RNF41

RNF41
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2FZP、2GWF
識別子
エイリアス	RNF41、FLRF、NRDP1、SBBI03、リングフィンガータンパク質41
外部ID	MGI : 1914838 ; HomoloGene : 4226 ; GeneCards : RNF41 ; OMA : RNF41 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 12番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 12q13.3 始める 56,202,179 bp [ 1 ] 終わり 56,221,933 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 10番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 10 D3|10 76.55 cM 始める 1億2824万7526塩基対[ 2 ] 終わり 1億2827万7310bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 ブロードマン領域10 小脳の傍小葉 前頭極 ランゲルハンス島 単球 視床の外側核群 子宮内膜間質細胞 胆嚢 右冠動脈 膝窩動脈 上位の表現 精細管 海馬歯状回顆粒細胞 一次視覚野 精子細胞 上前頭回 心室帯 顆粒球 神経節隆起 吻側回遊流 小脳皮質 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 インターロイキン3受容体結合 エリスロポエチン受容体結合 亜鉛イオン結合 金属イオン結合 タンパク質結合 トランスフェラーゼ活性 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 タンパク質ドメイン特異的結合 受容体チロシンキナーゼ結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 細胞成分 細胞質 細胞質の核周囲領域 小胞体管状ネットワーク 生物学的プロセス MAPKカスケードの調節 外因性アポトーシスシグナル伝達経路 DNA結合転写因子活性の正の調節 タンパク質ポリユビキチン化 活性酸素種の代謝プロセスの調節 オートファジー 細胞移動の負の調節 リンパ球分化の調節 活性酸素種の代謝プロセスの正の調節 タンパク質のユビキチン化 プロテインキナーゼBシグナル伝達の調節 遺伝子発現の調節 プロテアソームによるタンパク質分解プロセス 骨髄細胞分化の調節 細胞極性の確立の調節 細胞集団増殖の負の調節 タンパク質の自己ユビキチン化 アポトーシス過程 ミトファジーの負の制御 タンパク質分解プロセスの正の調節 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10193 67588 アンサンブル ENSG00000181852 ENSMUSG00000025373 ユニプロット Q9H4P4 Q8BH75 RefSeq (mRNA) NM_001242826 NM_005785 NM_194358 NM_194359 NM_001164237 NM_026259 RefSeq（タンパク質） NP_001229755 NP_005776 NP_919339 NP_919340 NP_001157709 NP_080535 場所（UCSC） 12章: 56.2 – 56.22 Mb 10章: 128.25 – 128.28 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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E3ユビキチンタンパク質リガーゼNRDP1は、ヒトではRNF41遺伝子によってコードされる酵素である。^{[ 5 ]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、機能的に異なる様々なタンパク質に存在し、タンパク質間およびタンパク質-DNA相互作用に関与することが知られているRINGフィンガーモチーフを含む。このタンパク質の具体的な機能は未だ解明されていない。2つの異なるアイソフォームをコードする3つの選択的スプライシング転写バリアントが報告されている。^{[ 5 ]}

相互作用

RNF41はUSP8と相互作用することが示されている。^{[ 6 ]}

参照

• 薬指ドメイン

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000181852 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000025373 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 「Entrez遺伝子：RNF41リングフィンガータンパク質41」。
6. ウー X、イェン L、アーウィン L、スウィーニー C、キャラウェイ KL (2004 年 9 月)。「脱ユビキチン化酵素USP8によるE3ユビキチンリガーゼNrdp1の安定化」。モル。細胞。バイオル。24 (17): 7748–57 .土井: 10.1128/MCB.24.17.7748-7757.2004。PMC 506982。PMID 15314180。  

さらに読む

• Cao Z, Wu X, Yen L, Sweeney C, Carraway KL (2007). 「ニューレグリン誘導性ErbB3ダウンレギュレーションは、E3ユビキチンリガーゼNrdp1を介したタンパク質安定性カスケードによって媒介される」 . Mol . Cell. Biol . 27 (6): 2180–8 . doi : 10.1128/MCB.01245-06 . PMC  1820496. PMID  17210635 .
• Avvakumov GV, Walker JR, Xue S, Finerty PJ, Mackenzie F, Newman EM, Dhe-Paganon S (2006). 「ユビキチン特異的プロテアーゼ8（USP8）のアミノ末端二量体形成、NRDP1-ロダネーゼ相互作用、および阻害された触媒ドメインの立体構造」 . J. Biol. Chem . 281 (49): 38061–70 . doi : 10.1074/jbc.M606704200 . PMID  17035239 .
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• Brajenovic M, Joberty G, Küster B, Bouwmeester T, Drewes G (2004). 「ヒトParタンパク質複合体の包括的プロテオーム解析により、相互接続されたタンパク質ネットワークが明らかになった」 . J. Biol. Chem . 279 (13): 12804–11 . doi : 10.1074/jbc.M312171200 . PMID  14676191 .
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外部リンク

• RNF41+タンパク質、+ヒト（米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH））
• UCSC ゲノム ブラウザにおけるRNF41ヒト遺伝子の位置。
• UCSC ゲノム ブラウザにおけるRNF41ヒト遺伝子の詳細。