知見」 . Current Opinion in Virology . 48 : 10–16 . doi :10.1016/j.coviro.2021.03.002. PMID 33784579. S2CID 232431891.
- ^ Gibbs AJ, Ohshima K, Phillips MJ, Gibbs MJ (2008年6月). 「ポティウイルスの前史:その初期の拡散は農業の黎明期に起こった」. PLOS ONE . 3 (6) e2523. Bibcode :2008PLoSO...3.2523G. doi : 10.1371/journal.pone.0002523 . PMC 2429970. PMID 18575612 .
- ^ abc Gibbs A, Ohshima K (2010). 「ポティウイルスとデジタル革命」. Annual Review of Phytopathology . 48 (1). Annual Reviews : 205– 223. doi :10.1146/annurev-phyto-073009-114404. PMID 20438367. S2CID 10599654.
- ^ フロリダ州農業消費者サービス局:フロリダ州の植物ウイルスとその封入体—ポティウイルス
- ^ 「ウイルス封入体の検出のための材料と方法」フロリダ大学食品農業科学研究所。2012年2月19日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ Christie, RGおよびEdwardson, JR (1977). Fla Agric. Exp. Stn Monog. No. 9, 150 pp.
- ^ 植物のウイルス感染はどのように診断するのでしょうか? 2012年8月4日アーカイブarchive.today
- ^ Thomson, Darelle; Dietzgen, Ralf G. (1995年8月). 「組織ホモジェナイゼーションを必要とせず、迅速ウイルス放出プロトコルを用いたPCRおよびRT-PCRによるDNAおよびRNA植物ウイルスの検出」 . Journal of Virological Methods . 54 ( 2–3 ): 85–95 . doi :10.1016/0166-0934(95)00022-M. PMID 8530569.
- ^ ワイリー S、アダムス MJ、チャラム C、クロイツェ JF、ロペス=モヤ JJ、大島 K、プラヴィーン S、ラベンシュタイン F、ステンガー DC、ワン A、ゼルビニ FM (2016)。 「ポティウイルス属の3種を創設し、ポティウイルス属の5種を廃止」(PDF) 。2021 年7 月 26 日に取得。
参考文献
- Ward CW, Shukla DD (1991). 「ポティウイルスの分類:現状の問題点と解決策」. Intervirology . 32 (5): 269– 296. doi :10.1159/000150211. PMID 1657820.
- King AM他編 (2012). 「ポティウイルス」.ウイルス分類:ウイルスの分類と命名法:国際ウイルス分類委員会第9回報告書. ロンドン: アカデミック・プレス. pp. 926– 1072. ISBN 978-0123846846. 2014年12月9日閲覧。
外部リンク
- UniProt分類: ポティウイルス
- ウイルスゾーン:ポティウイルス
- ICTV