スマルカ5

ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
スマルカ5
識別子
エイリアスSMARCA5、ISWI、SNF2H、WCRF135、hISWI、hSNF2H、SWI/SNF関連、マトリックス関連、アクチン依存性クロマチン調節因子、サブファミリーa、メンバー5
外部IDオミム: 603375; MGI : 1935129;ホモロジーン: 55764;ジーンカード：SMARCA5; OMA :SMARCA5 - オルソログ
オルソログ
種人間ねずみ
エントレズ

8467

93762

アンサンブル

ENSG00000153147

ENSMUSG00000031715

ユニプロット

O60264

Q91ZW3

RefSeq (mRNA)

NM_003601

NM_053124

RefSeq（タンパク質）

NP_003592

NP_444354

場所（UCSC）4号線: 143.51 – 143.56 MB8章: 81.43 – 81.47 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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SWI/SNF関連マトリックス関連アクチン依存性クロマチン調節因子サブファミリーAメンバー5は、ヒトではSMARCA5遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、ISWIファミリーに属するタンパク質です。このファミリーのメンバーはヘリカーゼ活性とATPase活性を有し、遺伝子周囲のクロマチン構造を変化させることで、特定の遺伝子の転写を制御すると考えられています。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、RNAポリメラーゼIIによるクラスII遺伝子の転写を促進するクロマチンリモデリング・スペーシング因子RSFの構成要素です。このタンパク質は、ショウジョウバエのISWIクロマチンリモデリングタンパク質と配列が類似しています。[6]

相互作用

SMARCA5はRAD21、[7]、ヒストン脱アセチル化酵素2、[7] 、 POLE3、[8] 、 SATB1 [9]、BAZ1Aと相互作用することが示されている。[7] [8] [9] [10] [11]

参考文献

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  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000031715 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ 相原隆、三好裕、小山和、鈴木正、高橋栄、門田正、中村裕 (1998年10月)。 「ショウジョウバエ ISWI の新規ヒト相同体である hSNF2H をコードする SMARCA5 のクローニングとマッピング」。細胞遺伝学と細胞遺伝学。81 ( 3–4 ): 191– 3.土井:10.1159/000015027。PMID  9730600。S2CID 46768416  。
  6. ^ ab "Entrez Gene: SMARCA5 SWI/SNF関連、マトリックス関連、アクチン依存性クロマチン調節因子、サブファミリーa、メンバー5".
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  9. ^ ab Yasui D, Miyano M, Cai S, Varga-Weisz P, Kohwi-Shigematsu T (2002年10月). 「SATB1はクロマチンリモデリングを標的とし、長距離にわたる遺伝子制御を行う」. Nature . 419 (6907): 641–5 . Bibcode :2002Natur.419..641Y. doi :10.1038/nature01084. PMID  12374985. S2CID  25822700.
  10. ^ Bochar DA, Savard J, Wang W, Lafleur DW, Moore P, Côté J, Shiekhattar R (2000年2月). 「ウィリアムズ症候群転写因子に関連するクロマチンリモデリング因子ファミリー」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (3): 1038–43 . Bibcode :2000PNAS...97.1038B. doi : 10.1073/pnas.97.3.1038 . PMC 15513. PMID  10655480 . 
  11. ^ Bozhenok L, Wade PA, Varga-Weisz P (2002年5月). 「WSTF-ISWIクロマチンリモデリング複合体はヘテロクロマチン複製巣を標的とする」. The EMBO Journal . 21 (9): 2231–41 . doi :10.1093/emboj/21.9.2231. PMC 125993. PMID 11980720  . 

さらに読む

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  • Bochar DA, Savard J, Wang W, Lafleur DW, Moore P, Côté J, Shiekhattar R (2000年2月). 「ウィリアムズ症候群転写因子に関連するクロマチンリモデリング因子ファミリー」.米国科学アカデミー紀要. 97 (3): 1038–43 .書誌コード:2000PNAS...97.1038B. doi : 10.1073/pnas.97.3.1038 . PMC  15513. PMID  10655480 .
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  • Strohner R、Nemeth A、Jansa P、Hofmann-Rohrer U、Santoro R、Längst G、Grummt I (2001 年 9 月)。 「NoRC - 哺乳類のISWIを含むクロマチンリモデリングマシンの新規メンバー」。EMBO ジャーナル。20 (17): 4892–900。土井:10.1093/emboj/20.17.4892。PMC  125270。PMID  11532953。
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  • Geiman TM, Sankpal UT, Robertson AK, Chen Y, Mazumdar M, Heale JT, Schmiesing JA, Kim W, Yokomori K, Zhao Y, Robertson KD (2004). 「DNMT3Bと有糸分裂染色体凝縮機構の構成要素を連結する新規DNAメチルトランスフェラーゼ複合体の単離と特性解析」. Nucleic Acids Research . 32 (9): 2716–29 . doi :10.1093/nar/gkh589. PMC 419596.  PMID 15148359  .


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