エンシファー（細菌）
細菌の属

エンシファー
ティプトン酵母エキス寒天培地上のEnsifer fredii USDA257 。
科学的分類 この分類を編集する
ドメイン： 細菌
王国： シュードモナダティ
門: シュードモナドタ
クラス： アルファプロテオバクテリア
注文： ヒポミクロビアレス
家族： 根粒菌科
属: エンシファー・
カシダ、1982年
タイプ種
エンシファー・アダエレンス
カシーダ、1982年
種[18] [19] [20] [21]
  • 「Sinorhizobium abri」小笠原ら。 2003年[1] [2]
  • Ensifer adhaerens Casida 1982 [3]
  • Ensifer alkalisoli Li et al . 2016年
  • Ensifer americanus corrig. (Toledo et al . 2004) Wang et al . 2015 [4]
  • エンシファー・アルボリス （ニックら1999）ヤング2003 [5]
  • 「Ensifer aridi」Le Quéré et al . 2017年[6] [2]
  • 「Ensifer aridi」Rocha et al . 2020年[7] [2]
  • 「Sinorhizobium chiapanecum」Rincón-Rosalesら。 2009年[8]
  • 「エンシファー・コリコラ」ジャンら2017 [2]
  • エンシファー・フレディ （スコラとエルカン 1984）ヤング 2003 [9]
  • Ensifer garamanticus Merabet et al . 2010年[10]
  • エンシファー・グリシニスヤンら2016 [11]
  • 「Sinorhizobium indiaense」小笠原ら。 2003年[1] [2]
  • エンシファー・コスティエンシス （ニックら1999）ヤング2003 [5]
  • Ensifer kummerowiae (Wei et al . 2002) Young 2003 [12]
  • Ensifer medicae (Rome et al . 1996) Young 2003 [13]
  • エンシファー・メリロティ （ダンガード 1926）ヤング 2003 [14]
  • Ensifer mexicanus Lloret et al . 2007年[15]
  • エンサイファー・モレレンシス・ コルリグ。 (Wang et al . 2002) Wang et al . 2002 2015年
  • Ensifer numidicus Merabet et al . 2010年[10]
  • エンシファー・プソラレアエワングら2013 [16]
  • Ensifer saheli (De Lajudie et al . 1994) Young 2003 [14]
    • 共生亜綱アカシア
    • 共生亜綱セスバニアエ
  • Ensifer sesbaniae Wang et al . 2015年[16]
  • Ensifer shofinae Chen et al . 2017年
  • Ensifer sojae Li et al . 2011年[17]
  • Ensifer terangae (De Lajudie et al . 1994) Young 2003 [14]
    • 共生亜綱アカシア
    • 共生亜綱セスバニアエ
同義語[19]
  • シノリゾビウム ・チェンら。 1988年

Ensifer （文献ではシノリゾビウムという同義語 で呼ばれることが多い）は窒素固定細菌（根粒菌）の属であり、そのうち3種（ Ensifer meliloti [ 22] [23] 、 Ensifer medicae [24]、 Ensifer fredii [25] [26]）の配列が決定されている。

語源

属小名エンシファーは、ラテン語の名詞エンシファー（「剣持ち」）に由来する。 [3]シノリゾビウム（Sinorhizobium）は、中世ラテン語の名詞シノ（「中国」）、古典ギリシャ語の名詞リザ（「根」）、そして古典ギリシャ語の名詞ビウム（「生命」）を組み合わせたものである。したがって、シノリゾビウムの属小名は「中国から単離された根粒菌」を意味し、これは近縁属リゾビウム（「根に付随する生命体」）を指す。[18] [9]

固有名詞

Ensiferという名称は1982年に、 Sinorhizobiumという名称は1988年に発表されたため、後者は後のシノニムとみなされ、国際原核生物分類学委員会 (ICSP) の細菌規約 (1990年改訂) の規則により、古い名称 ( Ensifer ) が優先されます。[27] Ensiferの唯一の現存種( Ensifer adhaerens ) をSinorhizobiumに移すよう求める要請に応えて、ICSP の特別小委員会がこの要請を評価するために結成されました。最終的に、Ensifer が優先権を保持し、すべてのSinorhizobium種をEnsifer属に移すことが決定されました。[28] [29]ただし、両方の用語は出版された科学文献で引き続き使用されており、Sinorhizobium の方が一般的です。[30]

推奨されない種

これまでに2種が記載されていましたが、現在は現存する種に再分類されています。Sinorhizobium morelense（現在はEnsifer adhaerens）[27] [31]とSinorhizobium xinjiangense（現在はEnsifer fredii [32] [33] - ただし異論もあります[16] [34]）。

系統発生

現在受け入れられている分類は、命名法上の原核生物名リスト（LPSN）に基づいています。[18] [19]以下の系統樹は全ゲノム解析に基づいています。[35]

エンシファー

エンシファー・アダエレンス

エンシファー・アルボリス

エンシファー・アルカリソリ

エンシファー・ソジェ

エンシファー・サヘリ

エンシファー・アメリカヌス

エンシファー・グリシニス

エンシファー・ショフィナエ

エンシファー・フレディ

アウトグループ

パラリゾビウム

この系統発生は16SリボソームRNAの制約された解析に基づいています。[35]

エンシファー

エンシファー・グリシニス

エンシファー・ショフィナエ

エンシファー・サヘリ

エンシファー・アルカリソリ

エンシファー・ソジェ

エンシファー・アメリカヌス

エンシファー・フレディ

エンシファー・クンメロウィア

エンシファー・シンジアンゲンシス

エンシファー・アルボリス

エンシファー・コスティエンシス

エンシファー・ガラマンティクス

エンシファー・テランガエ

エンシファー・メキシカヌス

エンシファー・モレレンシス

エンシファー・セスバニアエ

エンシファー・アダエレンス

アウトグループ

パラリゾビウム

参考文献

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